More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1324 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_1324  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
195 aa  382  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317374  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2043  putative heat shock protein  54.17 
 
 
127 aa  128  6e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.778686  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1731  HSP20 family protein  58.33 
 
 
126 aa  125  5e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.13098  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3313  heat shock protein, putative  48.62 
 
 
123 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.257763  normal  0.279554 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6092  heat shock protein Hsp20  44.96 
 
 
135 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2601  Hsp20 family heat-shock protein  46.55 
 
 
135 aa  106  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0188281  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1973  heat shock protein Hsp20  48.21 
 
 
139 aa  105  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.287455  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6389  heat shock protein Hsp20  43.41 
 
 
135 aa  104  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0663133 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4649  heat shock protein Hsp20  45.95 
 
 
137 aa  104  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.54341  normal  0.729236 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2613  Hsp20 family heat-shock protein  46.85 
 
 
142 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000019665  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4540  Hsp20 family heat-shock protein  46.85 
 
 
142 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000112582  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6253  heat shock protein Hsp20  47.2 
 
 
141 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6420  heat shock protein Hsp20  47.2 
 
 
146 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3431  heat shock protein Hsp20  42.4 
 
 
139 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349992  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6655  heat shock protein Hsp20  47.2 
 
 
146 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381902  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0342  HSP20 family protein  50 
 
 
162 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.187953  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3423  HSP20 family protein  50 
 
 
139 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3388  HSP20 family protein  50 
 
 
139 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0799527  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2427  HSP20 family protein  50 
 
 
139 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3427  HSP20 family protein  50 
 
 
139 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000520104  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1203  HSP20 family protein  50 
 
 
139 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2614  HSP20 family protein  50 
 
 
139 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.484892  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3085  heat shock protein Hsp20  46.3 
 
 
139 aa  101  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5261  heat shock protein Hsp20  43.22 
 
 
135 aa  101  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3376  heat shock protein Hsp20  46.23 
 
 
130 aa  101  7e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2810  HSP20 family protein  44.72 
 
 
131 aa  95.9  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0175635  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0529  HSP20 family protein  40.52 
 
 
133 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1246  HSP20 family protein  40.52 
 
 
133 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0625  HSP20 family protein  40.52 
 
 
133 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1440  HSP20 family protein  40.52 
 
 
133 aa  93.2  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5151  heat shock protein Hsp20  46.23 
 
 
135 aa  92.8  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1571  putative heat shock protein  40.52 
 
 
133 aa  92  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.483559  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1471  HSP20 family protein  40.52 
 
 
133 aa  92  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43946  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2579  putative low molecular weight heat shock protein, Hsp20-related  47.93 
 
 
137 aa  90.9  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2642  heat shock protein Hsp20  43.86 
 
 
134 aa  88.6  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3255  heat shock protein Hsp20  41.96 
 
 
132 aa  87  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2397  putative heat shock Hsp20-related protein  48.7 
 
 
135 aa  85.5  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0523871  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0314  heat shock protein Hsp20  42.11 
 
 
132 aa  82.8  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3666  heat shock protein Hsp20  46.73 
 
 
132 aa  81.6  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0021013  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0720  heat shock protein Hsp20  39.62 
 
 
120 aa  81.6  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00436062  normal  0.512737 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2959  heat shock protein Hsp20  41.51 
 
 
143 aa  81.6  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.167076 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3774  heat shock protein Hsp20  46.73 
 
 
132 aa  81.6  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4462  heat shock protein Hsp20  40.78 
 
 
132 aa  80.9  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2365  heat shock protein Hsp20  40.37 
 
 
135 aa  80.9  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.181504  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0781  heat shock protein Hsp20  45.37 
 
 
136 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1262  heat shock protein Hsp20  45.37 
 
 
136 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142057  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1743  heat shock protein Hsp20  36.11 
 
 
132 aa  80.1  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.174126  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2649  heat shock protein Hsp20  34.09 
 
 
185 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2409  HSP20 family protein  41.67 
 
 
132 aa  79  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1344  HSP20 family protein  37.38 
 
 
121 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.624294  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1174  heat shock protein Hsp20  34.33 
 
 
139 aa  77  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0792  heat shock protein Hsp20  40.57 
 
 
117 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.198377  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0358  Hsp20-like molecular chaperone  38.33 
 
 
134 aa  77  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3091  HSP20 family protein  36.52 
 
 
122 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0183  heat shock protein Hsp20  40.57 
 
 
132 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0939501  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4405  heat shock protein Hsp20  44.44 
 
 
136 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1234  heat shock protein Hsp20  44 
 
 
136 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.308291  normal  0.243977 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3461  heat shock protein Hsp20  38.05 
 
 
122 aa  72.8  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.798121  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2056  heat shock protein Hsp20  46.85 
 
 
137 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  34.82 
 
 
146 aa  71.6  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1141  heat shock protein Hsp20  44.14 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  36.19 
 
 
143 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0390  heat shock protein Hsp20  32.26 
 
 
130 aa  70.1  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.833766  normal  0.703561 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1153  heat shock protein Hsp20  44.44 
 
 
138 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.405022 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  35.24 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  34.48 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  39.09 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  37.96 
 
 
176 aa  69.3  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0160  heat shock protein Hsp20  35.19 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.248861  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  33.63 
 
 
147 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1214  molecular chaperone (small heat shock protein)  30.72 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.318766  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  31.73 
 
 
150 aa  67  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  36.15 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  30.7 
 
 
158 aa  66.6  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0454  heat shock protein Hsp20  37.38 
 
 
144 aa  67  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0539  heat shock protein Hsp20  37.14 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  32.73 
 
 
152 aa  67  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  31.82 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2302  heat shock protein Hsp20  37.61 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.276703 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  36.04 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  32.73 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  31.67 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4157  heat shock protein Hsp20  33.87 
 
 
150 aa  65.1  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0098  heat shock protein Hsp20  36.94 
 
 
168 aa  65.1  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  37.61 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  30.17 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0891  heat shock protein Hsp20  39.66 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.805469  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3600  heat shock protein Hsp20  36.89 
 
 
165 aa  63.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.484768  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  30.48 
 
 
162 aa  64.3  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2174  heat shock protein Hsp20  35.24 
 
 
169 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.150669  normal  0.4191 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0926  heat shock protein Hsp20  32.69 
 
 
152 aa  64.3  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4669  heat shock protein Hsp20  34.62 
 
 
147 aa  64.3  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  35.2 
 
 
144 aa  63.2  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7807  Hsp20 family heat-shock protein  33.06 
 
 
127 aa  63.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00129467  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
195 aa  63.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2683  heat shock protein Hsp20  34.17 
 
 
145 aa  63.5  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338339  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3312  heat shock protein, putative  35.29 
 
 
129 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.275059 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  30.97 
 
 
143 aa  62.8  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  35.29 
 
 
143 aa  63.2  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4119  heat shock protein Hsp20  35.85 
 
 
149 aa  62.4  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303961 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>