More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1445 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1445  putative heat shock protein  100 
 
 		 167 aa  344  4e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000891901  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0833  heat shock protein Hsp20  61.68 
 
 		 169 aa  221  4.9999999999999996e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1170  heat shock protein Hsp20  52.94 
 
 		 170 aa  191  5e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1732  HSP20 family protein  44.16 
 
 		 167 aa  128  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.371108  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1921  heat shock protein Hsp20  39.29 
 
 		 167 aa  116  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.985705  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2731  heat shock protein Hsp20  41.29 
 
 		 166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  41.09 
 
 		 148 aa  93.2  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  38.32 
 
 		 163 aa  92  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  36.52 
 
 		 150 aa  91.7  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  43.82 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 142 aa  89.4  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  34.81 
 
 		 147 aa  89.7  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  39.81 
 
 		 145 aa  88.6  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  37.23 
 
 		 142 aa  87.8  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  38 
 
 		 146 aa  87.8  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  38 
 
 		 146 aa  87.8  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  36.21 
 
 		 189 aa  86.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  36.21 
 
 		 189 aa  86.3  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  36.21 
 
 		 189 aa  84.7  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3312  heat shock protein, putative  35.2 
 
 		 129 aa  84.7  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.275059 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  35.34 
 
 		 189 aa  84.3  7e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  34.48 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  41.86 
 
 		 142 aa  80.1  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  43.9 
 
 		 157 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  39.22 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  44.71 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  38.83 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4128  heat shock protein Hsp20  36.89 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0296  heat shock protein Hsp20  38.95 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  38.46 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  31.37 
 
 		 204 aa  77.8  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0735  heat shock protein Hsp20  38.24 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000037192  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  40.82 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  39.33 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0184  heat shock protein Hsp20  33.97 
 
 		 160 aa  77.4  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.29101  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  32.38 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  38.78 
 
 		 194 aa  77.4  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2898  heat shock protein Hsp20  37.14 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.828136  normal  0.116226 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0686  heat shock protein HSP20  35.24 
 
 		 153 aa  77  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  38.83 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  47.19 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  38.83 
 
 		 147 aa  77  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  38.53 
 
 		 165 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  38 
 
 		 156 aa  77  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  36.84 
 
 		 176 aa  77  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  34.97 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2600  putative heat shock protein Hsp20  40.21 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  38.83 
 
 		 173 aa  75.9  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  39.29 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  38.71 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  32.38 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  40.45 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  36.89 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0423  heat shock protein Hsp20  35.58 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.943695  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  32.39 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2505  heat shock protein Hsp20  35.64 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.239492  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  40.45 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  37.62 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0389  heat shock protein Hsp20  35.54 
 
 		 166 aa  74.3  0.0000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  43.75 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  38.89 
 
 		 166 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  37.08 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1214  molecular chaperone (small heat shock protein)  40.19 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.318766  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  32.89 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  35.48 
 
 		 162 aa  73.6  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  44.58 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0690  heat shock protein Hsp20  39.22 
 
 		 147 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202005  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5491  heat shock protein Hsp20  41.18 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710483  normal  0.352797 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2462  heat shock protein Hsp20  37.39 
 
 		 168 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0466294  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4528  heat shock protein Hsp20  36.61 
 
 		 181 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.550609  normal  0.0462291 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0463  heat shock protein Hsp20  36.11 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4395  heat shock protein Hsp20  36.61 
 
 		 181 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  34.44 
 
 		 145 aa  72  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  44.94 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6319  heat shock protein Hsp20  41.57 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  37.25 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  34.74 
 
 		 230 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  44.94 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1122  heat shock protein Hsp20  39.8 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.421321  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4230  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 		 105 aa  72  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  36.67 
 
 		 141 aa  72  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1429  heat shock protein Hsp20  31.36 
 
 		 169 aa  72  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0008  Hsp  32.09 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1758  heat shock protein Hsp20  32.76 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  32.08 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  40 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2276  heat shock protein Hsp20  41.67 
 
 		 175 aa  71.2  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7806  putative small heat-shock protein molecular chaperone  32.74 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00540773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  30.1 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  33.01 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  37.36 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3336  heat shock protein Hsp20  36.46 
 
 		 191 aa  70.9  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  39.22 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2802  heat shock protein Hsp20  32.24 
 
 		 167 aa  70.5  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.20157 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  39.33 
 
 		 166 aa  70.9  0.000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3386  heat shock protein Hsp20  37.72 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  30.1 
 
 		 148 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  28.97 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  28.83 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>