More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0257 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_0267  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
148 aa  296  5e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.216974 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0257  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
148 aa  296  5e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0247  heat shock protein Hsp20  99.32 
 
 
148 aa  295  2e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0296  heat shock protein Hsp20  68.24 
 
 
143 aa  201  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10254  heat shock protein hsp (heat-stress-induced ribosome-binding protein A)  66.46 
 
 
159 aa  190  6e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.024543 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0388  heat shock protein Hsp20  63.58 
 
 
150 aa  183  6e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.865112  normal  0.488414 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0306  heat shock protein Hsp20  60 
 
 
138 aa  146  8e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0420324 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3739  heat shock protein Hsp20  57.97 
 
 
182 aa  146  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0809036 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5291  heat shock protein Hsp20  53.33 
 
 
199 aa  111  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.060881  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1179  heat shock protein Hsp20  49.52 
 
 
195 aa  102  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.285254  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  41.04 
 
 
149 aa  88.2  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2809  heat shock protein Hsp20  41.38 
 
 
149 aa  82.4  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105088  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  43.52 
 
 
153 aa  82  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3074  heat shock protein Hsp20  44.85 
 
 
144 aa  81.3  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4816  Molecular chaperone (small heat shock protein)- like protein  47.37 
 
 
143 aa  80.5  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59096  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  38.3 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1698  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
155 aa  78.2  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.010449 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3661  heat shock protein Hsp20  47.06 
 
 
157 aa  78.2  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0672  heat shock protein Hsp20  36.49 
 
 
159 aa  77.4  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000109595  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  36.89 
 
 
231 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  36.09 
 
 
148 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22940  molecular chaperone (small heat shock protein)  45.24 
 
 
131 aa  75.9  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.558061  normal  0.436135 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  35.16 
 
 
149 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  36.45 
 
 
150 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1796  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0576694  normal  0.0264597 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  34.75 
 
 
143 aa  75.1  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  33.58 
 
 
144 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  38.61 
 
 
180 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  37.59 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  35.34 
 
 
144 aa  72.4  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2796  heat shock protein  37.69 
 
 
152 aa  71.6  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300285  normal  0.746249 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  34.82 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1098  heat shock protein Hsp20  37.25 
 
 
143 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.358342 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  34.82 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4761  heat shock protein Hsp20  37.86 
 
 
149 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.735655  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4467  heat shock protein Hsp20  37.86 
 
 
149 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1374  heat shock protein Hsp20  38.16 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.2364  normal  0.511095 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  36.88 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  35.09 
 
 
185 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4380  heat shock protein Hsp20  37.86 
 
 
149 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.642417  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1109  heat shock protein Hsp20  37.25 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223131  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12068  heat shock protein hspX  46.74 
 
 
144 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3577  heat shock protein Hsp20  41.03 
 
 
157 aa  70.9  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.202692  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  38.74 
 
 
143 aa  70.9  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  39.45 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
176 aa  70.9  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0143  heat shock protein Hsp20  41.67 
 
 
156 aa  70.5  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  33.94 
 
 
147 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  33.81 
 
 
144 aa  70.5  0.000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  33.64 
 
 
147 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4812  heat shock protein Hsp20  33.06 
 
 
155 aa  70.5  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00238667  normal  0.807841 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2049  heat shock protein Hsp20  31.72 
 
 
164 aa  69.7  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000140473  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  34.13 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  33.85 
 
 
166 aa  69.3  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  35.11 
 
 
146 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  34.13 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  31.06 
 
 
189 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  32.73 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06090  small heat shock protein  34.15 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.473161  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 
166 aa  68.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2276  heat shock protein Hsp20  40.35 
 
 
175 aa  68.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2335  heat shock protein Hsp20  43.9 
 
 
142 aa  68.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517765  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  27.66 
 
 
162 aa  69.3  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  30.28 
 
 
189 aa  68.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4128  heat shock protein Hsp20  30.53 
 
 
154 aa  68.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226976  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  34.27 
 
 
189 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0833  heat shock protein Hsp20  39.8 
 
 
169 aa  68.6  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  33.57 
 
 
189 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1983  heat shock protein Hsp20  35.04 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00684856  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  33.77 
 
 
230 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4413  heat shock protein Hsp20  33.58 
 
 
150 aa  67.8  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  35.96 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  35.04 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  33.94 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
189 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  34.75 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  35.97 
 
 
151 aa  67.4  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0675  heat shock protein Hsp20  48.18 
 
 
163 aa  67  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000000558694  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  37.04 
 
 
147 aa  66.6  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  33.9 
 
 
156 aa  67  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  38.95 
 
 
163 aa  67  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  36.54 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0362  heat shock protein Hsp20  37.36 
 
 
144 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.025472  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4451  heat shock protein Hsp20  34.04 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.209392  normal  0.216707 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  29.13 
 
 
162 aa  66.2  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  38.26 
 
 
157 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0343  heat shock protein Hsp20  36.56 
 
 
144 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90555e-28 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  36.54 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2120  heat shock protein Hsp20  48.24 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0258725  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  38.89 
 
 
194 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  32.33 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3917  heat shock protein Hsp20  28.23 
 
 
142 aa  65.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1805  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal  0.803886 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4943  heat shock protein Hsp20  36.62 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0508199 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  36.45 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  38.32 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  36.45 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>