More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1268 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1268  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
148 aa  299  7.000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.972795  normal  0.261941 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  35.88 
 
 
148 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  31.01 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  31.51 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2836  heat shock protein Hsp20  28.28 
 
 
197 aa  71.2  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00556978  normal  0.209218 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
143 aa  70.9  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  34.23 
 
 
147 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  27.54 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  28.77 
 
 
149 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  35.07 
 
 
146 aa  68.2  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3386  heat shock protein Hsp20  30.08 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  28.77 
 
 
148 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  33.98 
 
 
184 aa  67.8  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  31.06 
 
 
180 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  31.69 
 
 
141 aa  67  0.00000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3461  heat shock protein Hsp20  34.23 
 
 
122 aa  67  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.798121  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0306  heat shock protein Hsp20  33.06 
 
 
138 aa  66.2  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0420324 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  34.26 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  34.82 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  28.77 
 
 
151 aa  66.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  33.93 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3312  heat shock protein, putative  29.92 
 
 
129 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.275059 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1738  small HspC2 heat shock protein  31.29 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.267785  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2798  small HspC2 heat shock protein  31.29 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.159343  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1159  heat shock protein Hsp20  31.62 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000413054  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  34.35 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3882  heat shock protein Hsp20  32.43 
 
 
158 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.545217  normal  0.180827 
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  31.82 
 
 
162 aa  64.7  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  34.55 
 
 
230 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  27.78 
 
 
189 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  31.82 
 
 
162 aa  64.3  0.0000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  26.39 
 
 
189 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0513  heat shock protein Hsp20  32.43 
 
 
147 aa  63.9  0.0000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  34.03 
 
 
163 aa  63.9  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  34.26 
 
 
143 aa  63.5  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  32.32 
 
 
162 aa  63.5  0.0000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  30.28 
 
 
166 aa  63.5  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0423  heat shock protein Hsp20  34.69 
 
 
152 aa  63.2  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.943695  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  33.33 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5291  heat shock protein Hsp20  41.94 
 
 
199 aa  62.8  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.060881  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  31.19 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  30 
 
 
147 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2796  heat shock protein  29.63 
 
 
152 aa  63.2  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300285  normal  0.746249 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1973  heat shock protein Hsp20  35.11 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.287455  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  28.06 
 
 
146 aa  62.4  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  30.47 
 
 
148 aa  62.8  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  28.06 
 
 
146 aa  62.4  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  33.63 
 
 
160 aa  62  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  26.87 
 
 
189 aa  62.4  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  30.15 
 
 
185 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0389  heat shock protein Hsp20  29.5 
 
 
166 aa  62.4  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  30.15 
 
 
185 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  33.63 
 
 
160 aa  62  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  33.04 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1179  heat shock protein Hsp20  34.33 
 
 
195 aa  61.6  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.285254  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6104  heat shock protein Hsp20  33.93 
 
 
158 aa  62  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0296  heat shock protein Hsp20  33.88 
 
 
143 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  31.34 
 
 
156 aa  61.2  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  32.11 
 
 
156 aa  61.2  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  32.14 
 
 
145 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  32.74 
 
 
151 aa  61.2  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  32.74 
 
 
151 aa  61.2  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1474  heat shock protein Hsp20  28.19 
 
 
151 aa  61.2  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.242626  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  26.21 
 
 
143 aa  61.2  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1174  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
139 aa  60.8  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0247  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
148 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  27.82 
 
 
189 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0267  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
148 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.216974 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  27.46 
 
 
147 aa  60.8  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0257  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
148 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  30.37 
 
 
142 aa  60.8  0.000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  28.47 
 
 
189 aa  60.5  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  28.18 
 
 
185 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0720  heat shock protein Hsp20  32.14 
 
 
120 aa  60.1  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00436062  normal  0.512737 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0388  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
150 aa  60.5  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.865112  normal  0.488414 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  22.22 
 
 
146 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  27.46 
 
 
147 aa  60.1  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0343  heat shock protein Hsp20  30.53 
 
 
144 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90555e-28 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  33.63 
 
 
158 aa  59.7  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2207  heat shock protein Hsp20  32.98 
 
 
129 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.540832  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0320  heat shock protein Hsp20  29.05 
 
 
150 aa  59.7  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0454  heat shock protein Hsp20  28.12 
 
 
144 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  27.56 
 
 
152 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  27.14 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  26.5 
 
 
157 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3739  heat shock protein Hsp20  37.4 
 
 
182 aa  59.3  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0809036 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  29.91 
 
 
145 aa  58.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  27.46 
 
 
162 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  30.08 
 
 
147 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0622  HSP20 family protein  33.65 
 
 
132 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0362  heat shock protein Hsp20  29.77 
 
 
144 aa  58.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.025472  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4649  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.54341  normal  0.729236 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3805  heat shock protein Hsp20  28.44 
 
 
158 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  30.28 
 
 
176 aa  58.9  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  25.64 
 
 
177 aa  58.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3076  heat shock protein Hsp20  23.78 
 
 
173 aa  58.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3498  heat shock protein Hsp20  30 
 
 
158 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28412  22-kDa heat-shock protein  37.76 
 
 
195 aa  58.5  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>