More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2320 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
149 aa  292  1e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  88.89 
 
 
153 aa  256  6e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0675  heat shock protein Hsp20  69.59 
 
 
163 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000000558694  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3074  heat shock protein Hsp20  60.27 
 
 
144 aa  150  5e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0672  heat shock protein Hsp20  47.33 
 
 
159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000109595  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  43.05 
 
 
230 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3577  heat shock protein Hsp20  41.03 
 
 
157 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.202692  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  40.94 
 
 
151 aa  107  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  37.32 
 
 
146 aa  105  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  37.32 
 
 
146 aa  105  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
144 aa  105  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
158 aa  103  9e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  37.24 
 
 
149 aa  103  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  35.17 
 
 
147 aa  102  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  42.4 
 
 
147 aa  101  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  42.4 
 
 
147 aa  100  5e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  39.33 
 
 
176 aa  100  9e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  40.46 
 
 
150 aa  99.4  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  38.03 
 
 
144 aa  99  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  37.32 
 
 
148 aa  98.6  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  41.46 
 
 
142 aa  96.7  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  37.84 
 
 
156 aa  95.5  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  38.35 
 
 
139 aa  95.5  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  37.82 
 
 
194 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  42.99 
 
 
150 aa  95.9  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2796  heat shock protein  44.63 
 
 
152 aa  95.5  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300285  normal  0.746249 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  42.62 
 
 
148 aa  94.4  5e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  33.1 
 
 
147 aa  94  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  36.96 
 
 
164 aa  94  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2250  heat shock protein Hsp20  38.46 
 
 
178 aa  94  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1967  heat shock protein Hsp20  38.46 
 
 
178 aa  94  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0463  heat shock protein Hsp20  42.19 
 
 
166 aa  93.6  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  42.06 
 
 
153 aa  93.6  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  39.44 
 
 
195 aa  93.6  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  34.25 
 
 
160 aa  92.8  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4128  heat shock protein Hsp20  34.09 
 
 
154 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226976  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  37.06 
 
 
145 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  34.25 
 
 
160 aa  92.8  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  35.03 
 
 
204 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  40.91 
 
 
143 aa  92.8  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  37.76 
 
 
145 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  40.71 
 
 
172 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  37.19 
 
 
142 aa  92.4  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0936  heat shock protein Hsp20  38.73 
 
 
155 aa  91.7  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.172536  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  32.41 
 
 
147 aa  91.7  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  37.06 
 
 
145 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
189 aa  91.3  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  35.46 
 
 
184 aa  91.3  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2276  heat shock protein Hsp20  41.33 
 
 
175 aa  90.9  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  35.48 
 
 
151 aa  90.5  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 
147 aa  90.9  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3323  heat shock protein Hsp20  39.74 
 
 
228 aa  90.5  7e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4395  heat shock protein Hsp20  39.31 
 
 
181 aa  90.5  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481666  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4528  heat shock protein Hsp20  39.31 
 
 
181 aa  90.5  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.550609  normal  0.0462291 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  35 
 
 
147 aa  90.1  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  36.88 
 
 
143 aa  90.1  9e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  35.66 
 
 
189 aa  90.1  9e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0539  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 
161 aa  89.7  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
189 aa  89.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3336  heat shock protein Hsp20  42.06 
 
 
191 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  32.45 
 
 
189 aa  88.6  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  41.88 
 
 
153 aa  89  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14610  heat shock protein Hsp20  32.28 
 
 
143 aa  89  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000610495  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  40.43 
 
 
165 aa  89  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 
145 aa  88.6  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0267  heat shock protein Hsp20  41.04 
 
 
148 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.216974 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  39.5 
 
 
156 aa  88.2  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0257  heat shock protein Hsp20  41.04 
 
 
148 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  36.88 
 
 
145 aa  88.2  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  33.77 
 
 
189 aa  87.8  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  35.82 
 
 
158 aa  87.8  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0793  heat shock protein Hsp20  37.24 
 
 
136 aa  87.8  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.515708  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  33.56 
 
 
151 aa  87.8  5e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  33.56 
 
 
151 aa  87.8  5e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1159  heat shock protein Hsp20  34.38 
 
 
148 aa  87.4  6e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000413054  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3527  putative HspC2 heat shock protein  38.06 
 
 
173 aa  87.4  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  40.57 
 
 
141 aa  87.4  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2940  heat shock protein Hsp20  35.66 
 
 
168 aa  87  7e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  34.58 
 
 
162 aa  87.4  7e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
152 aa  86.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  37.96 
 
 
158 aa  86.7  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1796  heat shock protein Hsp20  38.57 
 
 
157 aa  86.3  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0576694  normal  0.0264597 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0247  heat shock protein Hsp20  40.3 
 
 
148 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  35.81 
 
 
185 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2086  heat shock protein, Hsp20 family  44.72 
 
 
145 aa  86.3  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1743  heat shock protein Hsp20  44.72 
 
 
145 aa  86.3  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.49982  normal  0.0110244 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3498  heat shock protein Hsp20  41.73 
 
 
158 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  37.59 
 
 
146 aa  86.7  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  35.81 
 
 
185 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  34.27 
 
 
151 aa  86.3  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3805  heat shock protein Hsp20  41.73 
 
 
158 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  36.62 
 
 
143 aa  85.5  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  36.81 
 
 
171 aa  84.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  33.57 
 
 
148 aa  85.5  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  35.25 
 
 
134 aa  84.7  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  36.43 
 
 
143 aa  85.1  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4816  Molecular chaperone (small heat shock protein)- like protein  48.04 
 
 
143 aa  84.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59096  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  35.17 
 
 
169 aa  84.7  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  38.51 
 
 
177 aa  84.7  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3739  heat shock protein Hsp20  41.67 
 
 
182 aa  84.7  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0809036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>