More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4540 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2613  Hsp20 family heat-shock protein  100 
 
 
142 aa  283  4e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000019665  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4540  Hsp20 family heat-shock protein  100 
 
 
142 aa  283  4e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000112582  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2601  Hsp20 family heat-shock protein  67.88 
 
 
135 aa  186  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0188281  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6092  heat shock protein Hsp20  64.96 
 
 
135 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6389  heat shock protein Hsp20  63.5 
 
 
135 aa  179  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0663133 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3431  heat shock protein Hsp20  65 
 
 
139 aa  178  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349992  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3085  heat shock protein Hsp20  62.86 
 
 
139 aa  179  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6420  heat shock protein Hsp20  63.38 
 
 
146 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6655  heat shock protein Hsp20  63.38 
 
 
146 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381902  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6253  heat shock protein Hsp20  62.68 
 
 
141 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3423  HSP20 family protein  62.86 
 
 
139 aa  165  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3388  HSP20 family protein  62.86 
 
 
139 aa  165  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0799527  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0342  HSP20 family protein  62.14 
 
 
162 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.187953  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2427  HSP20 family protein  62.14 
 
 
139 aa  163  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1203  HSP20 family protein  62.14 
 
 
139 aa  163  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5151  heat shock protein Hsp20  60.58 
 
 
135 aa  163  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3427  HSP20 family protein  62.14 
 
 
139 aa  163  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000520104  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2614  HSP20 family protein  62.14 
 
 
139 aa  163  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.484892  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5261  heat shock protein Hsp20  57.14 
 
 
135 aa  161  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1571  putative heat shock protein  58.39 
 
 
133 aa  158  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.483559  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1471  HSP20 family protein  58.39 
 
 
133 aa  158  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43946  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4649  heat shock protein Hsp20  57.14 
 
 
137 aa  157  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.54341  normal  0.729236 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1440  HSP20 family protein  57.66 
 
 
133 aa  157  7e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0529  HSP20 family protein  57.66 
 
 
133 aa  157  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0625  HSP20 family protein  57.66 
 
 
133 aa  157  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1246  HSP20 family protein  57.66 
 
 
133 aa  157  7e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2810  HSP20 family protein  56.93 
 
 
131 aa  153  9e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0175635  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2397  putative heat shock Hsp20-related protein  60.71 
 
 
135 aa  136  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0523871  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2579  putative low molecular weight heat shock protein, Hsp20-related  55 
 
 
137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2043  putative heat shock protein  48.39 
 
 
127 aa  122  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.778686  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2056  heat shock protein Hsp20  57.14 
 
 
137 aa  121  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1141  heat shock protein Hsp20  63.96 
 
 
139 aa  120  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1153  heat shock protein Hsp20  64.49 
 
 
138 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.405022 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4405  heat shock protein Hsp20  55.71 
 
 
136 aa  116  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1731  HSP20 family protein  48.57 
 
 
126 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.13098  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1973  heat shock protein Hsp20  47.33 
 
 
139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.287455  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0781  heat shock protein Hsp20  53.57 
 
 
136 aa  110  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1262  heat shock protein Hsp20  53.57 
 
 
136 aa  110  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142057  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1234  heat shock protein Hsp20  52.86 
 
 
136 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.308291  normal  0.243977 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1324  heat shock protein Hsp20  45.16 
 
 
195 aa  104  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317374  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3376  heat shock protein Hsp20  46.15 
 
 
130 aa  101  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3313  heat shock protein, putative  41.67 
 
 
123 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.257763  normal  0.279554 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3255  heat shock protein Hsp20  42.99 
 
 
132 aa  93.2  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2365  heat shock protein Hsp20  44.04 
 
 
135 aa  92  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.181504  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1174  heat shock protein Hsp20  40.74 
 
 
139 aa  87.4  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2959  heat shock protein Hsp20  35 
 
 
143 aa  86.7  9e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.167076 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4462  heat shock protein Hsp20  41.18 
 
 
132 aa  86.7  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0390  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
130 aa  83.6  7e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.833766  normal  0.703561 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2642  heat shock protein Hsp20  34.75 
 
 
134 aa  83.6  8e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7807  Hsp20 family heat-shock protein  37.04 
 
 
127 aa  81.6  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00129467  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0403  heat shock protein Hsp20  36.19 
 
 
138 aa  79.3  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1743  heat shock protein Hsp20  39.81 
 
 
132 aa  79.3  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.174126  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0891  heat shock protein Hsp20  37.86 
 
 
137 aa  77  0.00000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.805469  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  36.04 
 
 
195 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1344  HSP20 family protein  37.74 
 
 
121 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.624294  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0792  heat shock protein Hsp20  40.38 
 
 
117 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.198377  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3461  heat shock protein Hsp20  35.24 
 
 
122 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.798121  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  37.6 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  35.34 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0183  heat shock protein Hsp20  37.38 
 
 
132 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0939501  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0720  heat shock protein Hsp20  34.29 
 
 
120 aa  70.9  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00436062  normal  0.512737 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2409  HSP20 family protein  34.29 
 
 
132 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  33.64 
 
 
158 aa  70.5  0.000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3666  heat shock protein Hsp20  37.96 
 
 
132 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0021013  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0314  heat shock protein Hsp20  35.51 
 
 
132 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  33.94 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  29.75 
 
 
163 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  35.14 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  39.81 
 
 
151 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  32.8 
 
 
145 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3774  heat shock protein Hsp20  37.04 
 
 
132 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  31.19 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4119  heat shock protein Hsp20  30.58 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303961 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0735  heat shock protein Hsp20  30.84 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000037192  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  32.8 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  32.43 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  31.13 
 
 
150 aa  65.1  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3386  heat shock protein Hsp20  33.02 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0454  heat shock protein Hsp20  32.04 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  31.86 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3091  HSP20 family protein  32.41 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0179  heat shock protein Hsp20  34.86 
 
 
149 aa  64.3  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  32 
 
 
145 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  34.58 
 
 
143 aa  63.5  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
136 aa  62.8  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 
149 aa  63.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4235  heat shock protein Hsp20  36.61 
 
 
143 aa  63.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.283869  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0391  heat shock protein Hsp20  33.96 
 
 
141 aa  63.5  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.854862  normal  0.714918 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0358  Hsp20-like molecular chaperone  34.29 
 
 
134 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  32.23 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  34.43 
 
 
143 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  32.04 
 
 
162 aa  62  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0609  heat shock protein Hsp20  33.06 
 
 
156 aa  62  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.346897  normal  0.0142886 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2042  HSP20 family protein  33.02 
 
 
157 aa  61.2  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  32.38 
 
 
141 aa  61.6  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4669  heat shock protein Hsp20  32.26 
 
 
147 aa  61.2  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  28.3 
 
 
146 aa  61.2  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  32.08 
 
 
139 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0160  heat shock protein Hsp20  33.64 
 
 
147 aa  61.2  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.248861  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3573  heat shock protein Hsp20  32.5 
 
 
144 aa  60.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>