More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3917 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3917  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
142 aa  288  2e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5151  heat shock protein Hsp20  56.62 
 
 
148 aa  158  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184623  normal  0.32984 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3751  response regulator receiver protein  48.23 
 
 
150 aa  134  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.544355  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0836  heat shock protein Hsp20  47.41 
 
 
149 aa  134  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.414458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0370  heat shock protein Hsp20  46.53 
 
 
140 aa  130  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.733353  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6319  heat shock protein Hsp20  45.93 
 
 
149 aa  130  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4413  heat shock protein Hsp20  45.86 
 
 
150 aa  127  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06090  small heat shock protein  42.96 
 
 
148 aa  115  3e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.473161  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1697  hypothetical protein  44.09 
 
 
145 aa  108  3e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6221  heat shock protein Hsp20  41.6 
 
 
151 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0233  small heat shock protein  52.25 
 
 
145 aa  106  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.818598  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2899  heat shock protein Hsp20  47.66 
 
 
145 aa  106  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0174584 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2326  heat shock protein Hsp20  45 
 
 
144 aa  101  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0663504 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  38.26 
 
 
143 aa  94.7  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
141 aa  92  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  36.52 
 
 
143 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  44.44 
 
 
147 aa  89.4  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  40.17 
 
 
139 aa  89.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  41.96 
 
 
139 aa  89  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  42.42 
 
 
147 aa  88.6  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  33.59 
 
 
139 aa  86.7  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  35.29 
 
 
145 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  38.74 
 
 
151 aa  85.1  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  41.96 
 
 
136 aa  84.7  3e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  34.96 
 
 
143 aa  84.7  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  34.91 
 
 
176 aa  84.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  33.91 
 
 
145 aa  84  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  42 
 
 
163 aa  84  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4132  heat shock protein Hsp20  37.21 
 
 
144 aa  84  7e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  42.57 
 
 
134 aa  83.6  9e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  33.85 
 
 
185 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  40.54 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  33.85 
 
 
185 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  39.22 
 
 
145 aa  82.8  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2559  hypothetical protein  36.36 
 
 
164 aa  83.2  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2414  hypothetical protein  36.36 
 
 
164 aa  83.2  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  37.86 
 
 
147 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  33.88 
 
 
145 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  37.27 
 
 
147 aa  82.8  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  34.51 
 
 
134 aa  82  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  33.06 
 
 
145 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  40.21 
 
 
176 aa  80.5  0.000000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  36.19 
 
 
147 aa  80.1  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  31.39 
 
 
153 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0513  heat shock protein Hsp20  35.96 
 
 
147 aa  80.1  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3612  hypothetical protein  37.74 
 
 
177 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  37.7 
 
 
142 aa  78.6  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  32.69 
 
 
144 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  36.84 
 
 
147 aa  77.8  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  37.37 
 
 
149 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  32.82 
 
 
231 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2210  heat shock protein Hsp20  34.07 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0417447  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0296  heat shock protein Hsp20  35.9 
 
 
156 aa  77  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  33.93 
 
 
189 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  36.84 
 
 
147 aa  77  0.00000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2049  heat shock protein Hsp20  35 
 
 
164 aa  77  0.00000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000140473  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  35.24 
 
 
151 aa  77  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  34 
 
 
146 aa  77  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4061  heat shock protein Hsp20  31.71 
 
 
147 aa  77  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  32.82 
 
 
186 aa  76.6  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4023  heat shock protein Hsp20  31.71 
 
 
147 aa  77  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  35.88 
 
 
148 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5150  heat shock protein Hsp20  31.43 
 
 
146 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2836  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
197 aa  76.3  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00556978  normal  0.209218 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  33.96 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  35.29 
 
 
150 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  34.62 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4951  heat shock protein Hsp20  42.39 
 
 
134 aa  75.9  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260746  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  29.77 
 
 
150 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  32.06 
 
 
189 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  37.14 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  35.9 
 
 
146 aa  75.9  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  36.89 
 
 
148 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  33.02 
 
 
189 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1706  heat shock protein Hsp20  37.96 
 
 
132 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00808314  hitchhiker  0.000432661 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  33.91 
 
 
139 aa  75.1  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0460  heat shock protein Hsp20  32.03 
 
 
155 aa  75.1  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  34 
 
 
148 aa  74.7  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  36.08 
 
 
177 aa  75.1  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2938  heat shock protein Hsp20  38.05 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000491843  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  34 
 
 
148 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1247  HSP20 family protein  32.12 
 
 
145 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3047  HSP20 family protein  32.12 
 
 
145 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0624  HSP20 family protein  32.12 
 
 
145 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1441  HSP20 family protein  32.12 
 
 
145 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1472  HSP20 family protein  32.12 
 
 
145 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.287102  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0530  HSP20 family protein  32.12 
 
 
145 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  37.11 
 
 
146 aa  73.9  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  37.11 
 
 
146 aa  73.9  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0936  heat shock protein Hsp20  37.11 
 
 
155 aa  73.9  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.172536  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4650  heat shock protein Hsp20  33.58 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.761162 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  30.89 
 
 
166 aa  73.9  0.0000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1572  HSP20 family protein  32.12 
 
 
215 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.537516  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3125  heat shock protein Hsp20  38.24 
 
 
149 aa  73.6  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  37.96 
 
 
132 aa  73.6  0.0000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  32.08 
 
 
189 aa  73.6  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0183  heat shock protein Hsp20  37.37 
 
 
132 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0939501  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3063  heat shock protein Hsp20  33.01 
 
 
158 aa  73.6  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  35.25 
 
 
142 aa  73.6  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>