More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0306 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0306  heat shock protein Hsp20  100 
 
 		 138 aa  274  2e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0420324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0247  heat shock protein Hsp20  60.74 
 
 		 148 aa  148  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0267  heat shock protein Hsp20  60 
 
 		 148 aa  146  8e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.216974 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0257  heat shock protein Hsp20  60 
 
 		 148 aa  146  8e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0296  heat shock protein Hsp20  54.86 
 
 		 143 aa  142  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0388  heat shock protein Hsp20  51.01 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.865112  normal  0.488414 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3739  heat shock protein Hsp20  54.73 
 
 		 182 aa  137  4.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0809036 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10254  heat shock protein hsp (heat-stress-induced ribosome-binding protein A)  48.1 
 
 		 159 aa  122  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.024543 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5291  heat shock protein Hsp20  51.85 
 
 		 199 aa  102  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.060881  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1179  heat shock protein Hsp20  42.67 
 
 		 195 aa  95.5  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.285254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  36.57 
 
 		 153 aa  77  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  34.93 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  40.57 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  37.86 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  30.34 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0672  heat shock protein Hsp20  39.25 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000109595  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  38.4 
 
 		 141 aa  74.3  0.0000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  33.59 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  42.06 
 
 		 152 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2809  heat shock protein Hsp20  51.81 
 
 		 149 aa  73.6  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105088  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  29.66 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  34.25 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  37.04 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  36 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  42.34 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  31.47 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  38.89 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  39.45 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  41.59 
 
 		 163 aa  70.9  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  39.29 
 
 		 164 aa  70.5  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  33.96 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  36.79 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2796  heat shock protein  44.21 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300285  normal  0.746249 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4812  heat shock protein Hsp20  37.17 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00238667  normal  0.807841 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  33.65 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  32.61 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3074  heat shock protein Hsp20  39.29 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  39.45 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  35.85 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  39.81 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  35.51 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3577  heat shock protein Hsp20  36.45 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.202692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22940  molecular chaperone (small heat shock protein)  36.36 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.558061  normal  0.436135 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  34.85 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  38.53 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  34.85 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3882  heat shock protein Hsp20  45.05 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.545217  normal  0.180827 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0362  heat shock protein Hsp20  36.79 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.025472  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  34.58 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0343  heat shock protein Hsp20  36.79 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90555e-28 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  36.11 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3038  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.86939 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  38.32 
 
 		 150 aa  67  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0143  heat shock protein Hsp20  40 
 
 		 156 aa  67  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3805  heat shock protein Hsp20  39.09 
 
 		 158 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  35.66 
 
 		 146 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0403  heat shock protein Hsp20  35.34 
 
 		 138 aa  66.6  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1568  heat shock protein Hsp20  39.62 
 
 		 251 aa  67  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.458268 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  31.37 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3498  heat shock protein Hsp20  39.09 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3386  heat shock protein Hsp20  37.3 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  30.83 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  32.85 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  34.91 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1268  heat shock protein Hsp20  33.06 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.972795  normal  0.261941 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  28.21 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  30.71 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  30.71 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1698  heat shock protein Hsp20  36.3 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.010449 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  30.48 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3312  heat shock protein, putative  34.35 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.275059 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1029  Hsp20/alpha crystallin family protein  36 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00339514  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  30.94 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2938  heat shock protein Hsp20  31.3 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000491843  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0891  heat shock protein Hsp20  32.58 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.805469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  34.78 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  34.43 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1445  putative heat shock protein  41.57 
 
 		 167 aa  65.1  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000891901  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  31.19 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  30.39 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  31.54 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0675  heat shock protein Hsp20  41.6 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000000558694  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  41.76 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  40 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  41.76 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1706  heat shock protein Hsp20  33.06 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00808314  hitchhiker  0.000432661 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  33.62 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4023  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  32.61 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4061  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2704  heat shock protein Hsp20  37 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.923873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3661  heat shock protein Hsp20  37.93 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3076  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 		 173 aa  63.9  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4816  Molecular chaperone (small heat shock protein)- like protein  35.29 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  33.7 
 
 		 162 aa  63.9  0.0000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0833  heat shock protein Hsp20  37.08 
 
 		 169 aa  63.9  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  38.84 
 
 		 185 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  38.84 
 
 		 185 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1098  heat shock protein Hsp20  41 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.358342 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>