More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0672 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0672  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
159 aa  316  7.999999999999999e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000109595  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  46 
 
 
153 aa  130  6e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  47.33 
 
 
149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0675  heat shock protein Hsp20  48.72 
 
 
163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000000558694  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3074  heat shock protein Hsp20  41.18 
 
 
144 aa  105  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3577  heat shock protein Hsp20  34.84 
 
 
157 aa  95.1  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.202692  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  42.45 
 
 
230 aa  87.8  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  37.21 
 
 
153 aa  84.7  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  33.56 
 
 
151 aa  84  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  34.96 
 
 
162 aa  84  9e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  34.42 
 
 
162 aa  82  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  38.56 
 
 
144 aa  82  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  34.15 
 
 
162 aa  82  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  36.81 
 
 
151 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  34.84 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  38.78 
 
 
144 aa  81.6  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  34.03 
 
 
148 aa  81.3  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2063  heat shock protein Hsp20  34.27 
 
 
155 aa  81.3  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.21571  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  36.09 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0463  heat shock protein Hsp20  35.4 
 
 
166 aa  80.9  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  35.95 
 
 
149 aa  79  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0460  heat shock protein Hsp20  33.55 
 
 
155 aa  78.6  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  36.77 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3336  heat shock protein Hsp20  38.18 
 
 
191 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0257  heat shock protein Hsp20  36.49 
 
 
148 aa  77.4  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0267  heat shock protein Hsp20  36.49 
 
 
148 aa  77.4  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.216974 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  30.61 
 
 
148 aa  77.4  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  32.43 
 
 
147 aa  77  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  39.67 
 
 
139 aa  76.6  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  35.53 
 
 
145 aa  77  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0247  heat shock protein Hsp20  35.37 
 
 
148 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  37.31 
 
 
148 aa  76.3  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  37.74 
 
 
150 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  35.48 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
204 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  46.24 
 
 
143 aa  76.3  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0540  heat shock protein Hsp20  32.43 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4451  heat shock protein Hsp20  34.64 
 
 
155 aa  75.9  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.209392  normal  0.216707 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  34.87 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0160  heat shock protein Hsp20  35 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.248861  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  32.84 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  36.11 
 
 
151 aa  74.7  0.0000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  36.11 
 
 
151 aa  74.7  0.0000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0306  heat shock protein Hsp20  39.25 
 
 
138 aa  74.7  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0420324 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4119  heat shock protein Hsp20  35.95 
 
 
149 aa  74.3  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303961 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  33.58 
 
 
147 aa  74.7  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  35.21 
 
 
145 aa  74.7  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1573  heat shock protein Hsp20  31.62 
 
 
173 aa  74.3  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00130938  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  33.12 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0454  heat shock protein Hsp20  34.21 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3323  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
228 aa  74.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  35.38 
 
 
195 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4128  heat shock protein Hsp20  28.97 
 
 
154 aa  74.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226976  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1698  heat shock protein Hsp20  40.95 
 
 
155 aa  73.9  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.010449 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1179  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
195 aa  73.9  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.285254  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  34.23 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  34.27 
 
 
165 aa  73.9  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  35.29 
 
 
158 aa  73.2  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  34.01 
 
 
194 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1159  heat shock protein Hsp20  31.72 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000413054  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  38.18 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0513  heat shock protein Hsp20  41.94 
 
 
147 aa  73.6  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  37.76 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3739  heat shock protein Hsp20  34.84 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0809036 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  34.51 
 
 
158 aa  73.2  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1354  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
134 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0222398  normal  0.226114 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2078  heat shock protein Hsp20  31.08 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  35.33 
 
 
146 aa  72.8  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  35.46 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  38.68 
 
 
147 aa  72  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2055  heat shock protein Hsp20  35.66 
 
 
146 aa  72  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  31.61 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0296  heat shock protein Hsp20  41.51 
 
 
143 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1631  heat shock protein Hsp20  34.44 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3460  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 
137 aa  70.9  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.895888  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0982  HSP20 family protein  38.04 
 
 
176 aa  70.5  0.000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  32.89 
 
 
185 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  32.88 
 
 
171 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1429  heat shock protein Hsp20  30 
 
 
169 aa  70.1  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0320  heat shock protein Hsp20  34.25 
 
 
150 aa  70.1  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  32.89 
 
 
185 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  32.65 
 
 
146 aa  70.1  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  32.65 
 
 
146 aa  70.1  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0008  Hsp  30.77 
 
 
146 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  30.61 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  32.24 
 
 
136 aa  69.7  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1142  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4943  heat shock protein Hsp20  33.88 
 
 
149 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0508199 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2683  heat shock protein Hsp20  34.87 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338339  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  34.01 
 
 
172 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  32.41 
 
 
148 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  35.17 
 
 
163 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  32.64 
 
 
173 aa  68.6  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  31.69 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3882  heat shock protein Hsp20  38.13 
 
 
158 aa  68.6  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.545217  normal  0.180827 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  32.64 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4819  heat shock protein Hsp20  29.46 
 
 
218 aa  68.2  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1758  heat shock protein Hsp20  33.13 
 
 
223 aa  68.2  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1967  heat shock protein Hsp20  30.83 
 
 
178 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>