More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1706 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1706  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
132 aa  272  1.0000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00808314  hitchhiker  0.000432661 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  60.45 
 
 
134 aa  179  9.000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0622  HSP20 family protein  58.78 
 
 
132 aa  174  4e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  60.31 
 
 
132 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0756  heat shock protein Hsp20  62.6 
 
 
132 aa  168  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.16256 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  55.97 
 
 
134 aa  168  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2155  heat shock protein Hsp20  58.02 
 
 
132 aa  142  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2210  heat shock protein Hsp20  40.91 
 
 
139 aa  124  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0417447  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  41.01 
 
 
139 aa  125  3e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  45.45 
 
 
139 aa  124  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0250  HSP20 family protein  47.73 
 
 
139 aa  118  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.962825  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  41.98 
 
 
139 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2159  heat shock protein Hsp20  44.7 
 
 
139 aa  110  7.000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  42.98 
 
 
147 aa  98.2  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  46.94 
 
 
147 aa  95.1  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  32.39 
 
 
194 aa  93.6  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  43.3 
 
 
151 aa  92.8  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  42.02 
 
 
149 aa  92  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  41.13 
 
 
146 aa  91.7  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  41.13 
 
 
146 aa  91.7  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  36.72 
 
 
150 aa  90.9  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 
166 aa  90.9  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  41.8 
 
 
145 aa  90.5  8e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  32.39 
 
 
204 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  38.05 
 
 
147 aa  87.8  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  38.05 
 
 
147 aa  87.8  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  35.29 
 
 
148 aa  87.8  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  39.47 
 
 
147 aa  87.4  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  37.6 
 
 
142 aa  86.7  9e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  41.51 
 
 
153 aa  85.1  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3725  heat shock protein Hsp20  35 
 
 
143 aa  84.7  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.843054  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  30.99 
 
 
189 aa  84.3  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  44.66 
 
 
152 aa  84.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  39.47 
 
 
148 aa  84.3  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0513  heat shock protein Hsp20  36 
 
 
147 aa  84  6e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  40.78 
 
 
136 aa  83.6  9e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2938  heat shock protein Hsp20  40.5 
 
 
145 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000491843  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  30.28 
 
 
189 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0514  heat shock protein Hsp20  45.68 
 
 
141 aa  82  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  38.94 
 
 
143 aa  82  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  36.84 
 
 
141 aa  82  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  30.28 
 
 
189 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  35.14 
 
 
146 aa  82  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3125  heat shock protein Hsp20  41.07 
 
 
149 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  33.57 
 
 
167 aa  80.9  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  38 
 
 
148 aa  80.5  0.000000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  30.56 
 
 
189 aa  80.5  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  33.08 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1509  heat shock protein Hsp20  44.74 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000196437  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  35.45 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  40.38 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  34.53 
 
 
151 aa  79.7  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  31.16 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  29.58 
 
 
189 aa  79.7  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  34.53 
 
 
151 aa  79.7  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  31.16 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3580  molecular chaperone (small heat shock protein)  41.3 
 
 
141 aa  79  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 
162 aa  79  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  29.6 
 
 
147 aa  79.3  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  37.6 
 
 
145 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  35.83 
 
 
158 aa  78.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
153 aa  79  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  37.76 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  33.59 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  34.78 
 
 
165 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  34.48 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6104  heat shock protein Hsp20  35.11 
 
 
158 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
177 aa  78.2  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  36.8 
 
 
145 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  29.1 
 
 
166 aa  78.2  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  37.76 
 
 
162 aa  77.8  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  36.8 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  41.11 
 
 
231 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  28.8 
 
 
147 aa  77  0.00000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  34.95 
 
 
150 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  32.58 
 
 
143 aa  77  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  34.69 
 
 
156 aa  77  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  39.8 
 
 
163 aa  77  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0588  heat shock protein, molecular chaperone  36.97 
 
 
141 aa  77  0.00000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.648467  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  32.84 
 
 
143 aa  77  0.00000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2683  heat shock protein Hsp20  42.42 
 
 
145 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338339  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1165  heat shock protein Hsp20  38.74 
 
 
145 aa  76.6  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.245253  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3113  heat shock protein Hsp20  32.82 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.800815  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1869  putative small heat shock protein  35.38 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309197  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  41.11 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  37.23 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  31.85 
 
 
151 aa  76.3  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3498  heat shock protein Hsp20  36 
 
 
158 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3805  heat shock protein Hsp20  36 
 
 
158 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  40.2 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0362  heat shock protein Hsp20  38.68 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.025472  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  36.27 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  31.3 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0343  heat shock protein Hsp20  37.74 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90555e-28 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3917  heat shock protein Hsp20  37.96 
 
 
142 aa  75.1  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0936  heat shock protein Hsp20  32.52 
 
 
155 aa  75.1  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.172536  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2276  heat shock protein Hsp20  34.53 
 
 
175 aa  75.1  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3612  hypothetical protein  36.54 
 
 
177 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1110  heat shock protein Hsp20  33.09 
 
 
145 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.339847  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  28.24 
 
 
157 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>