More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3085 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_3085  heat shock protein Hsp20  100 
 
 		 139 aa  278  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3431  heat shock protein Hsp20  94.96 
 
 		 139 aa  267  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3423  HSP20 family protein  71.22 
 
 		 139 aa  193  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3388  HSP20 family protein  71.22 
 
 		 139 aa  193  6e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0799527  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0342  HSP20 family protein  70.5 
 
 		 162 aa  192  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.187953  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2427  HSP20 family protein  70.5 
 
 		 139 aa  192  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1203  HSP20 family protein  70.5 
 
 		 139 aa  192  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3427  HSP20 family protein  70.5 
 
 		 139 aa  192  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000520104  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2614  HSP20 family protein  70.5 
 
 		 139 aa  192  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.484892  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6253  heat shock protein Hsp20  65.22 
 
 		 141 aa  185  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6420  heat shock protein Hsp20  65.22 
 
 		 146 aa  184  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6655  heat shock protein Hsp20  65.22 
 
 		 146 aa  184  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2613  Hsp20 family heat-shock protein  62.86 
 
 		 142 aa  179  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000019665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4540  Hsp20 family heat-shock protein  62.86 
 
 		 142 aa  179  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000112582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6092  heat shock protein Hsp20  62.59 
 
 		 135 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2601  Hsp20 family heat-shock protein  64.03 
 
 		 135 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0188281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6389  heat shock protein Hsp20  61.15 
 
 		 135 aa  175  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0663133 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5261  heat shock protein Hsp20  59.71 
 
 		 135 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2810  HSP20 family protein  56.72 
 
 		 131 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0175635  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1571  putative heat shock protein  55.56 
 
 		 133 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.483559  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1471  HSP20 family protein  55.56 
 
 		 133 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43946  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5151  heat shock protein Hsp20  54.74 
 
 		 135 aa  150  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1246  HSP20 family protein  55.56 
 
 		 133 aa  149  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0529  HSP20 family protein  55.56 
 
 		 133 aa  149  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1440  HSP20 family protein  55.56 
 
 		 133 aa  149  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0625  HSP20 family protein  55.56 
 
 		 133 aa  149  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4649  heat shock protein Hsp20  51.8 
 
 		 137 aa  147  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.54341  normal  0.729236 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2397  putative heat shock Hsp20-related protein  58.99 
 
 		 135 aa  144  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0523871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4405  heat shock protein Hsp20  63.55 
 
 		 136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2056  heat shock protein Hsp20  63.96 
 
 		 137 aa  124  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1153  heat shock protein Hsp20  64.49 
 
 		 138 aa  123  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.405022 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1141  heat shock protein Hsp20  63.06 
 
 		 139 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2579  putative low molecular weight heat shock protein, Hsp20-related  48.92 
 
 		 137 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0781  heat shock protein Hsp20  59.81 
 
 		 136 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1262  heat shock protein Hsp20  59.81 
 
 		 136 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142057  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1234  heat shock protein Hsp20  60.95 
 
 		 136 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.308291  normal  0.243977 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1731  HSP20 family protein  45.97 
 
 		 126 aa  114  5e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.13098  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1973  heat shock protein Hsp20  52.34 
 
 		 139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.287455  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3376  heat shock protein Hsp20  47.37 
 
 		 130 aa  112  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2043  putative heat shock protein  46.36 
 
 		 127 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.778686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1324  heat shock protein Hsp20  46.3 
 
 		 195 aa  100  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317374  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3313  heat shock protein, putative  43.93 
 
 		 123 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.257763  normal  0.279554 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3255  heat shock protein Hsp20  41.18 
 
 		 132 aa  95.9  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1174  heat shock protein Hsp20  39.23 
 
 		 139 aa  92.8  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2365  heat shock protein Hsp20  42.06 
 
 		 135 aa  87.4  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.181504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0390  heat shock protein Hsp20  38.4 
 
 		 130 aa  87.4  6e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.833766  normal  0.703561 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2959  heat shock protein Hsp20  37.76 
 
 		 143 aa  84  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.167076 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4462  heat shock protein Hsp20  38.46 
 
 		 132 aa  83.2  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  41.23 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1743  heat shock protein Hsp20  40.95 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.174126  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2409  HSP20 family protein  33.61 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7807  Hsp20 family heat-shock protein  35.24 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00129467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0183  heat shock protein Hsp20  34.45 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0939501  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0891  heat shock protein Hsp20  35.96 
 
 		 137 aa  76.3  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.805469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3666  heat shock protein Hsp20  36.07 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0021013  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0403  heat shock protein Hsp20  36.45 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2642  heat shock protein Hsp20  39.45 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  34.26 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  35.51 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  33.08 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3774  heat shock protein Hsp20  35.25 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  36.84 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0314  heat shock protein Hsp20  34.45 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4669  heat shock protein Hsp20  39.81 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  33.06 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0358  Hsp20-like molecular chaperone  34.48 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  31.53 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  35.38 
 
 		 156 aa  72  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  37.07 
 
 		 146 aa  72  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  37.07 
 
 		 146 aa  72  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  36.11 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3461  heat shock protein Hsp20  32.38 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.798121  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  34.82 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0792  heat shock protein Hsp20  38.32 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.198377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  34.82 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  32.69 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  32.41 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4119  heat shock protein Hsp20  31.73 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303961 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1344  HSP20 family protein  34.91 
 
 		 121 aa  67  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.624294  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  29.46 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  33.91 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0160  heat shock protein Hsp20  38.24 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.248861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0936  heat shock protein Hsp20  31.58 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.172536  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0720  heat shock protein Hsp20  32.38 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00436062  normal  0.512737 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  35.78 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  35.51 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  30.51 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2281  heat shock protein Hsp20  38.18 
 
 		 173 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.78764  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  28.95 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0179  heat shock protein Hsp20  34.62 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  34.19 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  31.09 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  32.69 
 
 		 151 aa  63.5  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4761  heat shock protein Hsp20  35.58 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.735655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3386  heat shock protein Hsp20  35.51 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1219  heat shock protein Hsp20  32.71 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4467  heat shock protein Hsp20  35.58 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  32.14 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>