More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2155 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2155  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
132 aa  270  4.0000000000000004e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  78.03 
 
 
132 aa  224  4e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  79.7 
 
 
134 aa  219  7e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0622  HSP20 family protein  74.24 
 
 
132 aa  211  1.9999999999999998e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  71.43 
 
 
134 aa  199  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0756  heat shock protein Hsp20  68.7 
 
 
132 aa  178  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.16256 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1706  heat shock protein Hsp20  58.02 
 
 
132 aa  173  6e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00808314  hitchhiker  0.000432661 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  47.83 
 
 
139 aa  137  6e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2210  heat shock protein Hsp20  48.48 
 
 
139 aa  134  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0417447  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  52.24 
 
 
139 aa  133  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  46.21 
 
 
139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2159  heat shock protein Hsp20  48.18 
 
 
139 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0250  HSP20 family protein  48.36 
 
 
139 aa  110  8.000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.962825  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  46.92 
 
 
147 aa  103  9e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  45.6 
 
 
142 aa  99.4  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  42.96 
 
 
147 aa  99  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  44 
 
 
149 aa  97.8  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  43.24 
 
 
146 aa  96.7  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  43.24 
 
 
146 aa  96.7  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0588  heat shock protein, molecular chaperone  43.48 
 
 
141 aa  95.5  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.648467  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  44.55 
 
 
145 aa  95.1  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  40 
 
 
143 aa  94.4  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  37.04 
 
 
151 aa  93.6  8e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  37.04 
 
 
151 aa  93.6  8e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  45.08 
 
 
153 aa  92.8  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  37.41 
 
 
185 aa  92  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  37.41 
 
 
185 aa  92  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  35.33 
 
 
189 aa  91.7  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  38.69 
 
 
184 aa  92  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  46.08 
 
 
151 aa  91.3  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  36 
 
 
147 aa  90.9  5e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  35.2 
 
 
147 aa  90.9  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2938  heat shock protein Hsp20  41.67 
 
 
145 aa  90.9  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000491843  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  34.51 
 
 
204 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  40.44 
 
 
143 aa  90.1  8e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  38.4 
 
 
145 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  39.84 
 
 
145 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  35.17 
 
 
189 aa  89.4  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  45.74 
 
 
166 aa  89  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  39.06 
 
 
145 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  38.46 
 
 
150 aa  89  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  31.69 
 
 
194 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  38.28 
 
 
145 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  42.98 
 
 
148 aa  87.4  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  34.85 
 
 
148 aa  87  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  40.78 
 
 
147 aa  87  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  37.1 
 
 
150 aa  87  8e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  36.43 
 
 
172 aa  87  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  33.81 
 
 
166 aa  86.7  9e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  33.1 
 
 
189 aa  86.3  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1165  heat shock protein Hsp20  42.31 
 
 
145 aa  86.3  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.245253  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  39.81 
 
 
147 aa  86.7  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3125  heat shock protein Hsp20  41.96 
 
 
149 aa  85.9  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  34.01 
 
 
189 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  41.23 
 
 
147 aa  85.9  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1660  heat shock protein Hsp20  41.9 
 
 
145 aa  85.5  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.870911  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  46.15 
 
 
152 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  36.69 
 
 
165 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1695  heat shock protein Hsp20  41.67 
 
 
151 aa  85.1  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2683  heat shock protein Hsp20  40.15 
 
 
145 aa  84.7  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338339  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  36.69 
 
 
173 aa  84.3  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  38.98 
 
 
152 aa  84.3  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  34.01 
 
 
189 aa  84.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4132  heat shock protein Hsp20  39.45 
 
 
144 aa  83.6  7e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  41.59 
 
 
195 aa  83.6  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0320  heat shock protein Hsp20  42.57 
 
 
150 aa  83.6  8e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  42.22 
 
 
156 aa  83.6  9e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3612  hypothetical protein  40.38 
 
 
177 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  34.62 
 
 
144 aa  83.2  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5914  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
144 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0664313  normal  0.562292 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  41.84 
 
 
145 aa  83.2  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6221  heat shock protein Hsp20  40.74 
 
 
151 aa  82  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0391  heat shock protein Hsp20  35.04 
 
 
151 aa  82  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0513  heat shock protein Hsp20  35.65 
 
 
147 aa  82.4  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  34.33 
 
 
143 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2290  HSP20 family protein  41.67 
 
 
145 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.581771  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
144 aa  82  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  35.43 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  43.82 
 
 
162 aa  81.3  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2372  heat shock protein, Hsp20 family  41.67 
 
 
145 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0601479  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0719  heat shock protein Hsp20  39.5 
 
 
137 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00433386  normal  0.504335 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1110  heat shock protein Hsp20  34.13 
 
 
145 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.339847  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  42.27 
 
 
148 aa  80.5  0.000000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  44.44 
 
 
176 aa  80.5  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  43.12 
 
 
176 aa  80.5  0.000000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2281  heat shock protein Hsp20  41.35 
 
 
173 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.78764  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  36.22 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2836  heat shock protein Hsp20  30.26 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00556978  normal  0.209218 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09080  molecular chaperone (small heat shock protein)  38.58 
 
 
145 aa  79.7  0.00000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.675828  normal  0.433955 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  34.65 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  35.38 
 
 
151 aa  79.7  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2043  heat shock protein  40.74 
 
 
145 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467829  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  39.22 
 
 
136 aa  79.3  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  43.82 
 
 
162 aa  79  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0403  heat shock protein Hsp20  39.42 
 
 
138 aa  79.3  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2321  stress response protein  33.06 
 
 
513 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  41.75 
 
 
163 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  33.06 
 
 
146 aa  79  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2106  HSP20 family protein  41.12 
 
 
145 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.291359  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2045  heat shock protein  40.74 
 
 
145 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00409698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>