More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3125 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_3125  heat shock protein Hsp20  100 
 
 		 149 aa  299  7.000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1695  heat shock protein Hsp20  51.66 
 
 		 151 aa  166  8e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2938  heat shock protein Hsp20  48.32 
 
 		 145 aa  142  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000491843  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1509  heat shock protein Hsp20  44.53 
 
 		 148 aa  110  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000196437  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0588  heat shock protein, molecular chaperone  46.38 
 
 		 141 aa  111  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.648467  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  42.25 
 
 		 139 aa  100  7e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  43.08 
 
 		 139 aa  97.1  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3113  heat shock protein Hsp20  43.2 
 
 		 142 aa  96.7  9e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.800815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  37.23 
 
 		 139 aa  95.1  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2459  heat shock protein Hsp20  42.4 
 
 		 142 aa  93.2  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.134169  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1292  heat shock protein Hsp20  41.61 
 
 		 170 aa  90.5  7e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0518729  normal  0.504399 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2210  heat shock protein Hsp20  37.96 
 
 		 139 aa  90.1  9e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0417447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0539  heat shock protein Hsp20  38.24 
 
 		 161 aa  89.7  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1660  heat shock protein Hsp20  38.24 
 
 		 145 aa  88.6  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.870911  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  42.28 
 
 		 146 aa  88.6  3e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2372  heat shock protein, Hsp20 family  38.41 
 
 		 145 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0601479  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  40.65 
 
 		 134 aa  88.6  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19240  heat shock protein Hsp20  45.86 
 
 		 144 aa  87.8  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00295622  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1869  putative small heat shock protein  39.52 
 
 		 142 aa  88.2  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309197  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2043  heat shock protein  37.68 
 
 		 145 aa  87.4  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467829  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2290  HSP20 family protein  37.68 
 
 		 145 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.581771  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2159  heat shock protein Hsp20  41.13 
 
 		 139 aa  87.4  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2045  heat shock protein  37.68 
 
 		 145 aa  87  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00409698  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2287  heat shock protein, Hsp20 family  37.68 
 
 		 145 aa  87  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.58706e-24 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1059  stress response protein  43.62 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2106  HSP20 family protein  37.68 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.291359  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2035  stress response protein  43.62 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1345  stress response protein  43.62 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.260788  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1432  HSP20/alpha crystallin family protein  43.62 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.614633  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3093  heat shock protein  43.62 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2262  HSP20 family protein  37.68 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.378643  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2325  stress response protein  43.62 
 
 		 141 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3219  heat shock protein  43.62 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008501  STER_B1  molecular chaperone (small heat shock protein)  38.85 
 
 		 142 aa  86.3  1e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1110  heat shock protein Hsp20  37.41 
 
 		 145 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.339847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0250  HSP20 family protein  41.13 
 
 		 139 aa  85.5  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.962825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2321  stress response protein  39.62 
 
 		 513 aa  85.5  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6319  heat shock protein Hsp20  38.52 
 
 		 149 aa  85.5  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0289  heat shock protein Hsp20  36.17 
 
 		 148 aa  85.9  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0247001  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  39.02 
 
 		 134 aa  85.1  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2242  heat shock protein, Hsp20 family  36.23 
 
 		 145 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00889609  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  36.3 
 
 		 150 aa  84.3  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  38.71 
 
 		 132 aa  83.6  8e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  44.76 
 
 		 158 aa  83.6  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5914  heat shock protein Hsp20  41.51 
 
 		 144 aa  83.6  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0664313  normal  0.562292 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1149  heat shock protein Hsp20  43.27 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1219  heat shock protein Hsp20  43.27 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2312  heat shock protein Hsp20  45 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1706  heat shock protein Hsp20  39.02 
 
 		 132 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00808314  hitchhiker  0.000432661 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  38.21 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6187  heat shock protein Hsp20  43.62 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.306682 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19940  molecular chaperone (small heat shock protein)  39.37 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.618399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1983  heat shock protein Hsp20  41.84 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00684856  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  38.17 
 
 		 148 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2058  heat shock protein Hsp20  40 
 
 		 141 aa  80.5  0.000000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0622  HSP20 family protein  37.9 
 
 		 132 aa  80.1  0.000000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  37.4 
 
 		 147 aa  80.1  0.000000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  36.15 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  36.15 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  35.81 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  39.84 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  34.88 
 
 		 136 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1165  heat shock protein Hsp20  38.81 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.245253  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0200  putative small HEAT shock protein  41.48 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.32202 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  45.1 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1537  heat shock protein Hsp20  47.37 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2301  heat shock protein Hsp20  40.52 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0630  heat shock protein Hsp20  39.53 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1167  heat shock protein Hsp20  39.23 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3917  heat shock protein Hsp20  36.75 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0756  heat shock protein Hsp20  39.52 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.16256 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1806  heat shock protein Hsp20  37.01 
 
 		 139 aa  77  0.00000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.332989  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1029  Hsp20/alpha crystallin family protein  38.24 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00339514  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0463  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0593  heat shock protein Hsp20  37.07 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.95349  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1199  heat shock protein Hsp20  41.67 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.76992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0184  molecular chaperone (small heat shock protein)  36.8 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000642495  hitchhiker  0.000185759 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  34.78 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6221  heat shock protein Hsp20  40.83 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0836  heat shock protein Hsp20  37.4 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.414458 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  38.78 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4382  heat shock protein Hsp20  44.23 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4514  heat shock protein Hsp20  44.23 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.165488  normal  0.480818 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  33.07 
 
 		 184 aa  73.9  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3751  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 150 aa  73.6  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.544355  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2411  heat shock protein Hsp20  37.86 
 
 		 145 aa  73.6  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1122  heat shock protein Hsp20  39.22 
 
 		 170 aa  73.6  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.421321  n/a   
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0008  Hsp  33.08 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2458  heat shock protein Hsp20  37.86 
 
 		 145 aa  73.6  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1368  heat shock molecular chaperone  33.33 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  37.86 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  37.12 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  34.56 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  35.78 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  37.04 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0513  heat shock protein Hsp20  42.27 
 
 		 147 aa  72  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2863  heat shock protein Hsp20  31.06 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.203152  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  41 
 
 		 146 aa  72  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  41 
 
 		 146 aa  72  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1307  heat shock protein Hsp20  35 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>