More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1967 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1967  heat shock protein Hsp20  100 
 
 		 178 aa  360  5.0000000000000005e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2250  heat shock protein Hsp20  96.63 
 
 		 178 aa  348  3e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  51.2 
 
 		 153 aa  129  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  44.52 
 
 		 195 aa  120  7e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2863  heat shock protein Hsp20  45.26 
 
 		 167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.203152  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  41.13 
 
 		 151 aa  115  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  38.78 
 
 		 150 aa  98.6  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1429  heat shock protein Hsp20  36.55 
 
 		 169 aa  97.8  7e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  47.31 
 
 		 148 aa  94.4  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1573  heat shock protein Hsp20  37.58 
 
 		 173 aa  94.4  7e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00130938  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  38.46 
 
 		 149 aa  94  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  45.63 
 
 		 142 aa  92.8  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0982  HSP20 family protein  34.62 
 
 		 176 aa  89.7  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  36.69 
 
 		 147 aa  89.4  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3061  heat shock protein Hsp20  34.71 
 
 		 158 aa  89.4  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14610  heat shock protein Hsp20  33.58 
 
 		 143 aa  88.2  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000610495  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  34.06 
 
 		 153 aa  87  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3063  heat shock protein Hsp20  33.06 
 
 		 158 aa  86.7  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0143  heat shock protein Hsp20  34.29 
 
 		 156 aa  85.1  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  33.57 
 
 		 189 aa  84.7  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  35.51 
 
 		 189 aa  84.7  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  35.25 
 
 		 147 aa  84.3  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  34.78 
 
 		 145 aa  83.6  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2836  heat shock protein Hsp20  34.25 
 
 		 197 aa  83.6  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00556978  normal  0.209218 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0735  heat shock protein Hsp20  35.77 
 
 		 145 aa  83.6  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000037192  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2898  heat shock protein Hsp20  36.92 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.828136  normal  0.116226 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  32.86 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0008  Hsp  33.57 
 
 		 146 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3064  heat shock protein Hsp20  34.48 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  35.46 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  34.53 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  43.18 
 
 		 230 aa  82  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0154  heat shock protein Hsp20  37.4 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  30.15 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  30.15 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  31.4 
 
 		 148 aa  80.5  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  32.85 
 
 		 144 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  31.47 
 
 		 149 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1333  heat shock protein Hsp20  41.07 
 
 		 142 aa  80.5  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5491  heat shock protein Hsp20  32.17 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710483  normal  0.352797 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  31.47 
 
 		 163 aa  79.7  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  31.85 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  37.69 
 
 		 162 aa  79.3  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2210  heat shock protein Hsp20  30.61 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0417447  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2414  hypothetical protein  35.94 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  38.46 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1159  heat shock protein Hsp20  32.86 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000413054  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  32.14 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0463  heat shock protein Hsp20  34.81 
 
 		 166 aa  78.6  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3074  heat shock protein Hsp20  34.35 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2559  hypothetical protein  35.94 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1651  heat shock protein Hsp20  40.21 
 
 		 155 aa  78.2  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000431905  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  30.77 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  35.83 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  32.61 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  39.81 
 
 		 162 aa  77.8  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  32.61 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2505  heat shock protein Hsp20  34.29 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.239492  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2049  heat shock protein Hsp20  33.91 
 
 		 164 aa  77  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000140473  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  34.68 
 
 		 176 aa  77.4  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3725  heat shock protein Hsp20  38.32 
 
 		 143 aa  77  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.843054  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  38.76 
 
 		 139 aa  77  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1648  heat shock protein, Hsp20 family  39.18 
 
 		 148 aa  77.4  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715277  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  41.75 
 
 		 144 aa  77.4  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1347  heat shock protein Hsp20  39.18 
 
 		 148 aa  77.4  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.452932  normal  0.819182 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0675  heat shock protein Hsp20  39.72 
 
 		 163 aa  77  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000000558694  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  42.7 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  40.22 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  39.22 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  34.06 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3312  heat shock protein, putative  39 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.275059 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0343  heat shock protein Hsp20  29.23 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90555e-28 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3076  heat shock protein Hsp20  33.01 
 
 		 173 aa  75.1  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0389  heat shock protein Hsp20  39.42 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4128  heat shock protein Hsp20  28.26 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0362  heat shock protein Hsp20  28.46 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.025472  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0540  heat shock protein Hsp20  32.14 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0936  heat shock protein Hsp20  33.06 
 
 		 155 aa  74.3  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.172536  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1122  heat shock protein Hsp20  33.56 
 
 		 170 aa  74.3  0.0000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.421321  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0599  heat shock protein Hsp20  31.71 
 
 		 176 aa  74.3  0.0000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.187967  normal  0.122676 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  30.15 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4023  heat shock protein Hsp20  29.41 
 
 		 147 aa  73.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  32.58 
 
 		 151 aa  73.9  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  29.29 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4061  heat shock protein Hsp20  29.41 
 
 		 147 aa  73.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4819  heat shock protein Hsp20  34.62 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1986  heat shock protein Hsp20  40.62 
 
 		 156 aa  73.6  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  30.28 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4812  heat shock protein Hsp20  30.43 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00238667  normal  0.807841 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0296  heat shock protein Hsp20  32.17 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  30 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  30.15 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  39.13 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0160  heat shock protein Hsp20  34.23 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.248861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7806  putative small heat-shock protein molecular chaperone  34.29 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00540773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  38.32 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3323  heat shock protein Hsp20  34.93 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  32.21 
 
 		 166 aa  72.4  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  32.85 
 
 		 146 aa  72  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>