More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2899 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2899  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
145 aa  298  1e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0174584 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2326  heat shock protein Hsp20  45.14 
 
 
144 aa  122  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0663504 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5151  heat shock protein Hsp20  48.92 
 
 
148 aa  119  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184623  normal  0.32984 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6319  heat shock protein Hsp20  44.08 
 
 
149 aa  118  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3751  response regulator receiver protein  44.08 
 
 
150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.544355  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0836  heat shock protein Hsp20  41.45 
 
 
149 aa  107  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.414458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3917  heat shock protein Hsp20  47.66 
 
 
142 aa  106  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4413  heat shock protein Hsp20  41.18 
 
 
150 aa  106  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6221  heat shock protein Hsp20  39.87 
 
 
151 aa  102  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  38.41 
 
 
148 aa  102  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06090  small heat shock protein  39.86 
 
 
148 aa  100  6e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.473161  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  36.5 
 
 
144 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4132  heat shock protein Hsp20  36.29 
 
 
144 aa  93.6  9e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  38.52 
 
 
147 aa  93.2  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0233  small heat shock protein  42.03 
 
 
145 aa  92  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.818598  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  37.78 
 
 
147 aa  91.3  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  35.43 
 
 
139 aa  90.5  6e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0370  heat shock protein Hsp20  38.66 
 
 
140 aa  90.9  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.733353  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3076  heat shock protein Hsp20  32.85 
 
 
173 aa  90.1  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  37.3 
 
 
139 aa  89.7  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2559  hypothetical protein  36.03 
 
 
164 aa  89  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4023  heat shock protein Hsp20  34.29 
 
 
147 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4061  heat shock protein Hsp20  34.29 
 
 
147 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1697  hypothetical protein  44.55 
 
 
145 aa  86.7  9e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2414  hypothetical protein  39.45 
 
 
164 aa  86.3  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  33.86 
 
 
139 aa  85.1  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0513  heat shock protein Hsp20  38.68 
 
 
147 aa  84.3  5e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2210  heat shock protein Hsp20  33.86 
 
 
139 aa  84  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0417447  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  43.62 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  36.44 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
142 aa  81.6  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  36.79 
 
 
141 aa  81.6  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  40.43 
 
 
144 aa  81.3  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  37.14 
 
 
184 aa  80.9  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
150 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  31.25 
 
 
145 aa  80.5  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  33.86 
 
 
147 aa  80.1  0.000000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0936  heat shock protein Hsp20  37.7 
 
 
155 aa  80.5  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.172536  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2159  heat shock protein Hsp20  37.8 
 
 
139 aa  80.1  0.000000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  33.96 
 
 
151 aa  80.1  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  29.93 
 
 
146 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  33.86 
 
 
147 aa  79.7  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0143  heat shock protein Hsp20  30.37 
 
 
156 aa  80.1  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  32.41 
 
 
145 aa  80.1  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  31.25 
 
 
145 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  36.51 
 
 
153 aa  79.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  35.43 
 
 
146 aa  79  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  34.56 
 
 
162 aa  79  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  36.59 
 
 
153 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2938  heat shock protein Hsp20  38.58 
 
 
145 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000491843  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  36.89 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  35.04 
 
 
162 aa  78.2  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  33.87 
 
 
134 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  32.88 
 
 
158 aa  77.4  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  38.68 
 
 
143 aa  77  0.00000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  29.17 
 
 
145 aa  77  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  37.23 
 
 
189 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  31.76 
 
 
158 aa  76.6  0.00000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  31.85 
 
 
143 aa  76.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  30.87 
 
 
160 aa  76.6  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  30.07 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  28.29 
 
 
149 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  30.87 
 
 
160 aa  76.6  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  30.07 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2086  heat shock protein, Hsp20 family  31.79 
 
 
145 aa  76.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1743  heat shock protein Hsp20  31.79 
 
 
145 aa  76.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.49982  normal  0.0110244 
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  34.31 
 
 
162 aa  75.9  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5150  heat shock protein Hsp20  38 
 
 
146 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  38.32 
 
 
176 aa  75.5  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0460  heat shock protein Hsp20  34.4 
 
 
155 aa  75.9  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  29.5 
 
 
148 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  29.5 
 
 
148 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  34.48 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  33.02 
 
 
147 aa  74.3  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  31.39 
 
 
189 aa  74.3  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  39.36 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  34.04 
 
 
149 aa  74.3  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  35.51 
 
 
151 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1509  heat shock protein Hsp20  40.16 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000196437  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  28.77 
 
 
147 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0720  heat shock protein Hsp20  35.54 
 
 
120 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00436062  normal  0.512737 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0250  HSP20 family protein  33.07 
 
 
139 aa  73.6  0.0000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.962825  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  38.68 
 
 
142 aa  73.6  0.0000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  33.06 
 
 
143 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  33.98 
 
 
134 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  33.64 
 
 
177 aa  73.2  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  32.23 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  29.25 
 
 
185 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  34.91 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  36.17 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0690  heat shock protein Hsp20  32.08 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202005  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  35.85 
 
 
189 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  30.19 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  36.79 
 
 
136 aa  72.8  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1983  heat shock protein Hsp20  34.58 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00684856  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  35.24 
 
 
151 aa  72.4  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  35.24 
 
 
151 aa  72.4  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  29.13 
 
 
185 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  33.64 
 
 
195 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>