More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1179 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1179  heat shock protein Hsp20  100 
 
 		 195 aa  377  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.285254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5291  heat shock protein Hsp20  66.45 
 
 		 199 aa  202  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.060881  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0247  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 		 148 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0267  heat shock protein Hsp20  49.52 
 
 		 148 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.216974 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0257  heat shock protein Hsp20  49.52 
 
 		 148 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3739  heat shock protein Hsp20  44.22 
 
 		 182 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0809036 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10254  heat shock protein hsp (heat-stress-induced ribosome-binding protein A)  42.66 
 
 		 159 aa  96.3  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.024543 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0306  heat shock protein Hsp20  42.67 
 
 		 138 aa  95.5  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0420324 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0296  heat shock protein Hsp20  41.04 
 
 		 143 aa  94.4  9e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0388  heat shock protein Hsp20  42.75 
 
 		 150 aa  91.7  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.865112  normal  0.488414 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  40.27 
 
 		 153 aa  89.7  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  41.18 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4451  heat shock protein Hsp20  36.55 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.209392  normal  0.216707 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2276  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 		 175 aa  80.9  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  32.62 
 
 		 151 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1018  heat shock protein Hsp20  34.04 
 
 		 177 aa  76.6  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.683731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  35.17 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  29.03 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  27.15 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  35.76 
 
 		 185 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  33.56 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  28.1 
 
 		 147 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  32.39 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0672  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 159 aa  73.9  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000109595  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3074  heat shock protein Hsp20  39.86 
 
 		 144 aa  73.9  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  36.17 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  34.23 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3882  heat shock protein Hsp20  42.59 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.545217  normal  0.180827 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1983  heat shock protein Hsp20  31.72 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00684856  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  32.65 
 
 		 147 aa  72  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  31.91 
 
 		 186 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  32.24 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  32.67 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3527  putative HspC2 heat shock protein  35.77 
 
 		 173 aa  71.2  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5491  heat shock protein Hsp20  38.52 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710483  normal  0.352797 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  36.3 
 
 		 165 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  29.14 
 
 		 147 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25770  heat shock Hsp20 protein  31.91 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  31.97 
 
 		 147 aa  70.9  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  27.15 
 
 		 148 aa  70.9  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  30.87 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  38.52 
 
 		 157 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0008  Hsp  29.41 
 
 		 146 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3241  heat shock protein Hsp20  33.56 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.406826  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0675  heat shock protein Hsp20  37.76 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000000558694  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  32.86 
 
 		 177 aa  69.3  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6093  heat shock protein Hsp20  32.84 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  31.97 
 
 		 163 aa  68.2  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2384  heat shock protein Hsp20  31.33 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3498  heat shock protein Hsp20  40.74 
 
 		 158 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3076  heat shock protein Hsp20  27.67 
 
 		 173 aa  67  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  31.5 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6390  heat shock protein Hsp20  32.84 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.065602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3805  heat shock protein Hsp20  40.74 
 
 		 158 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  30.3 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  30.66 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4816  Molecular chaperone (small heat shock protein)- like protein  42.16 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  29.41 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  29.41 
 
 		 148 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2802  heat shock protein Hsp20  32.43 
 
 		 167 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.20157 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2600  putative heat shock protein Hsp20  32.09 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  33.33 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3577  heat shock protein Hsp20  38.1 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.202692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  33.33 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  30.99 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1698  heat shock protein Hsp20  37.35 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.010449 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  32.67 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  34.35 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  30.99 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  33.57 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  33.57 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0735  heat shock protein Hsp20  30.61 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000037192  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2505  heat shock protein Hsp20  33.59 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.239492  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  30.84 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  29.8 
 
 		 162 aa  64.3  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  34.25 
 
 		 171 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3612  hypothetical protein  29.49 
 
 		 177 aa  64.3  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  32.9 
 
 		 143 aa  64.3  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  31.37 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  30 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  29.1 
 
 		 144 aa  63.9  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2462  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 168 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0466294  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  31.69 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4310  heat shock protein Hsp20  32.88 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4550  heat shock protein Hsp20  32.88 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  35.1 
 
 		 173 aa  63.9  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0320  heat shock protein Hsp20  31.37 
 
 		 150 aa  63.9  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  27.4 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  27.4 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  35.24 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1805  heat shock protein Hsp20  38.95 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal  0.803886 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0599  heat shock protein Hsp20  29.55 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.187967  normal  0.122676 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  30.47 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  29.36 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2940  heat shock protein Hsp20  32.43 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0358  Hsp20-like molecular chaperone  34.55 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0924  heat shock protein  32.47 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2809  heat shock protein Hsp20  40.86 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105088  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4380  heat shock protein Hsp20  41.94 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.642417  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4761  heat shock protein Hsp20  41.94 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.735655  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>