More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2312 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2312  heat shock protein Hsp20  100 
 
 		 149 aa  307  2.9999999999999997e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0630  heat shock protein Hsp20  58.67 
 
 		 138 aa  173  8e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2459  heat shock protein Hsp20  59.85 
 
 		 142 aa  157  6e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.134169  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1165  heat shock protein Hsp20  57.04 
 
 		 145 aa  154  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.245253  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1292  heat shock protein Hsp20  57.14 
 
 		 170 aa  152  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0518729  normal  0.504399 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3113  heat shock protein Hsp20  59.09 
 
 		 142 aa  152  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.800815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1869  putative small heat shock protein  50 
 
 		 142 aa  147  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1167  heat shock protein Hsp20  55.63 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6187  heat shock protein Hsp20  50 
 
 		 144 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.306682 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1059  stress response protein  49.33 
 
 		 144 aa  144  5e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2035  stress response protein  49.33 
 
 		 144 aa  144  5e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1345  stress response protein  49.33 
 
 		 144 aa  144  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.260788  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3093  heat shock protein  49.33 
 
 		 144 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1432  HSP20/alpha crystallin family protein  49.33 
 
 		 144 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.614633  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3219  heat shock protein  49.33 
 
 		 144 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5914  heat shock protein Hsp20  50.67 
 
 		 144 aa  143  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0664313  normal  0.562292 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1110  heat shock protein Hsp20  50 
 
 		 145 aa  142  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.339847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2325  stress response protein  48.98 
 
 		 141 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2321  stress response protein  48 
 
 		 513 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2301  heat shock protein Hsp20  54.92 
 
 		 142 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1537  heat shock protein Hsp20  49.33 
 
 		 142 aa  130  6e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2058  heat shock protein Hsp20  53.03 
 
 		 141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1199  heat shock protein Hsp20  51.64 
 
 		 143 aa  127  7.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.76992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4514  heat shock protein Hsp20  42.95 
 
 		 140 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.165488  normal  0.480818 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0200  putative small HEAT shock protein  42.95 
 
 		 140 aa  122  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.32202 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4382  heat shock protein Hsp20  42.95 
 
 		 140 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1149  heat shock protein Hsp20  40.67 
 
 		 140 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1219  heat shock protein Hsp20  40.67 
 
 		 140 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1370  small heat shock protein  42.38 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0982961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0539  heat shock protein Hsp20  37.16 
 
 		 161 aa  102  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  36.96 
 
 		 136 aa  98.6  3e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  36.99 
 
 		 158 aa  97.1  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  39.35 
 
 		 153 aa  94.4  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  35.53 
 
 		 156 aa  93.6  8e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  44.96 
 
 		 139 aa  92.4  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  35.33 
 
 		 145 aa  92.4  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1983  heat shock protein Hsp20  38.26 
 
 		 153 aa  92.4  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00684856  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1396  molecular chaperone-like protein  40.68 
 
 		 152 aa  91.7  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0936  heat shock protein Hsp20  36.84 
 
 		 155 aa  90.5  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.172536  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0463  heat shock protein Hsp20  36.42 
 
 		 166 aa  89.7  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  34.23 
 
 		 146 aa  89.7  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  34.23 
 
 		 146 aa  89.7  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  39.13 
 
 		 141 aa  89.4  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1347  heat shock protein Hsp20  38 
 
 		 148 aa  88.6  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.452932  normal  0.819182 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1648  heat shock protein, Hsp20 family  38 
 
 		 148 aa  88.6  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715277  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  36.99 
 
 		 143 aa  88.6  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  38.16 
 
 		 142 aa  88.6  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3125  heat shock protein Hsp20  46.23 
 
 		 149 aa  87  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2049  heat shock protein Hsp20  34.84 
 
 		 164 aa  84.7  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000140473  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  32.43 
 
 		 147 aa  84.7  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0320  heat shock protein Hsp20  38.26 
 
 		 150 aa  84.3  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1743  heat shock protein Hsp20  34.69 
 
 		 145 aa  84  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.49982  normal  0.0110244 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2086  heat shock protein, Hsp20 family  34.69 
 
 		 145 aa  84  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  38.68 
 
 		 146 aa  82.8  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3386  heat shock protein Hsp20  34.53 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0289  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0247001  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4761  heat shock protein Hsp20  33.58 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.735655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4943  heat shock protein Hsp20  34.31 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0508199 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4380  heat shock protein Hsp20  33.58 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.642417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4467  heat shock protein Hsp20  33.58 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1573  heat shock protein Hsp20  32.88 
 
 		 173 aa  82  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00130938  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  36.3 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  31.76 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  32.43 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1695  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 151 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1805  heat shock protein Hsp20  32.61 
 
 		 149 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal  0.803886 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0391  heat shock protein Hsp20  34.4 
 
 		 151 aa  80.5  0.000000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2043  heat shock protein  37.1 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467829  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0370  heat shock protein Hsp20  32.12 
 
 		 140 aa  80.1  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.733353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  43.69 
 
 		 151 aa  80.1  0.000000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  43.69 
 
 		 151 aa  80.1  0.000000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2106  HSP20 family protein  37.1 
 
 		 145 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.291359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2262  HSP20 family protein  37.1 
 
 		 145 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.378643  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2242  heat shock protein, Hsp20 family  37.1 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00889609  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2290  HSP20 family protein  37.1 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.581771  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2045  heat shock protein  37.1 
 
 		 145 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00409698  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2287  heat shock protein, Hsp20 family  37.1 
 
 		 145 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.58706e-24 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  31.78 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2372  heat shock protein, Hsp20 family  37.1 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0601479  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  31.82 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  41 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0540  heat shock protein Hsp20  31.08 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0588  heat shock protein, molecular chaperone  36.07 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.648467  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  35.38 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4669  heat shock protein Hsp20  31.88 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1509  heat shock protein Hsp20  40.32 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000196437  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  33.59 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4198  heat shock protein Hsp20  32.45 
 
 		 152 aa  78.6  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  30.46 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  32.81 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3917  heat shock protein Hsp20  34.96 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  30.2 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  30.32 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1429  heat shock protein Hsp20  30.71 
 
 		 169 aa  77.4  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 		 148 aa  77.4  0.00000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  32.81 
 
 		 166 aa  77.4  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>