More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0588 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0588  heat shock protein, molecular chaperone  100 
 
 
141 aa  288  1e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.648467  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2938  heat shock protein Hsp20  48.37 
 
 
145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000491843  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1509  heat shock protein Hsp20  46.21 
 
 
148 aa  110  7.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000196437  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1695  heat shock protein Hsp20  39.33 
 
 
151 aa  108  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3125  heat shock protein Hsp20  52.04 
 
 
149 aa  103  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2043  heat shock protein  42.64 
 
 
145 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467829  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2242  heat shock protein, Hsp20 family  43.41 
 
 
145 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00889609  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2372  heat shock protein, Hsp20 family  42.64 
 
 
145 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0601479  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2290  HSP20 family protein  42.64 
 
 
145 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.581771  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2287  heat shock protein, Hsp20 family  42.64 
 
 
145 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.58706e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2106  HSP20 family protein  42.64 
 
 
145 aa  97.8  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.291359  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2045  heat shock protein  42.64 
 
 
145 aa  97.8  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00409698  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2262  HSP20 family protein  42.64 
 
 
145 aa  97.8  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.378643  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  44.35 
 
 
132 aa  95.9  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19240  heat shock protein Hsp20  48.48 
 
 
144 aa  93.6  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00295622  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0391  heat shock protein Hsp20  38.46 
 
 
151 aa  93.6  9e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1660  heat shock protein Hsp20  39.53 
 
 
145 aa  91.3  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.870911  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  36.99 
 
 
158 aa  90.9  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008501  STER_B1  molecular chaperone (small heat shock protein)  41.41 
 
 
142 aa  89.7  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  41.67 
 
 
139 aa  87  8e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0289  heat shock protein Hsp20  36.84 
 
 
148 aa  85.1  3e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0247001  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1149  heat shock protein Hsp20  37.9 
 
 
140 aa  84  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1219  heat shock protein Hsp20  37.9 
 
 
140 aa  84  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  37.61 
 
 
134 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  41.48 
 
 
139 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19940  molecular chaperone (small heat shock protein)  45.74 
 
 
149 aa  82  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.618399  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2321  stress response protein  43.16 
 
 
513 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0756  heat shock protein Hsp20  39.5 
 
 
132 aa  82  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.16256 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5914  heat shock protein Hsp20  44.21 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0664313  normal  0.562292 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0622  HSP20 family protein  39.13 
 
 
132 aa  80.9  0.000000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  36.13 
 
 
134 aa  80.5  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6187  heat shock protein Hsp20  44.21 
 
 
144 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.306682 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1368  heat shock molecular chaperone  35.71 
 
 
167 aa  79.7  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2035  stress response protein  43.16 
 
 
144 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3093  heat shock protein  43.16 
 
 
144 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3219  heat shock protein  43.16 
 
 
144 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2325  stress response protein  43.16 
 
 
141 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1059  stress response protein  43.16 
 
 
144 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1432  HSP20/alpha crystallin family protein  43.16 
 
 
144 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.614633  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1345  stress response protein  43.16 
 
 
144 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.260788  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  34.96 
 
 
146 aa  78.6  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  37.62 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  32.89 
 
 
146 aa  78.2  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  32.89 
 
 
146 aa  78.2  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  34.03 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1706  heat shock protein Hsp20  36.97 
 
 
132 aa  77  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00808314  hitchhiker  0.000432661 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2159  heat shock protein Hsp20  40.31 
 
 
139 aa  77  0.00000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  36.05 
 
 
147 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1533  heat shock protein Hsp20  41.35 
 
 
140 aa  76.3  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.207706  normal  0.208575 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0200  putative small HEAT shock protein  34.92 
 
 
140 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.32202 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1869  putative small heat shock protein  38.68 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309197  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0184  molecular chaperone (small heat shock protein)  32.58 
 
 
149 aa  76.3  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000642495  hitchhiker  0.000185759 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2683  heat shock protein Hsp20  38.1 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338339  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0630  heat shock protein Hsp20  36.84 
 
 
138 aa  76.3  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140987  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  38.19 
 
 
141 aa  75.1  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2301  heat shock protein Hsp20  41.9 
 
 
142 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46681  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1110  heat shock protein Hsp20  40.19 
 
 
145 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.339847  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09080  molecular chaperone (small heat shock protein)  38.61 
 
 
145 aa  74.7  0.0000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.675828  normal  0.433955 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  34.4 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1806  heat shock protein Hsp20  38.21 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.332989  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1292  heat shock protein Hsp20  36.3 
 
 
170 aa  73.9  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0518729  normal  0.504399 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  30.61 
 
 
153 aa  73.9  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0250  HSP20 family protein  34.62 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.962825  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1307  heat shock protein Hsp20  31.43 
 
 
143 aa  73.6  0.0000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  36.63 
 
 
150 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3113  heat shock protein Hsp20  36.92 
 
 
142 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.800815  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4514  heat shock protein Hsp20  35.78 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.165488  normal  0.480818 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4382  heat shock protein Hsp20  35.78 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  33.06 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  33.06 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0104  heat shock protein Hsp20  32.33 
 
 
144 aa  72.4  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.529827 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0539  heat shock protein Hsp20  34.06 
 
 
161 aa  72  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1537  heat shock protein Hsp20  43.52 
 
 
142 aa  72  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1199  heat shock protein Hsp20  42.27 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.76992  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  41.57 
 
 
184 aa  72.4  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2312  heat shock protein Hsp20  35.54 
 
 
149 aa  72  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 
147 aa  72  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2155  heat shock protein Hsp20  42.48 
 
 
132 aa  71.6  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1429  heat shock protein Hsp20  32.37 
 
 
169 aa  71.6  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5151  heat shock protein Hsp20  31.51 
 
 
148 aa  71.2  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184623  normal  0.32984 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2899  heat shock protein Hsp20  34.59 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0174584 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3460  heat shock protein Hsp20  36.52 
 
 
137 aa  71.6  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.895888  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  41.49 
 
 
166 aa  71.2  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0690  heat shock protein Hsp20  37.76 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202005  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0982  HSP20 family protein  38.1 
 
 
176 aa  70.9  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  36.89 
 
 
144 aa  70.5  0.000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0936  heat shock protein Hsp20  33.59 
 
 
155 aa  70.9  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.172536  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  32.43 
 
 
149 aa  70.5  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1029  Hsp20/alpha crystallin family protein  30.28 
 
 
146 aa  70.5  0.000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00339514  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0978  molecular chaperone (small heat shock protein)  37.04 
 
 
140 aa  70.5  0.000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1165  heat shock protein Hsp20  40.59 
 
 
145 aa  70.1  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.245253  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2458  heat shock protein Hsp20  37.62 
 
 
145 aa  70.1  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2411  heat shock protein Hsp20  37.62 
 
 
145 aa  70.1  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  34.15 
 
 
152 aa  70.1  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  34.95 
 
 
195 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3074  heat shock protein Hsp20  30.99 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  36.7 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  34.03 
 
 
151 aa  69.3  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2210  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0417447  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  35.14 
 
 
148 aa  69.3  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>