More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1296 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  100 
 
 		 143 aa  292  1e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  51.52 
 
 		 148 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  45.86 
 
 		 146 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  43.61 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  42.96 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  37.76 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  39.42 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  39.42 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  41.61 
 
 		 145 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1214  molecular chaperone (small heat shock protein)  40.88 
 
 		 260 aa  105  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.318766  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  38.13 
 
 		 160 aa  104  4e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  41.73 
 
 		 145 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  38.13 
 
 		 160 aa  104  4e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  41.01 
 
 		 145 aa  103  9e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  40.29 
 
 		 145 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  47.62 
 
 		 150 aa  101  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  40.52 
 
 		 152 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  39.86 
 
 		 148 aa  99.4  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  38.85 
 
 		 147 aa  98.2  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  37.12 
 
 		 142 aa  98.2  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  36.03 
 
 		 151 aa  97.8  4e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  36.03 
 
 		 151 aa  97.8  4e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  38.85 
 
 		 147 aa  97.8  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  39.23 
 
 		 143 aa  97.4  6e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  34.06 
 
 		 156 aa  97.1  8e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  37.41 
 
 		 147 aa  96.3  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  37.96 
 
 		 151 aa  96.3  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  34.31 
 
 		 147 aa  95.1  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  39.23 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  38.69 
 
 		 145 aa  95.1  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  40.77 
 
 		 143 aa  94.4  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2683  heat shock protein Hsp20  38.52 
 
 		 145 aa  94.4  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338339  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  35.07 
 
 		 149 aa  93.2  9e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  36.03 
 
 		 139 aa  92.4  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  34.78 
 
 		 142 aa  92  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3386  heat shock protein Hsp20  40 
 
 		 147 aa  92  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  35.51 
 
 		 144 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  37.59 
 
 		 158 aa  90.5  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  33.58 
 
 		 147 aa  90.5  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0320  heat shock protein Hsp20  37.16 
 
 		 150 aa  90.1  8e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  35.29 
 
 		 146 aa  90.1  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  35.24 
 
 		 162 aa  89.4  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  37.32 
 
 		 194 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4061  heat shock protein Hsp20  35.29 
 
 		 147 aa  88.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4023  heat shock protein Hsp20  35.29 
 
 		 147 aa  88.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  37.59 
 
 		 141 aa  87.8  5e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  38.21 
 
 		 153 aa  87.4  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  36.11 
 
 		 153 aa  87.8  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1743  heat shock protein Hsp20  36.96 
 
 		 145 aa  86.7  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.49982  normal  0.0110244 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0675  heat shock protein Hsp20  39.86 
 
 		 163 aa  87  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000000558694  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2086  heat shock protein, Hsp20 family  36.96 
 
 		 145 aa  86.7  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3573  heat shock protein Hsp20  39.84 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  37.84 
 
 		 136 aa  86.7  1e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  33.09 
 
 		 180 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0513  heat shock protein Hsp20  35.96 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  35.77 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  37.04 
 
 		 189 aa  85.9  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  34.96 
 
 		 166 aa  85.5  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  36.43 
 
 		 149 aa  85.1  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  35.77 
 
 		 143 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  35.77 
 
 		 147 aa  85.1  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3076  heat shock protein Hsp20  32.35 
 
 		 173 aa  84.7  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0403  heat shock protein Hsp20  36.72 
 
 		 138 aa  84.7  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3074  heat shock protein Hsp20  39.29 
 
 		 144 aa  84  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1730  HSP20 family protein  33.09 
 
 		 149 aa  84  7e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.34799  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  36.03 
 
 		 163 aa  83.6  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2796  heat shock protein  41.44 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300285  normal  0.746249 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  35.04 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  37.06 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  36.54 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3580  molecular chaperone (small heat shock protein)  32.52 
 
 		 141 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  32.52 
 
 		 176 aa  82  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  34.65 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  38.28 
 
 		 173 aa  82  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1474  heat shock protein Hsp20  36.55 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.242626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  35.56 
 
 		 189 aa  80.9  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  33.33 
 
 		 162 aa  80.9  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0143  heat shock protein Hsp20  31.62 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  36.3 
 
 		 189 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  38.33 
 
 		 149 aa  80.5  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2365  heat shock protein Hsp20  38.02 
 
 		 135 aa  80.5  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.181504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4119  heat shock protein Hsp20  40.59 
 
 		 149 aa  80.1  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303961 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  36.3 
 
 		 189 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  35.04 
 
 		 150 aa  80.1  0.000000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  33.33 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 		 134 aa  80.1  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0936  heat shock protein Hsp20  34.35 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.172536  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  34.56 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0357  Hsp20-like molecular chaperone  41.35 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  32.58 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0540  heat shock protein Hsp20  34.53 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1528  heat shock protein Hsp20  34.31 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00309172  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  36.54 
 
 		 195 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2657  heat shock protein Hsp20  36.15 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.498697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  35.56 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 		 152 aa  77.8  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  35.51 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0454  heat shock protein Hsp20  36.5 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  31.3 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>