More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1731 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1731  HSP20 family protein  100 
 
 
126 aa  252  2.0000000000000002e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.13098  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2043  putative heat shock protein  55.2 
 
 
127 aa  137  7e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.778686  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3376  heat shock protein Hsp20  52.25 
 
 
130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1324  heat shock protein Hsp20  58.88 
 
 
195 aa  124  5e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317374  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4649  heat shock protein Hsp20  47.45 
 
 
137 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.54341  normal  0.729236 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1973  heat shock protein Hsp20  47.54 
 
 
139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.287455  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3313  heat shock protein, putative  49.59 
 
 
123 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.257763  normal  0.279554 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2601  Hsp20 family heat-shock protein  50.81 
 
 
135 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0188281  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5151  heat shock protein Hsp20  50.43 
 
 
135 aa  117  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0342  HSP20 family protein  56.44 
 
 
162 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.187953  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2427  HSP20 family protein  56.44 
 
 
139 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2614  HSP20 family protein  56.44 
 
 
139 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.484892  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3427  HSP20 family protein  56.44 
 
 
139 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000520104  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3388  HSP20 family protein  56.44 
 
 
139 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0799527  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3423  HSP20 family protein  56.44 
 
 
139 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1203  HSP20 family protein  56.44 
 
 
139 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6253  heat shock protein Hsp20  49.58 
 
 
141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6420  heat shock protein Hsp20  51.85 
 
 
146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6655  heat shock protein Hsp20  51.85 
 
 
146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381902  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3085  heat shock protein Hsp20  45.97 
 
 
139 aa  114  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2613  Hsp20 family heat-shock protein  48.57 
 
 
142 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000019665  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4540  Hsp20 family heat-shock protein  48.57 
 
 
142 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000112582  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2810  HSP20 family protein  49.12 
 
 
131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0175635  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3431  heat shock protein Hsp20  44.35 
 
 
139 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349992  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5261  heat shock protein Hsp20  46.21 
 
 
135 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6092  heat shock protein Hsp20  45.76 
 
 
135 aa  110  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6389  heat shock protein Hsp20  45.76 
 
 
135 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0663133 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1440  HSP20 family protein  45.69 
 
 
133 aa  103  8e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0625  HSP20 family protein  45.69 
 
 
133 aa  103  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0529  HSP20 family protein  45.69 
 
 
133 aa  103  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1246  HSP20 family protein  45.69 
 
 
133 aa  103  8e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1471  HSP20 family protein  44.83 
 
 
133 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43946  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1571  putative heat shock protein  44.83 
 
 
133 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.483559  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4405  heat shock protein Hsp20  52.75 
 
 
136 aa  99.8  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3255  heat shock protein Hsp20  44.74 
 
 
132 aa  99  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2056  heat shock protein Hsp20  51.61 
 
 
137 aa  98.2  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1141  heat shock protein Hsp20  51.61 
 
 
139 aa  98.6  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0781  heat shock protein Hsp20  51.65 
 
 
136 aa  97.1  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1262  heat shock protein Hsp20  51.65 
 
 
136 aa  97.1  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142057  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1234  heat shock protein Hsp20  52.81 
 
 
136 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.308291  normal  0.243977 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2642  heat shock protein Hsp20  45 
 
 
134 aa  95.9  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1153  heat shock protein Hsp20  51.65 
 
 
138 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.405022 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2397  putative heat shock Hsp20-related protein  49.06 
 
 
135 aa  95.9  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0523871  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2579  putative low molecular weight heat shock protein, Hsp20-related  45.65 
 
 
137 aa  92  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2365  heat shock protein Hsp20  44.25 
 
 
135 aa  90.5  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.181504  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0314  heat shock protein Hsp20  40.5 
 
 
132 aa  90.1  9e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1743  heat shock protein Hsp20  43.97 
 
 
132 aa  88.2  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.174126  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2409  HSP20 family protein  37.9 
 
 
132 aa  85.5  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7807  Hsp20 family heat-shock protein  40 
 
 
127 aa  85.9  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00129467  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0403  heat shock protein Hsp20  40.68 
 
 
138 aa  82.8  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0183  heat shock protein Hsp20  37.1 
 
 
132 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0939501  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0358  Hsp20-like molecular chaperone  35.25 
 
 
134 aa  81.6  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4462  heat shock protein Hsp20  37.25 
 
 
132 aa  81.6  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3666  heat shock protein Hsp20  40.32 
 
 
132 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0021013  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3774  heat shock protein Hsp20  39.52 
 
 
132 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0390  heat shock protein Hsp20  37.74 
 
 
130 aa  80.1  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.833766  normal  0.703561 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4119  heat shock protein Hsp20  38 
 
 
149 aa  76.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303961 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  38.46 
 
 
150 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  41.51 
 
 
152 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2301  heat shock protein Hsp20  38.74 
 
 
142 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46681  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  38 
 
 
149 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0891  heat shock protein Hsp20  38.89 
 
 
137 aa  75.1  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.805469  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0925  heat shock protein Hsp20  35.83 
 
 
134 aa  74.3  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0720  heat shock protein Hsp20  36.61 
 
 
120 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00436062  normal  0.512737 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2959  heat shock protein Hsp20  36.89 
 
 
143 aa  72  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.167076 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  34.62 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1174  heat shock protein Hsp20  34.17 
 
 
139 aa  70.9  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
151 aa  70.1  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  42.45 
 
 
143 aa  70.1  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  35.51 
 
 
136 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  41.12 
 
 
195 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2683  heat shock protein Hsp20  37.74 
 
 
145 aa  68.6  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338339  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0792  heat shock protein Hsp20  32.74 
 
 
117 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.198377  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1537  heat shock protein Hsp20  38.83 
 
 
142 aa  68.6  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2410  HSP20 family protein  36.79 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.731962  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  37.39 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  36.45 
 
 
147 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  35.19 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1730  HSP20 family protein  39.62 
 
 
149 aa  67.4  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.34799  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  37.14 
 
 
148 aa  67.4  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1199  heat shock protein Hsp20  37.39 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.76992  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  39.09 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1344  HSP20 family protein  30.77 
 
 
121 aa  67.4  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.624294  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  38.1 
 
 
145 aa  67  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  33.94 
 
 
152 aa  67  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2325  stress response protein  33.33 
 
 
141 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2035  stress response protein  33.33 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3219  heat shock protein  33.33 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0315  heat shock protein Hsp20  33.02 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1345  stress response protein  33.33 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.260788  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3093  heat shock protein  33.33 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1432  HSP20/alpha crystallin family protein  33.33 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.614633  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3091  HSP20 family protein  34.26 
 
 
122 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1059  stress response protein  33.33 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2321  stress response protein  34.95 
 
 
513 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  34.26 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  31.43 
 
 
146 aa  66.2  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  34.95 
 
 
146 aa  66.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  34.95 
 
 
146 aa  66.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5914  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0664313  normal  0.562292 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>