More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1029 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1029  Hsp20/alpha crystallin family protein  100 
 
 
146 aa  296  5e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00339514  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
176 aa  97.4  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  37.17 
 
 
156 aa  95.1  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  37.88 
 
 
143 aa  92.8  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  39.47 
 
 
158 aa  92.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  38.93 
 
 
142 aa  92.4  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  33.59 
 
 
150 aa  92  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  37.23 
 
 
184 aa  92  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0539  heat shock protein Hsp20  35.34 
 
 
161 aa  91.3  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  37.31 
 
 
156 aa  89  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  36.94 
 
 
153 aa  87.8  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0391  heat shock protein Hsp20  41.03 
 
 
151 aa  87  7e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  38.89 
 
 
143 aa  87  8e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  39.42 
 
 
151 aa  85.9  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6319  heat shock protein Hsp20  40.18 
 
 
149 aa  85.9  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
148 aa  85.1  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  36.84 
 
 
169 aa  84.7  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  39.05 
 
 
147 aa  84  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5194  heat shock protein Hsp20  33.82 
 
 
169 aa  84  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987038  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  37.14 
 
 
147 aa  82.8  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  39.81 
 
 
148 aa  82.8  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  39.81 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  34.09 
 
 
189 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  35.56 
 
 
149 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3386  heat shock protein Hsp20  41.12 
 
 
147 aa  82.4  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  37.27 
 
 
177 aa  82  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  37.14 
 
 
147 aa  82  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  34.09 
 
 
189 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  34.85 
 
 
189 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3612  hypothetical protein  33.94 
 
 
177 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  34.48 
 
 
146 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
176 aa  80.9  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  38.71 
 
 
185 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  38.71 
 
 
185 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0320  heat shock protein Hsp20  34.35 
 
 
150 aa  80.5  0.000000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4395  heat shock protein Hsp20  38.17 
 
 
181 aa  80.1  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481666  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4528  heat shock protein Hsp20  38.17 
 
 
181 aa  80.1  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.550609  normal  0.0462291 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  37.17 
 
 
142 aa  79.7  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  32.09 
 
 
149 aa  79.7  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  32.58 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
167 aa  79.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  35.88 
 
 
145 aa  79  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2078  heat shock protein Hsp20  33.86 
 
 
147 aa  79  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0233  small heat shock protein  40.78 
 
 
145 aa  78.6  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.818598  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  38.14 
 
 
231 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1695  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
151 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4310  heat shock protein Hsp20  40.83 
 
 
166 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4550  heat shock protein Hsp20  40.83 
 
 
166 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  32.03 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2281  heat shock protein Hsp20  32.35 
 
 
173 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.78764  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  34.62 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  42.57 
 
 
166 aa  78.2  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  26.39 
 
 
162 aa  77.8  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  32.69 
 
 
151 aa  77.4  0.00000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  32.69 
 
 
151 aa  77.4  0.00000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  38.14 
 
 
186 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  33.64 
 
 
147 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2940  heat shock protein Hsp20  34.81 
 
 
168 aa  77.4  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
189 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  26.39 
 
 
162 aa  77.4  0.00000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3527  putative HspC2 heat shock protein  39.81 
 
 
173 aa  77.4  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  32.31 
 
 
189 aa  77.4  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4413  heat shock protein Hsp20  36.61 
 
 
150 aa  77  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3125  heat shock protein Hsp20  38.24 
 
 
149 aa  77  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3074  heat shock protein Hsp20  35.38 
 
 
144 aa  76.6  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  36.89 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0593  heat shock protein Hsp20  34.21 
 
 
191 aa  76.6  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.95349  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2683  heat shock protein Hsp20  35.82 
 
 
145 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338339  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  38.32 
 
 
166 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  31.21 
 
 
158 aa  76.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0296  heat shock protein Hsp20  29.1 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  33.65 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1660  heat shock protein Hsp20  31.58 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.870911  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  36.79 
 
 
150 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2321  stress response protein  28.47 
 
 
513 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2462  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0466294  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  27.59 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  34.91 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4462  heat shock protein Hsp20  36.79 
 
 
132 aa  75.9  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0463  heat shock protein Hsp20  32.62 
 
 
166 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  35.29 
 
 
134 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1738  small HspC2 heat shock protein  36.89 
 
 
189 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.267785  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2798  small HspC2 heat shock protein  36.89 
 
 
189 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.159343  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0924  heat shock protein  40.74 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  31.29 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  36.04 
 
 
134 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  35.88 
 
 
146 aa  74.7  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  35.45 
 
 
141 aa  74.7  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2210  heat shock protein Hsp20  32.86 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0417447  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  32.69 
 
 
158 aa  74.3  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4198  heat shock protein Hsp20  32.09 
 
 
152 aa  74.3  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  34.95 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2118  heat shock protein Hsp20  35.2 
 
 
166 aa  74.3  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  34.55 
 
 
148 aa  74.3  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0179  heat shock protein Hsp20  31.78 
 
 
149 aa  73.9  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  41.75 
 
 
153 aa  73.9  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  32.12 
 
 
141 aa  73.9  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1528  heat shock protein Hsp20  32.12 
 
 
153 aa  73.9  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00309172  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  32.69 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>