More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0514 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0514  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
141 aa  283  5e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  45.95 
 
 
141 aa  97.4  5e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  42.98 
 
 
136 aa  92.8  1e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  41.41 
 
 
153 aa  88.2  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0513  heat shock protein Hsp20  42.06 
 
 
147 aa  87.8  5e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1706  heat shock protein Hsp20  41.67 
 
 
132 aa  86.7  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00808314  hitchhiker  0.000432661 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  44.79 
 
 
143 aa  84.3  5e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  40.86 
 
 
139 aa  84  7e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  36.29 
 
 
142 aa  82.4  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2210  heat shock protein Hsp20  40.86 
 
 
139 aa  82  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0417447  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  42.11 
 
 
134 aa  81.6  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  42.27 
 
 
139 aa  78.6  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  42.55 
 
 
148 aa  79.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3580  molecular chaperone (small heat shock protein)  33.07 
 
 
141 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3659  heat shock protein Hsp20  35.83 
 
 
158 aa  77.4  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.701015  normal  0.191586 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  38.95 
 
 
134 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  42.05 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  38.46 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4235  heat shock protein Hsp20  40.4 
 
 
143 aa  74.7  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.283869  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  34.04 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  36.17 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0539  heat shock protein Hsp20  35.42 
 
 
161 aa  74.3  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  39.78 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  39.36 
 
 
149 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  35.42 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  35.42 
 
 
147 aa  73.6  0.0000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0630  heat shock protein Hsp20  39.8 
 
 
138 aa  73.2  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140987  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  38.54 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
148 aa  72.8  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1199  heat shock protein Hsp20  41.24 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.76992  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3103  heat shock protein Hsp20  33.62 
 
 
137 aa  73.2  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.533921  normal  0.0104027 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1445  putative heat shock protein  32.22 
 
 
167 aa  72.8  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000891901  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0924  heat shock protein  37.37 
 
 
180 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0836  heat shock protein Hsp20  33.96 
 
 
149 aa  72  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.414458 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  35.11 
 
 
162 aa  72  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0833  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
169 aa  71.6  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  30 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  34.07 
 
 
146 aa  71.6  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  34.07 
 
 
146 aa  71.6  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6319  heat shock protein Hsp20  33.03 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2159  heat shock protein Hsp20  41.94 
 
 
139 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  34.65 
 
 
158 aa  70.9  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  31.09 
 
 
146 aa  70.9  0.000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  31.93 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0686  heat shock protein HSP20  38.24 
 
 
153 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  32.98 
 
 
162 aa  70.5  0.000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  37.23 
 
 
147 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0622  HSP20 family protein  35.11 
 
 
132 aa  70.1  0.000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2301  heat shock protein Hsp20  36.73 
 
 
142 aa  70.1  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46681  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  34.07 
 
 
145 aa  70.1  0.000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1170  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
170 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3612  hypothetical protein  35.19 
 
 
177 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2058  heat shock protein Hsp20  36.56 
 
 
141 aa  69.3  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  38.2 
 
 
132 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1537  heat shock protein Hsp20  37.89 
 
 
142 aa  69.3  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  32.08 
 
 
144 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0160  heat shock protein Hsp20  30.61 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.248861  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0250  HSP20 family protein  37.36 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.962825  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
150 aa  68.2  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  35.35 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2321  stress response protein  31.96 
 
 
513 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  33.71 
 
 
189 aa  67.4  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1167  heat shock protein Hsp20  36.73 
 
 
149 aa  67.4  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1292  heat shock protein Hsp20  31 
 
 
170 aa  67.4  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0518729  normal  0.504399 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  30 
 
 
149 aa  67.4  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  30.53 
 
 
189 aa  67.4  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3917  heat shock protein Hsp20  34.26 
 
 
142 aa  67.4  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  34.38 
 
 
176 aa  67.4  0.00000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4395  heat shock protein Hsp20  32.97 
 
 
181 aa  67  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481666  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4528  heat shock protein Hsp20  32.97 
 
 
181 aa  67  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.550609  normal  0.0462291 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0370  heat shock protein Hsp20  34.55 
 
 
140 aa  67  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.733353  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  35.48 
 
 
143 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  27.56 
 
 
189 aa  67  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3527  putative HspC2 heat shock protein  29.45 
 
 
173 aa  67  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1029  Hsp20/alpha crystallin family protein  26.81 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00339514  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4230  heat shock protein Hsp20  29.17 
 
 
105 aa  66.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3573  heat shock protein Hsp20  35.35 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0296  heat shock protein Hsp20  36.26 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  27.13 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  29.17 
 
 
158 aa  66.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  26.77 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  27.61 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2899  heat shock protein Hsp20  31.58 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0174584 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  29.47 
 
 
189 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16210  heat shock protein Hsp20  34.69 
 
 
163 aa  66.2  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221164  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1165  heat shock protein Hsp20  36.08 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.245253  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  34.62 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3600  heat shock protein Hsp20  30.3 
 
 
165 aa  65.5  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.484768  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2035  stress response protein  34.04 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3219  heat shock protein  34.04 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1432  HSP20/alpha crystallin family protein  34.04 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.614633  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1345  stress response protein  34.04 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.260788  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1983  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00684856  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1059  stress response protein  34.04 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  36.84 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2325  stress response protein  33.33 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2459  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.134169  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>