More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1141 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1141  heat shock protein Hsp20  100 
 
 		 139 aa  271  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1153  heat shock protein Hsp20  95.68 
 
 		 138 aa  205  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.405022 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2056  heat shock protein Hsp20  78.36 
 
 		 137 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4405  heat shock protein Hsp20  83.08 
 
 		 136 aa  170  7.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0781  heat shock protein Hsp20  80.77 
 
 		 136 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1262  heat shock protein Hsp20  80.77 
 
 		 136 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142057  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1234  heat shock protein Hsp20  80 
 
 		 136 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.308291  normal  0.243977 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5261  heat shock protein Hsp20  61.48 
 
 		 135 aa  149  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3431  heat shock protein Hsp20  55.4 
 
 		 139 aa  146  7e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2613  Hsp20 family heat-shock protein  61.34 
 
 		 142 aa  146  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000019665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4540  Hsp20 family heat-shock protein  61.34 
 
 		 142 aa  146  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000112582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6092  heat shock protein Hsp20  59.06 
 
 		 135 aa  146  9e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6389  heat shock protein Hsp20  58.27 
 
 		 135 aa  146  9e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0663133 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3085  heat shock protein Hsp20  55.4 
 
 		 139 aa  146  9e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2601  Hsp20 family heat-shock protein  56.39 
 
 		 135 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0188281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6420  heat shock protein Hsp20  65.42 
 
 		 146 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6655  heat shock protein Hsp20  65.42 
 
 		 146 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6253  heat shock protein Hsp20  62.71 
 
 		 141 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4649  heat shock protein Hsp20  57.26 
 
 		 137 aa  142  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.54341  normal  0.729236 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2810  HSP20 family protein  64.76 
 
 		 131 aa  140  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0175635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3423  HSP20 family protein  65.05 
 
 		 139 aa  139  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3388  HSP20 family protein  65.05 
 
 		 139 aa  139  9e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0799527  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0342  HSP20 family protein  65.05 
 
 		 162 aa  139  9e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.187953  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2427  HSP20 family protein  65.05 
 
 		 139 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3427  HSP20 family protein  65.05 
 
 		 139 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000520104  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2614  HSP20 family protein  65.05 
 
 		 139 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.484892  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1203  HSP20 family protein  65.05 
 
 		 139 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1246  HSP20 family protein  56.59 
 
 		 133 aa  133  8e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5151  heat shock protein Hsp20  61.26 
 
 		 135 aa  133  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0529  HSP20 family protein  56.59 
 
 		 133 aa  133  8e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1440  HSP20 family protein  56.59 
 
 		 133 aa  133  8e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0625  HSP20 family protein  56.59 
 
 		 133 aa  133  8e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1471  HSP20 family protein  56.59 
 
 		 133 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43946  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1571  putative heat shock protein  56.59 
 
 		 133 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.483559  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2043  putative heat shock protein  49.57 
 
 		 127 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.778686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2397  putative heat shock Hsp20-related protein  60.36 
 
 		 135 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0523871  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1731  HSP20 family protein  50.47 
 
 		 126 aa  111  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.13098  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1973  heat shock protein Hsp20  47.2 
 
 		 139 aa  107  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.287455  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2579  putative low molecular weight heat shock protein, Hsp20-related  55.86 
 
 		 137 aa  103  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3255  heat shock protein Hsp20  45.13 
 
 		 132 aa  100  7e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3376  heat shock protein Hsp20  43.2 
 
 		 130 aa  97.8  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1324  heat shock protein Hsp20  42.74 
 
 		 195 aa  92.4  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  38.17 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2365  heat shock protein Hsp20  37.78 
 
 		 135 aa  89.4  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.181504  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3313  heat shock protein, putative  42.45 
 
 		 123 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.257763  normal  0.279554 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2959  heat shock protein Hsp20  39.23 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.167076 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1743  heat shock protein Hsp20  38.06 
 
 		 132 aa  85.5  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.174126  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0390  heat shock protein Hsp20  37.12 
 
 		 130 aa  83.6  7e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.833766  normal  0.703561 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  32.84 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2642  heat shock protein Hsp20  40 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0891  heat shock protein Hsp20  40 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.805469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  31.53 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  33.63 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  36.44 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0403  heat shock protein Hsp20  35.58 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  40.95 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  31.62 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  36.21 
 
 		 195 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0314  heat shock protein Hsp20  37.38 
 
 		 132 aa  73.6  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  29.23 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0358  Hsp20-like molecular chaperone  34.85 
 
 		 134 aa  73.6  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  36.7 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2409  HSP20 family protein  36.19 
 
 		 132 aa  72  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3666  heat shock protein Hsp20  38.89 
 
 		 132 aa  72  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0021013  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4128  heat shock protein Hsp20  35.51 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2281  heat shock protein Hsp20  36.07 
 
 		 173 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.78764  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  31.82 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4462  heat shock protein Hsp20  36.54 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0735  heat shock protein Hsp20  32.08 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000037192  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1174  heat shock protein Hsp20  36.19 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0936  heat shock protein Hsp20  34.48 
 
 		 155 aa  71.2  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.172536  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  38.1 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  38.1 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3774  heat shock protein Hsp20  37.96 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  36.17 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7807  Hsp20 family heat-shock protein  33.07 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00129467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4235  heat shock protein Hsp20  36.61 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.283869  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  34.23 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0183  heat shock protein Hsp20  36.19 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0939501  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1344  HSP20 family protein  36.11 
 
 		 121 aa  70.1  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.624294  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0720  heat shock protein Hsp20  31.48 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00436062  normal  0.512737 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  35.14 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  37.27 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  32.54 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3091  HSP20 family protein  36.11 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  32.59 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  34.23 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  35.54 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  31.82 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0179  heat shock protein Hsp20  34.51 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0792  heat shock protein Hsp20  40 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.198377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  31.58 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  30.1 
 
 		 162 aa  67.8  0.00000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  32.73 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  33.98 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  33.33 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  36.04 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0609  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.346897  normal  0.0142886 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1018  heat shock protein Hsp20  32.73 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.683731  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>