More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6221 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6221  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
151 aa  305  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3917  heat shock protein Hsp20  41.6 
 
 
142 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2899  heat shock protein Hsp20  39.87 
 
 
145 aa  102  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0174584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5151  heat shock protein Hsp20  39.69 
 
 
148 aa  102  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184623  normal  0.32984 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4413  heat shock protein Hsp20  37.78 
 
 
150 aa  94.4  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06090  small heat shock protein  39.71 
 
 
148 aa  92.8  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.473161  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2326  heat shock protein Hsp20  38.71 
 
 
144 aa  92  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0663504 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0836  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 
149 aa  91.3  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.414458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0370  heat shock protein Hsp20  47.17 
 
 
140 aa  90.5  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.733353  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3751  response regulator receiver protein  44.76 
 
 
150 aa  89.7  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.544355  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1697  hypothetical protein  48.48 
 
 
145 aa  89.7  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6319  heat shock protein Hsp20  35.95 
 
 
149 aa  89.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  41.75 
 
 
139 aa  85.1  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0233  small heat shock protein  37.96 
 
 
145 aa  84.3  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.818598  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  41.9 
 
 
143 aa  83.2  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2210  heat shock protein Hsp20  40.78 
 
 
139 aa  82.8  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0417447  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 
139 aa  82  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4132  heat shock protein Hsp20  32.37 
 
 
144 aa  80.5  0.000000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  36.89 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  39.36 
 
 
148 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
134 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  37.89 
 
 
134 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  37.5 
 
 
132 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2159  heat shock protein Hsp20  43.69 
 
 
139 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  42.27 
 
 
163 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4951  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
134 aa  75.9  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260746  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2958  heat shock protein Hsp20  38.89 
 
 
142 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.206888 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0513  heat shock protein Hsp20  38.04 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  35.4 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  36.97 
 
 
146 aa  75.5  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  34.55 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1029  Hsp20/alpha crystallin family protein  33.33 
 
 
146 aa  73.6  0.0000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00339514  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2459  heat shock protein Hsp20  41.94 
 
 
142 aa  73.6  0.0000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.134169  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  37.96 
 
 
166 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2559  hypothetical protein  31.13 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2414  hypothetical protein  31.13 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0622  HSP20 family protein  34.51 
 
 
132 aa  73.6  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3125  heat shock protein Hsp20  44 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2836  heat shock protein Hsp20  33.1 
 
 
197 aa  73.6  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00556978  normal  0.209218 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  32.73 
 
 
143 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2409  HSP20 family protein  36.44 
 
 
132 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2027  heat shock protein Hsp20  38.53 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3527  putative HspC2 heat shock protein  37.38 
 
 
173 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  33.64 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3314  HSP20 family protein  32.43 
 
 
151 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.284188 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2938  heat shock protein Hsp20  41 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000491843  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  34.55 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0793  heat shock protein Hsp20  36.54 
 
 
136 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.515708  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  33.04 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  42.2 
 
 
142 aa  71.2  0.000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  36.79 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2940  heat shock protein Hsp20  33.08 
 
 
168 aa  70.9  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1165  heat shock protein Hsp20  37.14 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.245253  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0183  heat shock protein Hsp20  37.38 
 
 
132 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0939501  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1110  heat shock protein Hsp20  34.65 
 
 
145 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.339847  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  29.1 
 
 
185 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1292  heat shock protein Hsp20  35.29 
 
 
170 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0518729  normal  0.504399 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1343  HSP20 family protein  40.59 
 
 
135 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  29.1 
 
 
185 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  33.63 
 
 
167 aa  70.1  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  33.94 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  34.85 
 
 
136 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1149  heat shock protein Hsp20  37.23 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1219  heat shock protein Hsp20  37.23 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5150  heat shock protein Hsp20  30.36 
 
 
146 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0358  Hsp20-like molecular chaperone  38.54 
 
 
134 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  34.02 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  32.14 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2301  heat shock protein Hsp20  33.61 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46681  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0756  heat shock protein Hsp20  38.95 
 
 
132 aa  68.2  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.16256 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  26.92 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2281  heat shock protein Hsp20  27.94 
 
 
173 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.78764  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0936  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.172536  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3113  heat shock protein Hsp20  37.63 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.800815  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  36.22 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  29.37 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1396  molecular chaperone-like protein  39.58 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2155  heat shock protein Hsp20  41.58 
 
 
132 aa  67.4  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0250  HSP20 family protein  38.04 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.962825  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4395  heat shock protein Hsp20  35.24 
 
 
181 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481666  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4528  heat shock protein Hsp20  35.24 
 
 
181 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.550609  normal  0.0462291 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2058  heat shock protein Hsp20  33.7 
 
 
141 aa  67  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  28.46 
 
 
157 aa  67  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  34.78 
 
 
151 aa  67  0.00000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  34.78 
 
 
151 aa  67  0.00000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  33.64 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1368  heat shock molecular chaperone  33.06 
 
 
167 aa  66.6  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  36.96 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0296  heat shock protein Hsp20  30.77 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2809  HSP20 family protein  29.73 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0002171  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  30.83 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0588  heat shock protein, molecular chaperone  43.14 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.648467  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  36.96 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0289  heat shock protein Hsp20  40.21 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0247001  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0314  heat shock protein Hsp20  33.61 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  33.96 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1167  heat shock protein Hsp20  35.82 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  30.4 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1537  heat shock protein Hsp20  38.68 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  30.83 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>