More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3313 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3313  heat shock protein, putative  100 
 
 		 123 aa  249  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.257763  normal  0.279554 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2043  putative heat shock protein  54.76 
 
 		 127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.778686  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1731  HSP20 family protein  49.59 
 
 		 126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.13098  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1973  heat shock protein Hsp20  54.21 
 
 		 139 aa  115  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.287455  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3376  heat shock protein Hsp20  53.33 
 
 		 130 aa  110  8.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1324  heat shock protein Hsp20  48.62 
 
 		 195 aa  108  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6092  heat shock protein Hsp20  44 
 
 		 135 aa  103  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6389  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 		 135 aa  103  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0663133 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2601  Hsp20 family heat-shock protein  45.97 
 
 		 135 aa  102  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0188281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2613  Hsp20 family heat-shock protein  41.67 
 
 		 142 aa  99  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000019665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4540  Hsp20 family heat-shock protein  41.67 
 
 		 142 aa  99  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000112582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6253  heat shock protein Hsp20  43.33 
 
 		 141 aa  97.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6420  heat shock protein Hsp20  42.5 
 
 		 146 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6655  heat shock protein Hsp20  42.5 
 
 		 146 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3085  heat shock protein Hsp20  43.93 
 
 		 139 aa  96.7  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3431  heat shock protein Hsp20  42.99 
 
 		 139 aa  94.4  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5151  heat shock protein Hsp20  42.45 
 
 		 135 aa  93.6  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0342  HSP20 family protein  42.72 
 
 		 162 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.187953  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1203  HSP20 family protein  42.72 
 
 		 139 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2427  HSP20 family protein  42.72 
 
 		 139 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3427  HSP20 family protein  42.72 
 
 		 139 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000520104  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3388  HSP20 family protein  42.72 
 
 		 139 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0799527  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2614  HSP20 family protein  42.72 
 
 		 139 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.484892  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3423  HSP20 family protein  42.72 
 
 		 139 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5261  heat shock protein Hsp20  39.34 
 
 		 135 aa  88.6  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4649  heat shock protein Hsp20  41.9 
 
 		 137 aa  87.8  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.54341  normal  0.729236 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2810  HSP20 family protein  39.62 
 
 		 131 aa  85.9  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0175635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1246  HSP20 family protein  39.62 
 
 		 133 aa  84.7  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1571  putative heat shock protein  39.62 
 
 		 133 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.483559  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0529  HSP20 family protein  39.62 
 
 		 133 aa  84.7  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1440  HSP20 family protein  39.62 
 
 		 133 aa  84.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0625  HSP20 family protein  39.62 
 
 		 133 aa  84.7  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1471  HSP20 family protein  39.62 
 
 		 133 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43946  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2642  heat shock protein Hsp20  39.42 
 
 		 134 aa  84  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0781  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 		 136 aa  83.6  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1262  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 		 136 aa  83.6  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142057  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1234  heat shock protein Hsp20  43.82 
 
 		 136 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.308291  normal  0.243977 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4462  heat shock protein Hsp20  38.1 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3255  heat shock protein Hsp20  41.12 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4405  heat shock protein Hsp20  41.76 
 
 		 136 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2056  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2397  putative heat shock Hsp20-related protein  39.45 
 
 		 135 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0523871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1153  heat shock protein Hsp20  43.96 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.405022 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2579  putative low molecular weight heat shock protein, Hsp20-related  44.57 
 
 		 137 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1141  heat shock protein Hsp20  43.96 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0314  heat shock protein Hsp20  35.25 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7807  Hsp20 family heat-shock protein  33.07 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00129467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2365  heat shock protein Hsp20  35.51 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.181504  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1174  heat shock protein Hsp20  35.59 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0720  heat shock protein Hsp20  34.29 
 
 		 120 aa  72.4  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00436062  normal  0.512737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1743  heat shock protein Hsp20  34.26 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.174126  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0183  heat shock protein Hsp20  35.77 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0939501  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0358  Hsp20-like molecular chaperone  32.08 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2409  HSP20 family protein  35.85 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3461  heat shock protein Hsp20  34.19 
 
 		 122 aa  70.1  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.798121  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0792  heat shock protein Hsp20  31.82 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.198377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2959  heat shock protein Hsp20  34.95 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.167076 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  36.11 
 
 		 152 aa  67  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3666  heat shock protein Hsp20  35.77 
 
 		 132 aa  67  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0021013  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  36.84 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3774  heat shock protein Hsp20  35.83 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  32.14 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  37.38 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  39.64 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  39.64 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4119  heat shock protein Hsp20  30.1 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303961 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  34.96 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  39.42 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  39.42 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  34.75 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  38.74 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  34.23 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  30.1 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  31.78 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  34.15 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  34.91 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1528  heat shock protein Hsp20  31.78 
 
 		 153 aa  62  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00309172  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  32.73 
 
 		 150 aa  62  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1730  HSP20 family protein  35 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.34799  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2301  heat shock protein Hsp20  29.82 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1344  HSP20 family protein  29.25 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.624294  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  30 
 
 		 176 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  37.84 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  35.14 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  33.04 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  34.38 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0403  heat shock protein Hsp20  31.82 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  37 
 
 		 230 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2649  heat shock protein Hsp20  30.07 
 
 		 185 aa  60.5  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  30.77 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  33.64 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  34.55 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  32.17 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0160  heat shock protein Hsp20  30.7 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.248861  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  33.91 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  30.17 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  37.27 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0891  heat shock protein Hsp20  31.07 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.805469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  34.43 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>