More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3612 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3612  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  360  9e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  40.49 
 
 		 186 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  40.49 
 
 		 231 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  39.38 
 
 		 177 aa  121  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2276  heat shock protein Hsp20  41.67 
 
 		 175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1018  heat shock protein Hsp20  36.16 
 
 		 177 aa  118  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.683731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0924  heat shock protein  41.4 
 
 		 180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  36.25 
 
 		 176 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3527  putative HspC2 heat shock protein  35.75 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25770  heat shock Hsp20 protein  37.5 
 
 		 198 aa  108  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  41.33 
 
 		 149 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4395  heat shock protein Hsp20  36.78 
 
 		 181 aa  107  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4528  heat shock protein Hsp20  36.78 
 
 		 181 aa  107  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.550609  normal  0.0462291 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  35.03 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  38.93 
 
 		 147 aa  99.8  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  38.67 
 
 		 147 aa  97.8  8e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  37.18 
 
 		 156 aa  97.4  8e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  36.73 
 
 		 148 aa  95.5  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  34.42 
 
 		 147 aa  92.8  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  32.73 
 
 		 163 aa  91.3  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0296  heat shock protein Hsp20  33.12 
 
 		 156 aa  90.9  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6104  heat shock protein Hsp20  38.69 
 
 		 158 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  34.94 
 
 		 172 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0982  HSP20 family protein  36.31 
 
 		 176 aa  88.2  6e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  33.99 
 
 		 185 aa  88.2  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  33.99 
 
 		 185 aa  88.2  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0686  heat shock protein HSP20  35.29 
 
 		 153 aa  87.8  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2559  hypothetical protein  28.82 
 
 		 164 aa  87  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  33.54 
 
 		 150 aa  87  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2414  hypothetical protein  28.76 
 
 		 164 aa  86.7  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  32.5 
 
 		 143 aa  85.9  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  38.39 
 
 		 153 aa  85.1  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  35.03 
 
 		 204 aa  85.1  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3882  heat shock protein Hsp20  36.84 
 
 		 158 aa  85.1  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.545217  normal  0.180827 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  34.39 
 
 		 143 aa  85.1  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  32.92 
 
 		 143 aa  85.1  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  32.21 
 
 		 189 aa  85.1  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  40.71 
 
 		 134 aa  84.7  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  38.14 
 
 		 134 aa  84.3  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  41.12 
 
 		 185 aa  84  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  34.62 
 
 		 151 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3580  molecular chaperone (small heat shock protein)  32.05 
 
 		 141 aa  84  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  35.71 
 
 		 143 aa  84  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  35.78 
 
 		 162 aa  83.6  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3805  heat shock protein Hsp20  39.64 
 
 		 158 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  30.14 
 
 		 142 aa  84  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  41.51 
 
 		 148 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3498  heat shock protein Hsp20  38.74 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  29.53 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  32.21 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  38.18 
 
 		 132 aa  82.4  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  33.78 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  40.95 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1573  heat shock protein Hsp20  37.27 
 
 		 173 aa  82  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00130938  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  32.28 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  40 
 
 		 166 aa  82  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  32.37 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  41.51 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  33.94 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  33.54 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  30.87 
 
 		 189 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  33.11 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1029  Hsp20/alpha crystallin family protein  33.94 
 
 		 146 aa  80.9  0.000000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00339514  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0389  heat shock protein Hsp20  35.24 
 
 		 166 aa  80.9  0.000000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  34.84 
 
 		 144 aa  80.5  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  30.82 
 
 		 195 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1429  heat shock protein Hsp20  33.56 
 
 		 169 aa  80.1  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  32.12 
 
 		 145 aa  80.5  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  33.96 
 
 		 162 aa  80.9  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  31.48 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 169 aa  79.7  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  40.57 
 
 		 145 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  38.26 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  32.93 
 
 		 141 aa  80.1  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  36.19 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  40.37 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  32.69 
 
 		 163 aa  79.7  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0609  heat shock protein Hsp20  42.45 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.346897  normal  0.0142886 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  30.5 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3917  heat shock protein Hsp20  37.74 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  31.01 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1704  heat shock protein Hsp20  38.93 
 
 		 140 aa  79  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  39.62 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  38.89 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0160  heat shock protein Hsp20  44.34 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.248861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0179  heat shock protein Hsp20  38.98 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  30.91 
 
 		 171 aa  78.2  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5151  heat shock protein Hsp20  30.77 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184623  normal  0.32984 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  30.06 
 
 		 151 aa  78.2  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  27.45 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  34.64 
 
 		 167 aa  78.2  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  37.86 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  37.86 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6319  heat shock protein Hsp20  33.91 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  30.34 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  32.7 
 
 		 164 aa  77  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  26.8 
 
 		 147 aa  77  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  31.65 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4669  heat shock protein Hsp20  41.9 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>