More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6389 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6389  heat shock protein Hsp20  100 
 
 		 135 aa  270  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0663133 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6092  heat shock protein Hsp20  97.04 
 
 		 135 aa  265  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2601  Hsp20 family heat-shock protein  77.78 
 
 		 135 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0188281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5151  heat shock protein Hsp20  62.96 
 
 		 135 aa  179  9.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2613  Hsp20 family heat-shock protein  63.5 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000019665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4540  Hsp20 family heat-shock protein  63.5 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000112582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4649  heat shock protein Hsp20  62.96 
 
 		 137 aa  178  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.54341  normal  0.729236 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5261  heat shock protein Hsp20  64.39 
 
 		 135 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3085  heat shock protein Hsp20  61.15 
 
 		 139 aa  175  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1571  putative heat shock protein  63.16 
 
 		 133 aa  174  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.483559  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1471  HSP20 family protein  63.16 
 
 		 133 aa  174  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43946  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0529  HSP20 family protein  63.16 
 
 		 133 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0625  HSP20 family protein  63.16 
 
 		 133 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1246  HSP20 family protein  63.16 
 
 		 133 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1440  HSP20 family protein  63.16 
 
 		 133 aa  174  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2810  HSP20 family protein  65.15 
 
 		 131 aa  173  6e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0175635  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3431  heat shock protein Hsp20  58.99 
 
 		 139 aa  169  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6420  heat shock protein Hsp20  58.91 
 
 		 146 aa  163  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6655  heat shock protein Hsp20  58.91 
 
 		 146 aa  163  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6253  heat shock protein Hsp20  58.14 
 
 		 141 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2397  putative heat shock Hsp20-related protein  62.18 
 
 		 135 aa  155  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0523871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3423  HSP20 family protein  58.27 
 
 		 139 aa  151  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3388  HSP20 family protein  58.27 
 
 		 139 aa  151  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0799527  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0342  HSP20 family protein  56.12 
 
 		 162 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.187953  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2427  HSP20 family protein  56.12 
 
 		 139 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3427  HSP20 family protein  56.12 
 
 		 139 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000520104  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2614  HSP20 family protein  56.12 
 
 		 139 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.484892  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1203  HSP20 family protein  56.12 
 
 		 139 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2056  heat shock protein Hsp20  58.82 
 
 		 137 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2579  putative low molecular weight heat shock protein, Hsp20-related  58.39 
 
 		 137 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1141  heat shock protein Hsp20  57.89 
 
 		 139 aa  120  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2043  putative heat shock protein  51.43 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.778686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4405  heat shock protein Hsp20  53.78 
 
 		 136 aa  118  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0781  heat shock protein Hsp20  54.62 
 
 		 136 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1262  heat shock protein Hsp20  54.62 
 
 		 136 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142057  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1153  heat shock protein Hsp20  57.02 
 
 		 138 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.405022 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1234  heat shock protein Hsp20  54.62 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.308291  normal  0.243977 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1973  heat shock protein Hsp20  51.4 
 
 		 139 aa  111  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.287455  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1731  HSP20 family protein  45.76 
 
 		 126 aa  108  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.13098  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3376  heat shock protein Hsp20  47.66 
 
 		 130 aa  105  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1324  heat shock protein Hsp20  43.41 
 
 		 195 aa  104  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317374  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3313  heat shock protein, putative  42.86 
 
 		 123 aa  103  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.257763  normal  0.279554 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3255  heat shock protein Hsp20  42.06 
 
 		 132 aa  95.9  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2365  heat shock protein Hsp20  40.34 
 
 		 135 aa  90.5  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.181504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4462  heat shock protein Hsp20  40 
 
 		 132 aa  87.8  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1743  heat shock protein Hsp20  39.81 
 
 		 132 aa  83.6  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.174126  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2959  heat shock protein Hsp20  39.06 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.167076 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1174  heat shock protein Hsp20  37.39 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0390  heat shock protein Hsp20  36.61 
 
 		 130 aa  81.3  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.833766  normal  0.703561 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0403  heat shock protein Hsp20  37.04 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3461  heat shock protein Hsp20  35.24 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.798121  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0891  heat shock protein Hsp20  37.14 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.805469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7807  Hsp20 family heat-shock protein  32 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00129467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  35.51 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2642  heat shock protein Hsp20  40.38 
 
 		 134 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0792  heat shock protein Hsp20  38.32 
 
 		 117 aa  76.6  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.198377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  36.44 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  36.44 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0358  Hsp20-like molecular chaperone  34.58 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  33.98 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  32.08 
 
 		 163 aa  70.9  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3666  heat shock protein Hsp20  36.79 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0021013  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1344  HSP20 family protein  32.38 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.624294  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  34.21 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3774  heat shock protein Hsp20  36.79 
 
 		 132 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  28.79 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0720  heat shock protein Hsp20  31.43 
 
 		 120 aa  70.1  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00436062  normal  0.512737 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  33.91 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  32.14 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  30.25 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  34.91 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  35.45 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0314  heat shock protein Hsp20  34.58 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  38.74 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0179  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5914  heat shock protein Hsp20  33.87 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0664313  normal  0.562292 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4119  heat shock protein Hsp20  34.95 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303961 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  31.45 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  35.78 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0454  heat shock protein Hsp20  29.7 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  28.44 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5732  hypothetical protein  53.33 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.34005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  33.98 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5151  heat shock protein Hsp20  35.45 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184623  normal  0.32984 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  32.14 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  27.91 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0183  heat shock protein Hsp20  31.9 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0939501  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2063  heat shock protein Hsp20  31.68 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.21571  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0098  heat shock protein Hsp20  37.62 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  31.93 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  31.3 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  30.91 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6187  heat shock protein Hsp20  34.21 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.306682 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  33.03 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2281  heat shock protein Hsp20  36.45 
 
 		 173 aa  63.5  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.78764  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  31.13 
 
 		 151 aa  63.5  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1149  heat shock protein Hsp20  35.51 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1219  heat shock protein Hsp20  35.51 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0609  heat shock protein Hsp20  37 
 
 		 156 aa  63.5  0.0000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.346897  normal  0.0142886 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>