More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1732 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1732  HSP20 family protein  100 
 
 
167 aa  337  4e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.371108  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2731  heat shock protein Hsp20  48.05 
 
 
166 aa  154  8e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1921  heat shock protein Hsp20  42.07 
 
 
167 aa  138  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.985705  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0833  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 
169 aa  136  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1170  heat shock protein Hsp20  41.21 
 
 
170 aa  136  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3312  heat shock protein, putative  56.88 
 
 
129 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.275059 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1445  putative heat shock protein  44.16 
 
 
167 aa  128  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000891901  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3498  heat shock protein Hsp20  43.69 
 
 
158 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  40.35 
 
 
189 aa  88.2  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3805  heat shock protein Hsp20  43.69 
 
 
158 aa  88.6  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  40.35 
 
 
189 aa  88.2  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  41.23 
 
 
189 aa  86.7  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3882  heat shock protein Hsp20  34.34 
 
 
158 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.545217  normal  0.180827 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  46.6 
 
 
157 aa  84.3  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  40.62 
 
 
189 aa  84  9e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
176 aa  83.6  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  37.29 
 
 
189 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  39.39 
 
 
163 aa  83.6  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  36.22 
 
 
147 aa  83.2  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
150 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  36.22 
 
 
147 aa  82.8  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6104  heat shock protein Hsp20  42.72 
 
 
158 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  42.16 
 
 
165 aa  81.3  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  36.27 
 
 
153 aa  80.9  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
145 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  36.27 
 
 
142 aa  80.1  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  30.3 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  43.82 
 
 
230 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  36.54 
 
 
145 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5491  heat shock protein Hsp20  46.15 
 
 
211 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710483  normal  0.352797 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  37.89 
 
 
176 aa  78.6  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0389  heat shock protein Hsp20  40.22 
 
 
166 aa  78.6  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3336  heat shock protein Hsp20  35.83 
 
 
191 aa  78.2  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  35.58 
 
 
145 aa  78.2  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  32.84 
 
 
148 aa  77.8  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  32.84 
 
 
148 aa  77.8  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0296  heat shock protein Hsp20  41.94 
 
 
156 aa  77.4  0.00000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  35.29 
 
 
150 aa  77.4  0.00000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 
145 aa  76.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2863  heat shock protein Hsp20  40.66 
 
 
167 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.203152  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  32.35 
 
 
146 aa  76.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  32.35 
 
 
146 aa  76.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  39.22 
 
 
163 aa  75.9  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2049  heat shock protein Hsp20  38.04 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000140473  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4812  heat shock protein Hsp20  37.23 
 
 
155 aa  75.1  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00238667  normal  0.807841 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  33.61 
 
 
146 aa  75.5  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4128  heat shock protein Hsp20  31.58 
 
 
154 aa  75.1  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226976  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  37 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  39.05 
 
 
150 aa  75.1  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  32.56 
 
 
142 aa  74.7  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2898  heat shock protein Hsp20  35.29 
 
 
149 aa  74.7  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.828136  normal  0.116226 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  32.59 
 
 
180 aa  74.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1159  heat shock protein Hsp20  42 
 
 
148 aa  74.3  0.0000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000413054  n/a   
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0008  Hsp  33.04 
 
 
146 aa  74.3  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  33.33 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1528  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
153 aa  73.9  0.0000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00309172  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  34.19 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  36.27 
 
 
148 aa  73.6  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0184  heat shock protein Hsp20  31.25 
 
 
160 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.29101  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0982  HSP20 family protein  34 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4061  heat shock protein Hsp20  29.32 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  38.18 
 
 
171 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  33.05 
 
 
132 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2401  heat shock protein Hsp20  37.86 
 
 
163 aa  73.2  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000662378  hitchhiker  0.00157329 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2505  heat shock protein Hsp20  38.61 
 
 
138 aa  72.8  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.239492  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  29.58 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0926  heat shock protein Hsp20  36.89 
 
 
152 aa  72.8  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  30.7 
 
 
139 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3063  heat shock protein Hsp20  34.62 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4023  heat shock protein Hsp20  29.32 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  30.83 
 
 
162 aa  72.4  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  28.46 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  37.38 
 
 
148 aa  72.4  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  29.17 
 
 
156 aa  72  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  27.86 
 
 
144 aa  72  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2940  heat shock protein Hsp20  37.62 
 
 
168 aa  71.6  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  29.17 
 
 
195 aa  72  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0539  heat shock protein Hsp20  37 
 
 
161 aa  72  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4819  heat shock protein Hsp20  31.63 
 
 
218 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  37.89 
 
 
204 aa  71.6  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  44.32 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  30.93 
 
 
136 aa  71.2  0.000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  33.01 
 
 
166 aa  71.6  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  38.61 
 
 
152 aa  71.6  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1214  molecular chaperone (small heat shock protein)  37.38 
 
 
260 aa  71.2  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.318766  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  34.74 
 
 
142 aa  71.2  0.000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  32.48 
 
 
166 aa  71.2  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2408  HSP20 family protein  32.65 
 
 
160 aa  71.2  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  31.07 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0362  heat shock protein Hsp20  37.62 
 
 
144 aa  71.2  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.025472  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1967  heat shock protein Hsp20  37.11 
 
 
178 aa  71.2  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2250  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
178 aa  70.9  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5151  heat shock protein Hsp20  35.34 
 
 
148 aa  70.9  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184623  normal  0.32984 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  35.29 
 
 
147 aa  70.5  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6319  heat shock protein Hsp20  27.97 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2657  heat shock protein Hsp20  37.78 
 
 
155 aa  70.9  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.498697  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1559  heat shock protein Hsp20  38.2 
 
 
133 aa  70.5  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0277974  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0143  heat shock protein Hsp20  35.87 
 
 
156 aa  70.5  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>