More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1738 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1738  small HspC2 heat shock protein  100 
 
 
189 aa  385  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.267785  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2798  small HspC2 heat shock protein  100 
 
 
189 aa  385  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.159343  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  46.2 
 
 
184 aa  173  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  43.85 
 
 
189 aa  153  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  43.48 
 
 
189 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  42.93 
 
 
189 aa  151  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  42.39 
 
 
189 aa  150  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  42.39 
 
 
189 aa  149  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  40.32 
 
 
176 aa  130  7.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2836  heat shock protein Hsp20  34.34 
 
 
197 aa  121  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00556978  normal  0.209218 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  34.41 
 
 
173 aa  107  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  33.87 
 
 
166 aa  106  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  35.97 
 
 
230 aa  99  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  35.57 
 
 
156 aa  97.4  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2600  putative heat shock protein Hsp20  41.07 
 
 
187 aa  97.1  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207676  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  32.62 
 
 
172 aa  94.7  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  35.33 
 
 
165 aa  95.1  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  35.48 
 
 
149 aa  94.7  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  34.9 
 
 
204 aa  94.4  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  42.2 
 
 
153 aa  94.4  9e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  36.43 
 
 
147 aa  94  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  35.76 
 
 
185 aa  94  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  35.76 
 
 
185 aa  94  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  34.57 
 
 
176 aa  94  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2118  heat shock protein Hsp20  34.05 
 
 
166 aa  92.8  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
195 aa  93.2  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  37.01 
 
 
147 aa  93.2  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  34.15 
 
 
150 aa  93.2  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2462  heat shock protein Hsp20  37.09 
 
 
168 aa  92.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0466294  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  34.23 
 
 
146 aa  92.4  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2276  heat shock protein Hsp20  34.29 
 
 
175 aa  92.4  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  42.06 
 
 
144 aa  91.3  7e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  34.19 
 
 
153 aa  91.7  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  36.3 
 
 
147 aa  90.5  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0924  heat shock protein  32.58 
 
 
180 aa  90.5  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  36.3 
 
 
147 aa  90.9  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  32.85 
 
 
134 aa  89.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  34.23 
 
 
151 aa  89.7  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  37.74 
 
 
144 aa  89.7  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  34.23 
 
 
151 aa  89.7  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  34.67 
 
 
171 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5194  heat shock protein Hsp20  34.9 
 
 
169 aa  89.4  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987038  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  34.23 
 
 
194 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  34.11 
 
 
139 aa  89.4  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  35.61 
 
 
145 aa  89.4  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  35.45 
 
 
185 aa  89  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  34.62 
 
 
139 aa  88.6  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6093  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
187 aa  88.2  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  33.61 
 
 
148 aa  87.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  29.25 
 
 
149 aa  87  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  33.58 
 
 
134 aa  87.8  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6390  heat shock protein Hsp20  36.61 
 
 
187 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.065602 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  36.3 
 
 
148 aa  86.7  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  36.97 
 
 
166 aa  87  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  37.17 
 
 
153 aa  85.9  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1429  heat shock protein Hsp20  32.77 
 
 
169 aa  85.9  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3882  heat shock protein Hsp20  32.62 
 
 
158 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.545217  normal  0.180827 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4528  heat shock protein Hsp20  32.6 
 
 
181 aa  85.5  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.550609  normal  0.0462291 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4395  heat shock protein Hsp20  32.6 
 
 
181 aa  85.5  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481666  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  39.05 
 
 
160 aa  85.1  5e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  39.05 
 
 
160 aa  85.1  5e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0622  HSP20 family protein  34.31 
 
 
132 aa  85.5  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  35.95 
 
 
231 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  33.81 
 
 
142 aa  85.1  6e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  35.95 
 
 
186 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2940  heat shock protein Hsp20  35.57 
 
 
168 aa  84.7  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  30.27 
 
 
167 aa  84.7  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  39.05 
 
 
143 aa  84.3  9e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  36.7 
 
 
143 aa  84  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  38.46 
 
 
139 aa  84  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3527  putative HspC2 heat shock protein  32.68 
 
 
173 aa  82.8  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  31.4 
 
 
177 aa  83.2  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  30.81 
 
 
169 aa  82.8  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4310  heat shock protein Hsp20  34.76 
 
 
166 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4550  heat shock protein Hsp20  34.76 
 
 
166 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  35.04 
 
 
147 aa  83.2  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  36.19 
 
 
162 aa  83.2  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  39.62 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  30.81 
 
 
162 aa  82.4  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  31.69 
 
 
150 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3498  heat shock protein Hsp20  30.77 
 
 
158 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  35.78 
 
 
141 aa  82.4  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0675  heat shock protein Hsp20  34.9 
 
 
163 aa  82.4  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000000558694  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25770  heat shock Hsp20 protein  29.61 
 
 
198 aa  82.4  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  34.44 
 
 
158 aa  82  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1029  Hsp20/alpha crystallin family protein  36.89 
 
 
146 aa  82  0.000000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00339514  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2281  heat shock protein Hsp20  32.86 
 
 
173 aa  81.6  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.78764  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1806  small heat shock protein  34.97 
 
 
152 aa  82  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  35.96 
 
 
147 aa  82  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  34.29 
 
 
162 aa  81.6  0.000000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1983  heat shock protein Hsp20  41.51 
 
 
153 aa  81.6  0.000000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00684856  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3805  heat shock protein Hsp20  30.77 
 
 
158 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  36.19 
 
 
146 aa  81.6  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  36.19 
 
 
146 aa  81.6  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0296  heat shock protein Hsp20  34.26 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  41.05 
 
 
158 aa  81.3  0.000000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  37.96 
 
 
151 aa  81.3  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0859  heat shock protein Hsp20  41.6 
 
 
153 aa  81.3  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  37.38 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  35.77 
 
 
142 aa  81.3  0.000000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>