More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2731 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2731  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
166 aa  342  1e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1921  heat shock protein Hsp20  52.12 
 
 
167 aa  179  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.985705  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1732  HSP20 family protein  48.05 
 
 
167 aa  154  8e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.371108  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1170  heat shock protein Hsp20  43.21 
 
 
170 aa  135  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0833  heat shock protein Hsp20  44.81 
 
 
169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1445  putative heat shock protein  41.29 
 
 
167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000891901  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3312  heat shock protein, putative  48.21 
 
 
129 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.275059 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  30.92 
 
 
184 aa  88.6  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  40.4 
 
 
146 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  49.48 
 
 
162 aa  86.3  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 
150 aa  86.7  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  38.18 
 
 
163 aa  85.5  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  35.21 
 
 
180 aa  85.5  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2401  heat shock protein Hsp20  43 
 
 
163 aa  84.7  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000662378  hitchhiker  0.00157329 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  44 
 
 
189 aa  84.3  7e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  44 
 
 
189 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  43.56 
 
 
166 aa  83.6  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  34.21 
 
 
144 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  43 
 
 
189 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  32.68 
 
 
189 aa  82.4  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3076  heat shock protein Hsp20  38.38 
 
 
173 aa  81.6  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  39.09 
 
 
176 aa  80.5  0.000000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4128  heat shock protein Hsp20  38.38 
 
 
154 aa  80.5  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226976  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4023  heat shock protein Hsp20  32.86 
 
 
147 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  42 
 
 
165 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0389  heat shock protein Hsp20  29.63 
 
 
166 aa  80.1  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4061  heat shock protein Hsp20  32.86 
 
 
147 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2049  heat shock protein Hsp20  33.56 
 
 
164 aa  79.7  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000140473  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  37.37 
 
 
146 aa  79  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3498  heat shock protein Hsp20  42.31 
 
 
158 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  36.61 
 
 
156 aa  79  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  37.37 
 
 
146 aa  79  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  40.66 
 
 
189 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  42.27 
 
 
147 aa  77.4  0.00000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1159  heat shock protein Hsp20  33.1 
 
 
148 aa  77.4  0.00000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000413054  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2657  heat shock protein Hsp20  38.68 
 
 
155 aa  77.4  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.498697  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  30.43 
 
 
169 aa  76.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3805  heat shock protein Hsp20  41.35 
 
 
158 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4812  heat shock protein Hsp20  35.35 
 
 
155 aa  76.3  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00238667  normal  0.807841 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1983  heat shock protein Hsp20  35.76 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00684856  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0296  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  38.83 
 
 
167 aa  75.9  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  41.24 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  26.97 
 
 
166 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  34.34 
 
 
148 aa  75.9  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  34.34 
 
 
148 aa  75.5  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  36.08 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  39.8 
 
 
171 aa  75.1  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4819  heat shock protein Hsp20  33.68 
 
 
218 aa  75.1  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3063  heat shock protein Hsp20  39.39 
 
 
158 aa  75.1  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  41 
 
 
194 aa  74.7  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2118  heat shock protein Hsp20  37.17 
 
 
166 aa  74.3  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  37.27 
 
 
186 aa  74.7  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3064  heat shock protein Hsp20  38.38 
 
 
166 aa  74.7  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5194  heat shock protein Hsp20  39.8 
 
 
169 aa  73.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987038  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  37.27 
 
 
231 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  30.46 
 
 
177 aa  73.2  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  30.46 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  33.83 
 
 
230 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3882  heat shock protein Hsp20  39.81 
 
 
158 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.545217  normal  0.180827 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0343  heat shock protein Hsp20  37.62 
 
 
144 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90555e-28 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6104  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
158 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0143  heat shock protein Hsp20  36.63 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0362  heat shock protein Hsp20  38.61 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.025472  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0184  heat shock protein Hsp20  31.33 
 
 
160 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.29101  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  36.54 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3061  heat shock protein Hsp20  38.38 
 
 
158 aa  72.8  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  37.25 
 
 
172 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0719  heat shock protein Hsp20  37.86 
 
 
137 aa  72.4  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00433386  normal  0.504335 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2796  heat shock protein  37.11 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300285  normal  0.746249 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  41.05 
 
 
204 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  36.89 
 
 
145 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  36.63 
 
 
152 aa  72  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2600  putative heat shock protein Hsp20  36.17 
 
 
187 aa  72  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207676  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  36.89 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  36.73 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  35.35 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  32.69 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  36.89 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2559  hypothetical protein  27.15 
 
 
164 aa  70.9  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  30.5 
 
 
148 aa  70.9  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2414  hypothetical protein  25.97 
 
 
164 aa  70.5  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2940  heat shock protein Hsp20  39.62 
 
 
168 aa  70.9  0.000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3612  hypothetical protein  32.11 
 
 
177 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  30.61 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  33.66 
 
 
176 aa  70.1  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  33.64 
 
 
162 aa  70.1  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  30.92 
 
 
149 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5491  heat shock protein Hsp20  34.95 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710483  normal  0.352797 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  33.65 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0924  heat shock protein  31.65 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0686  heat shock protein HSP20  35 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  33.64 
 
 
162 aa  68.9  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  32.73 
 
 
162 aa  68.9  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  28.93 
 
 
185 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  28.93 
 
 
185 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4119  heat shock protein Hsp20  30.87 
 
 
149 aa  68.9  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303961 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  34.62 
 
 
142 aa  68.6  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  31.29 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>