More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0675 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0675  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
163 aa  316  1e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000000558694  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  69.33 
 
 
153 aa  198  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  70.27 
 
 
149 aa  197  5e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3074  heat shock protein Hsp20  60.4 
 
 
144 aa  147  4e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0672  heat shock protein Hsp20  48.72 
 
 
159 aa  136  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000109595  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3577  heat shock protein Hsp20  43.24 
 
 
157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.202692  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  43.71 
 
 
151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  39.19 
 
 
147 aa  112  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  42.68 
 
 
230 aa  110  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  38.51 
 
 
147 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  39.86 
 
 
146 aa  107  6e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  39.86 
 
 
146 aa  107  6e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  37.84 
 
 
149 aa  101  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  39.16 
 
 
142 aa  100  6e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  40.69 
 
 
143 aa  99.8  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
142 aa  100  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  39.22 
 
 
156 aa  100  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  34.46 
 
 
147 aa  99.4  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3323  heat shock protein Hsp20  41.77 
 
 
228 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  37.86 
 
 
147 aa  97.8  6e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  39.62 
 
 
204 aa  97.4  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  39.46 
 
 
185 aa  97.4  8e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  39.46 
 
 
185 aa  97.4  8e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  37.14 
 
 
147 aa  97.1  9e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  37.86 
 
 
144 aa  96.7  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3336  heat shock protein Hsp20  46.09 
 
 
191 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  43.15 
 
 
172 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  41.13 
 
 
143 aa  96.7  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  36.71 
 
 
194 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  41.67 
 
 
150 aa  96.3  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  42.66 
 
 
195 aa  95.5  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  39.86 
 
 
158 aa  95.1  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  37.32 
 
 
148 aa  94.7  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  36.55 
 
 
148 aa  94.7  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  34.9 
 
 
148 aa  94.7  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  38.46 
 
 
184 aa  94.7  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  37.06 
 
 
152 aa  94.4  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  35.95 
 
 
151 aa  93.6  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  39.73 
 
 
148 aa  93.2  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  39.73 
 
 
145 aa  93.6  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  35.95 
 
 
151 aa  93.6  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  40.41 
 
 
145 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  38.82 
 
 
145 aa  92.8  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  44.55 
 
 
143 aa  92  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  43.12 
 
 
144 aa  92  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  40.28 
 
 
145 aa  91.7  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2796  heat shock protein  40.94 
 
 
152 aa  91.7  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300285  normal  0.746249 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  38.02 
 
 
166 aa  91.7  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  39.73 
 
 
145 aa  91.3  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  41.26 
 
 
165 aa  91.3  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  38.69 
 
 
150 aa  90.9  6e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  39.31 
 
 
173 aa  90.9  7e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  34.44 
 
 
189 aa  90.9  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1159  heat shock protein Hsp20  33.97 
 
 
148 aa  90.5  8e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000413054  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1743  heat shock protein Hsp20  44.8 
 
 
145 aa  90.9  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.49982  normal  0.0110244 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2086  heat shock protein, Hsp20 family  44.8 
 
 
145 aa  90.9  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  35.1 
 
 
189 aa  90.5  8e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
176 aa  90.5  8e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  44.95 
 
 
151 aa  90.1  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  37.04 
 
 
162 aa  90.5  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  38.19 
 
 
146 aa  89.4  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  39.81 
 
 
153 aa  89.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  38.57 
 
 
164 aa  89  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  39.42 
 
 
156 aa  89  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  33.77 
 
 
189 aa  88.6  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3805  heat shock protein Hsp20  45.45 
 
 
158 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4528  heat shock protein Hsp20  38.27 
 
 
181 aa  88.2  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.550609  normal  0.0462291 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  34.44 
 
 
189 aa  87.8  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4395  heat shock protein Hsp20  38.27 
 
 
181 aa  88.2  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481666  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3498  heat shock protein Hsp20  44.55 
 
 
158 aa  87.4  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2118  heat shock protein Hsp20  39.31 
 
 
166 aa  87.4  8e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  37.32 
 
 
146 aa  87.4  8e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4310  heat shock protein Hsp20  36.77 
 
 
166 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4550  heat shock protein Hsp20  36.77 
 
 
166 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0320  heat shock protein Hsp20  41.79 
 
 
150 aa  87  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3882  heat shock protein Hsp20  44.95 
 
 
158 aa  87  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.545217  normal  0.180827 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5291  heat shock protein Hsp20  38.99 
 
 
199 aa  86.3  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.060881  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  36.13 
 
 
171 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  33.77 
 
 
189 aa  86.3  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0247  heat shock protein Hsp20  48.18 
 
 
148 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2940  heat shock protein Hsp20  35.42 
 
 
168 aa  85.5  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  35.14 
 
 
141 aa  85.5  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  35.19 
 
 
162 aa  85.1  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3527  putative HspC2 heat shock protein  39.01 
 
 
173 aa  85.5  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3241  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
166 aa  85.1  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.406826  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1967  heat shock protein Hsp20  39.72 
 
 
178 aa  85.1  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  36.77 
 
 
162 aa  85.1  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0267  heat shock protein Hsp20  48.18 
 
 
148 aa  85.1  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.216974 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  38.64 
 
 
134 aa  85.1  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0257  heat shock protein Hsp20  48.18 
 
 
148 aa  85.1  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4943  heat shock protein Hsp20  37.88 
 
 
149 aa  84.7  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0508199 
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  35.19 
 
 
162 aa  84.3  6e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0154  heat shock protein Hsp20  39.44 
 
 
156 aa  84.3  7e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184978  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  34.03 
 
 
160 aa  84  8e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  34.03 
 
 
160 aa  84  8e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  35.21 
 
 
134 aa  84  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4467  heat shock protein Hsp20  39.39 
 
 
149 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  34.51 
 
 
167 aa  83.2  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  36.57 
 
 
177 aa  83.6  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4761  heat shock protein Hsp20  39.39 
 
 
149 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.735655  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>