More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1920 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1920  heat shock protein Hsp20  100 
 
 		 162 aa  315  1e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143113  normal  0.422548 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2174  heat shock protein Hsp20  66.25 
 
 		 169 aa  218  3e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.150669  normal  0.4191 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1568  heat shock protein Hsp20  68.59 
 
 		 251 aa  215  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.458268 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1474  heat shock protein Hsp20  49.04 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.242626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3386  heat shock protein Hsp20  47.44 
 
 		 147 aa  137  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1214  molecular chaperone (small heat shock protein)  46.79 
 
 		 260 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.318766  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1528  heat shock protein Hsp20  42.31 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00309172  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4198  heat shock protein Hsp20  37.27 
 
 		 152 aa  97.1  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2049  heat shock protein Hsp20  34.78 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000140473  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  33.11 
 
 		 147 aa  88.2  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  36.05 
 
 		 151 aa  87.8  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  35.42 
 
 		 152 aa  87  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  36.99 
 
 		 147 aa  85.5  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  34 
 
 		 146 aa  85.1  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  34.72 
 
 		 143 aa  85.1  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  31.76 
 
 		 147 aa  84.7  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  35.81 
 
 		 163 aa  84.3  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  34.9 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 		 141 aa  82.8  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  36.55 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  34.48 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0539  heat shock protein Hsp20  31.54 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4119  heat shock protein Hsp20  34.93 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303961 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  38.57 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0143  heat shock protein Hsp20  32.67 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  38.57 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0289  heat shock protein Hsp20  31.85 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0247001  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  34.01 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  34.69 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2683  heat shock protein Hsp20  32.64 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338339  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4023  heat shock protein Hsp20  31.97 
 
 		 147 aa  77  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  31.29 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4061  heat shock protein Hsp20  31.97 
 
 		 147 aa  77  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1983  heat shock protein Hsp20  36.05 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00684856  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  32.88 
 
 		 148 aa  77  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  32.65 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0936  heat shock protein Hsp20  32.89 
 
 		 155 aa  74.3  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.172536  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  29.66 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  34.07 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  30.82 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  30.82 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  29.66 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0463  heat shock protein Hsp20  30.67 
 
 		 166 aa  72.4  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  29.79 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3665  heat shock protein Hsp20  34.93 
 
 		 148 aa  72  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0142367  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  38.83 
 
 		 143 aa  72  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  39.8 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  38.78 
 
 		 189 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  31.08 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1921  heat shock protein Hsp20  40.19 
 
 		 167 aa  71.2  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.985705  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1660  heat shock protein Hsp20  32.81 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.870911  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3773  heat shock protein Hsp20  33.56 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  37.25 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1029  Hsp20/alpha crystallin family protein  32.46 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00339514  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  33.06 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  29.66 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0540  heat shock protein Hsp20  28.97 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  36.43 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0735  heat shock protein Hsp20  32.62 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000037192  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  37.76 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1743  heat shock protein Hsp20  34.96 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.174126  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  38.89 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  35.51 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4812  heat shock protein Hsp20  30.13 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00238667  normal  0.807841 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  37.78 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2642  heat shock protein Hsp20  33.87 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4887  heat shock protein Hsp20  31.33 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  34.72 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1370  small heat shock protein  36.89 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0982961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  33.91 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  31.97 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  34.58 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  31.33 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0008  Hsp  29.66 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  31.33 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  31.63 
 
 		 162 aa  67.4  0.00000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  32.67 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16210  heat shock protein Hsp20  32.17 
 
 		 163 aa  67.4  0.00000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221164  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  34.25 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  31.33 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  31.03 
 
 		 145 aa  67  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0423  heat shock protein Hsp20  31.08 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.943695  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4467  heat shock protein Hsp20  29.33 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4761  heat shock protein Hsp20  29.33 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.735655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0454  heat shock protein Hsp20  31.29 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4380  heat shock protein Hsp20  29.33 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.642417  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  41.58 
 
 		 142 aa  67  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  34.67 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3093  heat shock protein  31.54 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3219  heat shock protein  31.54 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3076  heat shock protein Hsp20  27.92 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1432  HSP20/alpha crystallin family protein  31.54 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.614633  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  33.56 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1292  heat shock protein Hsp20  32.65 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0518729  normal  0.504399 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3448  heat shock protein Hsp20  31.69 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1059  stress response protein  31.54 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2035  stress response protein  31.54 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2657  heat shock protein Hsp20  32.39 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.498697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1345  stress response protein  31.54 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.260788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>