More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2642 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2642  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
134 aa  268  2e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1743  heat shock protein Hsp20  52.34 
 
 
132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.174126  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2365  heat shock protein Hsp20  52.71 
 
 
135 aa  123  7e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.181504  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0720  heat shock protein Hsp20  47.17 
 
 
120 aa  104  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00436062  normal  0.512737 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2959  heat shock protein Hsp20  39.72 
 
 
143 aa  95.9  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.167076 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1731  HSP20 family protein  45 
 
 
126 aa  95.9  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.13098  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0358  Hsp20-like molecular chaperone  38.81 
 
 
134 aa  93.2  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1174  heat shock protein Hsp20  45.28 
 
 
139 aa  93.2  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4462  heat shock protein Hsp20  38.4 
 
 
132 aa  92.8  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0792  heat shock protein Hsp20  48.08 
 
 
117 aa  91.3  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.198377  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0314  heat shock protein Hsp20  38.26 
 
 
132 aa  89.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1324  heat shock protein Hsp20  43.86 
 
 
195 aa  89  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317374  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7807  Hsp20 family heat-shock protein  41.12 
 
 
127 aa  88.6  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00129467  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2043  putative heat shock protein  42.37 
 
 
127 aa  88.2  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.778686  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5261  heat shock protein Hsp20  41.74 
 
 
135 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1973  heat shock protein Hsp20  40.74 
 
 
139 aa  85.1  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.287455  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4649  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 
137 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.54341  normal  0.729236 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1344  HSP20 family protein  36.54 
 
 
121 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.624294  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3461  heat shock protein Hsp20  39.62 
 
 
122 aa  84.3  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.798121  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3313  heat shock protein, putative  39.42 
 
 
123 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.257763  normal  0.279554 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2613  Hsp20 family heat-shock protein  34.75 
 
 
142 aa  83.6  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000019665  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4540  Hsp20 family heat-shock protein  34.75 
 
 
142 aa  83.6  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000112582  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3774  heat shock protein Hsp20  37.93 
 
 
132 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3666  heat shock protein Hsp20  37.93 
 
 
132 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0021013  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  38.33 
 
 
148 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  39.81 
 
 
143 aa  78.2  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3255  heat shock protein Hsp20  39.47 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  39.81 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0183  heat shock protein Hsp20  34.21 
 
 
132 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0939501  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2409  HSP20 family protein  33.63 
 
 
132 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  35.51 
 
 
146 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6389  heat shock protein Hsp20  40.38 
 
 
135 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0663133 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  40.2 
 
 
149 aa  77  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  38.32 
 
 
143 aa  77  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3431  heat shock protein Hsp20  39.62 
 
 
139 aa  77  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349992  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  39.45 
 
 
144 aa  77  0.00000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6092  heat shock protein Hsp20  39.66 
 
 
135 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  37.38 
 
 
141 aa  77  0.00000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2810  HSP20 family protein  35.83 
 
 
131 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0175635  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  44.04 
 
 
166 aa  77  0.00000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0342  HSP20 family protein  41.18 
 
 
162 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.187953  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2601  Hsp20 family heat-shock protein  39.42 
 
 
135 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0188281  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3388  HSP20 family protein  41.18 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0799527  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3423  HSP20 family protein  41.18 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2427  HSP20 family protein  41.18 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3427  HSP20 family protein  41.18 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000520104  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0529  HSP20 family protein  33.33 
 
 
133 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3085  heat shock protein Hsp20  39.45 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2614  HSP20 family protein  41.18 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.484892  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0625  HSP20 family protein  33.33 
 
 
133 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1203  HSP20 family protein  41.18 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1246  HSP20 family protein  33.33 
 
 
133 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1440  HSP20 family protein  33.33 
 
 
133 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  41.12 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3386  heat shock protein Hsp20  39.81 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1571  putative heat shock protein  32.58 
 
 
133 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.483559  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1471  HSP20 family protein  32.58 
 
 
133 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43946  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  34.75 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  33.63 
 
 
147 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5151  heat shock protein Hsp20  34.85 
 
 
135 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3376  heat shock protein Hsp20  36.29 
 
 
130 aa  73.6  0.0000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  34.95 
 
 
195 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  36.45 
 
 
150 aa  73.6  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4669  heat shock protein Hsp20  38.68 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  36.52 
 
 
147 aa  72  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  34.48 
 
 
142 aa  72.4  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  32.56 
 
 
148 aa  72  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3091  HSP20 family protein  39.42 
 
 
122 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4119  heat shock protein Hsp20  39 
 
 
149 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303961 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  38.74 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0390  heat shock protein Hsp20  37.8 
 
 
130 aa  72  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.833766  normal  0.703561 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  36.19 
 
 
151 aa  71.6  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  40.19 
 
 
176 aa  71.2  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  36.19 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6253  heat shock protein Hsp20  38.18 
 
 
141 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6420  heat shock protein Hsp20  38.18 
 
 
146 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6655  heat shock protein Hsp20  38.18 
 
 
146 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381902  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  31.3 
 
 
147 aa  70.5  0.000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  33.03 
 
 
147 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  37.25 
 
 
146 aa  70.5  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  37.25 
 
 
146 aa  70.5  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  30.97 
 
 
147 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4235  heat shock protein Hsp20  43.18 
 
 
143 aa  70.1  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.283869  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  32.71 
 
 
149 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  31.3 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1568  heat shock protein Hsp20  38.18 
 
 
251 aa  69.3  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.458268 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  34.58 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  35.19 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0735  heat shock protein Hsp20  33.02 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000037192  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2683  heat shock protein Hsp20  34.58 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338339  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2579  putative low molecular weight heat shock protein, Hsp20-related  43.93 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4157  heat shock protein Hsp20  35.58 
 
 
150 aa  70.1  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  34.29 
 
 
151 aa  69.3  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4405  heat shock protein Hsp20  42.45 
 
 
136 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0891  heat shock protein Hsp20  35.78 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.805469  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  36.79 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  34.21 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  34.29 
 
 
151 aa  69.3  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4943  heat shock protein Hsp20  37.14 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0508199 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1920  heat shock protein Hsp20  33.87 
 
 
162 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143113  normal  0.422548 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>