142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2649 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2649  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
185 aa  370  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3091  HSP20 family protein  48 
 
 
122 aa  135  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2302  heat shock protein Hsp20  50 
 
 
153 aa  121  6e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.276703 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2959  heat shock protein Hsp20  36.53 
 
 
143 aa  94.7  7e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.167076 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0720  heat shock protein Hsp20  31.76 
 
 
120 aa  84  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00436062  normal  0.512737 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3461  heat shock protein Hsp20  35.62 
 
 
122 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.798121  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1344  HSP20 family protein  34.04 
 
 
121 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.624294  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0792  heat shock protein Hsp20  35.77 
 
 
117 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.198377  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1324  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 
195 aa  77.4  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317374  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1973  heat shock protein Hsp20  32.86 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.287455  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1743  heat shock protein Hsp20  28.17 
 
 
132 aa  63.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.174126  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3666  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 
132 aa  63.2  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0021013  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4462  heat shock protein Hsp20  29.5 
 
 
132 aa  61.6  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3774  heat shock protein Hsp20  27.86 
 
 
132 aa  62  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2642  heat shock protein Hsp20  28.31 
 
 
134 aa  61.2  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2043  putative heat shock protein  33.33 
 
 
127 aa  61.2  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.778686  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3313  heat shock protein, putative  30.07 
 
 
123 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.257763  normal  0.279554 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3376  heat shock protein Hsp20  31.48 
 
 
130 aa  60.5  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  32.39 
 
 
143 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2365  heat shock protein Hsp20  26.95 
 
 
135 aa  59.3  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.181504  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0358  Hsp20-like molecular chaperone  27.54 
 
 
134 aa  58.9  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0314  heat shock protein Hsp20  27.86 
 
 
132 aa  58.9  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1731  HSP20 family protein  29.79 
 
 
126 aa  58.5  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.13098  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  30.99 
 
 
143 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1214  molecular chaperone (small heat shock protein)  27.46 
 
 
260 aa  56.6  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.318766  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5151  heat shock protein Hsp20  30 
 
 
135 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2409  HSP20 family protein  25.85 
 
 
132 aa  55.5  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0183  heat shock protein Hsp20  25.81 
 
 
132 aa  55.5  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0939501  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  30.43 
 
 
143 aa  55.1  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  28.29 
 
 
148 aa  55.5  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2613  Hsp20 family heat-shock protein  28.05 
 
 
142 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000019665  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4540  Hsp20 family heat-shock protein  28.05 
 
 
142 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000112582  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  29.61 
 
 
144 aa  53.5  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  29.73 
 
 
143 aa  53.9  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6420  heat shock protein Hsp20  33.12 
 
 
146 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6655  heat shock protein Hsp20  33.12 
 
 
146 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381902  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3917  heat shock protein Hsp20  25.56 
 
 
142 aa  53.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6253  heat shock protein Hsp20  32.26 
 
 
141 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7807  Hsp20 family heat-shock protein  26.57 
 
 
127 aa  52.8  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00129467  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  28.47 
 
 
151 aa  52.4  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3431  heat shock protein Hsp20  28.24 
 
 
139 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349992  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0925  heat shock protein Hsp20  27.1 
 
 
134 aa  52  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0390  heat shock protein Hsp20  29.01 
 
 
130 aa  51.6  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.833766  normal  0.703561 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  26.62 
 
 
189 aa  51.6  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3085  heat shock protein Hsp20  30 
 
 
139 aa  51.2  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  25.34 
 
 
145 aa  51.2  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3255  heat shock protein Hsp20  26.43 
 
 
132 aa  50.4  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  25.85 
 
 
158 aa  50.4  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5151  heat shock protein Hsp20  26.43 
 
 
148 aa  50.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184623  normal  0.32984 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  27.45 
 
 
146 aa  49.7  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  27.45 
 
 
146 aa  49.7  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1474  heat shock protein Hsp20  24.5 
 
 
151 aa  50.1  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.242626  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  26.06 
 
 
189 aa  50.1  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3386  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 
147 aa  49.7  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4649  heat shock protein Hsp20  27.08 
 
 
137 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.54341  normal  0.729236 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1174  heat shock protein Hsp20  26.81 
 
 
139 aa  48.5  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2601  Hsp20 family heat-shock protein  28.57 
 
 
135 aa  48.1  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0188281  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0423  heat shock protein Hsp20  26.36 
 
 
152 aa  47.8  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.943695  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1528  heat shock protein Hsp20  26.09 
 
 
153 aa  47.8  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00309172  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  25.55 
 
 
146 aa  47.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  26.06 
 
 
189 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  25.35 
 
 
189 aa  47.8  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6389  heat shock protein Hsp20  26.17 
 
 
135 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0663133 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  30.66 
 
 
143 aa  47.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  28.26 
 
 
145 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4119  heat shock protein Hsp20  28.89 
 
 
149 aa  47.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303961 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4669  heat shock protein Hsp20  53.49 
 
 
147 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6092  heat shock protein Hsp20  27.52 
 
 
135 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  29.2 
 
 
144 aa  46.6  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0342  HSP20 family protein  29.63 
 
 
162 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.187953  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  23.08 
 
 
176 aa  46.6  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  28.79 
 
 
142 aa  46.6  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07892  conserved hypothetical protein  25.66 
 
 
184 aa  46.2  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.524725  normal  0.90823 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  27.01 
 
 
139 aa  45.8  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  26.43 
 
 
176 aa  46.2  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  24.65 
 
 
189 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  28.08 
 
 
143 aa  46.2  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  27.74 
 
 
158 aa  45.8  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2427  HSP20 family protein  29.63 
 
 
139 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3427  HSP20 family protein  29.63 
 
 
139 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000520104  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4157  heat shock protein Hsp20  28.3 
 
 
150 aa  45.4  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3256  heat shock protein Hsp20  29.71 
 
 
153 aa  45.8  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1203  HSP20 family protein  29.63 
 
 
139 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3388  HSP20 family protein  29.63 
 
 
139 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0799527  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3423  HSP20 family protein  29.63 
 
 
139 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2614  HSP20 family protein  29.63 
 
 
139 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.484892  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3312  heat shock protein, putative  29.85 
 
 
129 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.275059 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1199  heat shock protein Hsp20  24.5 
 
 
143 aa  45.4  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.76992  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  29.63 
 
 
149 aa  45.1  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0926  heat shock protein Hsp20  24.44 
 
 
152 aa  45.4  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5491  heat shock protein Hsp20  27.46 
 
 
211 aa  45.4  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710483  normal  0.352797 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  26.43 
 
 
148 aa  45.1  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  28.26 
 
 
145 aa  45.1  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6221  heat shock protein Hsp20  22.86 
 
 
151 aa  45.1  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1230  heat shock protein Hsp20  26.47 
 
 
164 aa  45.1  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  21.43 
 
 
162 aa  45.1  0.0007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  24.28 
 
 
147 aa  44.7  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2301  heat shock protein Hsp20  20.67 
 
 
142 aa  44.7  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46681  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0370  heat shock protein Hsp20  26.24 
 
 
140 aa  44.7  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.733353  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1246  HSP20 family protein  26.03 
 
 
133 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>