More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2159 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_2159  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
139 aa  282  1.0000000000000001e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  80.58 
 
 
139 aa  236  6.999999999999999e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  72.46 
 
 
139 aa  216  7e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2210  heat shock protein Hsp20  69.78 
 
 
139 aa  212  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0417447  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  71.94 
 
 
139 aa  211  2.9999999999999995e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0250  HSP20 family protein  75.54 
 
 
139 aa  207  3e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.962825  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  52.52 
 
 
134 aa  145  1.0000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  51.45 
 
 
132 aa  139  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0622  HSP20 family protein  48.12 
 
 
132 aa  130  5e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  45 
 
 
134 aa  127  5.0000000000000004e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1706  heat shock protein Hsp20  44.7 
 
 
132 aa  123  9e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00808314  hitchhiker  0.000432661 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0756  heat shock protein Hsp20  50 
 
 
132 aa  122  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.16256 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2155  heat shock protein Hsp20  47.93 
 
 
132 aa  104  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  44.76 
 
 
146 aa  104  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  44.76 
 
 
146 aa  104  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  44.25 
 
 
145 aa  103  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  46.6 
 
 
147 aa  101  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  40.41 
 
 
141 aa  100  8e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  47.54 
 
 
142 aa  100  9e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  37.72 
 
 
189 aa  99.8  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  49.04 
 
 
151 aa  98.6  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  41.94 
 
 
153 aa  98.6  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1695  heat shock protein Hsp20  39.37 
 
 
151 aa  97.8  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  34.07 
 
 
189 aa  95.9  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  42.31 
 
 
147 aa  95.1  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2938  heat shock protein Hsp20  42.52 
 
 
145 aa  94  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000491843  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  42.96 
 
 
158 aa  93.6  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  37.4 
 
 
147 aa  94  7e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0513  heat shock protein Hsp20  39.37 
 
 
147 aa  93.6  9e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  48.54 
 
 
152 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  37.4 
 
 
147 aa  93.2  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  40.44 
 
 
150 aa  93.2  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  44.55 
 
 
145 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  42.06 
 
 
230 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  43.64 
 
 
145 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  37.3 
 
 
146 aa  92  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2301  heat shock protein Hsp20  42.28 
 
 
142 aa  91.7  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46681  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  41.96 
 
 
143 aa  92  3e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  43.64 
 
 
145 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  31.85 
 
 
189 aa  90.5  6e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2899  heat shock protein Hsp20  37.8 
 
 
145 aa  90.9  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0174584 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  41.75 
 
 
156 aa  90.5  7e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  46.15 
 
 
149 aa  90.1  8e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3805  heat shock protein Hsp20  35.34 
 
 
158 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  36.5 
 
 
148 aa  90.1  9e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1149  heat shock protein Hsp20  44.12 
 
 
140 aa  89.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1219  heat shock protein Hsp20  44.12 
 
 
140 aa  89.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  31.11 
 
 
189 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  29.93 
 
 
189 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  41.59 
 
 
151 aa  89.4  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  41.59 
 
 
151 aa  89.4  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  33.59 
 
 
185 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  33.59 
 
 
185 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3498  heat shock protein Hsp20  34.48 
 
 
158 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  47.25 
 
 
143 aa  88.6  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  34.23 
 
 
204 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3882  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
158 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.545217  normal  0.180827 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3113  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
142 aa  88.6  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.800815  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  44.57 
 
 
147 aa  88.2  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  42.31 
 
 
148 aa  88.6  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  40.38 
 
 
147 aa  87.8  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09080  molecular chaperone (small heat shock protein)  43.8 
 
 
145 aa  87.8  4e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.675828  normal  0.433955 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0200  putative small HEAT shock protein  41.67 
 
 
140 aa  87.4  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.32202 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  43.48 
 
 
147 aa  87.4  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  29.5 
 
 
157 aa  87.8  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1167  heat shock protein Hsp20  47.79 
 
 
149 aa  87  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  42.99 
 
 
143 aa  87  8e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6093  heat shock protein Hsp20  33.09 
 
 
187 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  27.59 
 
 
185 aa  86.3  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  37.8 
 
 
163 aa  86.3  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0320  heat shock protein Hsp20  45.19 
 
 
150 aa  86.3  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2683  heat shock protein Hsp20  40.94 
 
 
145 aa  85.9  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338339  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  36.64 
 
 
153 aa  85.5  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6390  heat shock protein Hsp20  32.37 
 
 
187 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.065602 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  36.21 
 
 
176 aa  85.9  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2086  heat shock protein, Hsp20 family  44.14 
 
 
145 aa  85.1  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  41.75 
 
 
144 aa  85.1  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1743  heat shock protein Hsp20  44.14 
 
 
145 aa  85.1  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.49982  normal  0.0110244 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2459  heat shock protein Hsp20  39.2 
 
 
142 aa  85.1  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.134169  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  42.11 
 
 
142 aa  85.1  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3125  heat shock protein Hsp20  45.71 
 
 
149 aa  85.1  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3917  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
142 aa  84.7  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2078  heat shock protein Hsp20  36.49 
 
 
147 aa  84.7  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  39.42 
 
 
136 aa  84.7  4e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4382  heat shock protein Hsp20  39.1 
 
 
140 aa  84.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4514  heat shock protein Hsp20  39.1 
 
 
140 aa  84.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.165488  normal  0.480818 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0391  heat shock protein Hsp20  32.86 
 
 
151 aa  84.7  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  41.9 
 
 
145 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  38.4 
 
 
146 aa  84.3  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  42 
 
 
150 aa  84.3  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  35.86 
 
 
145 aa  84  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0539  heat shock protein Hsp20  42.57 
 
 
161 aa  84  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 
144 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  36.29 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2600  putative heat shock protein Hsp20  28.97 
 
 
187 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207676  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  33.59 
 
 
165 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  35.4 
 
 
176 aa  82  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5491  heat shock protein Hsp20  28.78 
 
 
211 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710483  normal  0.352797 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6221  heat shock protein Hsp20  43.69 
 
 
151 aa  82  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1660  heat shock protein Hsp20  43.69 
 
 
145 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.870911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>