More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1986 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1986  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
156 aa  311  1.9999999999999998e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0154  heat shock protein Hsp20  48.73 
 
 
156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184978  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0298  heat shock protein Hsp20  44.58 
 
 
166 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1758  heat shock protein Hsp20  44.67 
 
 
223 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2022  heat shock protein Hsp20  50.85 
 
 
144 aa  108  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.12456  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1494  heat shock protein Hsp20  46.98 
 
 
148 aa  107  8.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000082748  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1294  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
159 aa  92  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.770288 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  39.1 
 
 
148 aa  81.3  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1608  molecular chaperone (small heat shock protein)-like protein  30.77 
 
 
160 aa  80.9  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0761679  normal  0.281506 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  40.22 
 
 
145 aa  78.2  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1983  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00684856  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2505  heat shock protein Hsp20  31.72 
 
 
138 aa  74.3  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.239492  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2250  heat shock protein Hsp20  40.62 
 
 
178 aa  73.9  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1967  heat shock protein Hsp20  40.62 
 
 
178 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
142 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1573  heat shock protein Hsp20  40.38 
 
 
173 aa  71.6  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00130938  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  43.96 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1417  heat shock protein Hsp20  34.39 
 
 
152 aa  71.6  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  38.71 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  35.56 
 
 
230 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1122  heat shock protein Hsp20  39.42 
 
 
170 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.421321  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  34.9 
 
 
171 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0406  heat shock protein Hsp20  30.66 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0194442  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2210  heat shock protein Hsp20  39.45 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0417447  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  31.58 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0008  Hsp  29.38 
 
 
146 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0982  HSP20 family protein  37.96 
 
 
176 aa  67.4  0.00000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2462  heat shock protein Hsp20  38.83 
 
 
168 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0466294  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0735  heat shock protein Hsp20  34.46 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000037192  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  35.77 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0859  heat shock protein Hsp20  34.87 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  36.79 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  36.79 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  30.5 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3725  heat shock protein Hsp20  34.01 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.843054  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0344  heat shock protein Hsp20  36.59 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.727239  normal  0.120456 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  36.63 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  34.78 
 
 
195 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0540  heat shock protein Hsp20  32.7 
 
 
147 aa  65.1  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  36.13 
 
 
134 aa  64.7  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  32.61 
 
 
149 aa  64.3  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1651  heat shock protein Hsp20  37 
 
 
155 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000431905  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1333  heat shock protein Hsp20  42 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  32.04 
 
 
150 aa  63.2  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1429  heat shock protein Hsp20  40.22 
 
 
169 aa  63.5  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1347  heat shock protein Hsp20  34.95 
 
 
148 aa  63.2  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.452932  normal  0.819182 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1648  heat shock protein, Hsp20 family  34.95 
 
 
148 aa  63.2  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715277  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1921  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
167 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.985705  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2275  heat shock protein, Hsp20 family  32.32 
 
 
153 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.79952e-50 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  30.25 
 
 
151 aa  62  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2094  HSP20 family protein  32.32 
 
 
153 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.016336  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2034  heat shock protein  32.32 
 
 
153 aa  62  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000604095  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2032  heat shock protein  32.32 
 
 
153 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000873203  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1445  putative heat shock protein  33.66 
 
 
167 aa  62  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000891901  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2250  HSP20 family protein  32.32 
 
 
153 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000163363  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1199  heat shock protein Hsp20  35.09 
 
 
143 aa  62  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.76992  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  35.4 
 
 
139 aa  62  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  30.56 
 
 
176 aa  62  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2279  HSP20 family protein  32.32 
 
 
153 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000417657  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2232  heat shock protein, Hsp20 family  32 
 
 
154 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00154952  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  35.16 
 
 
153 aa  61.6  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1706  heat shock protein Hsp20  31.07 
 
 
132 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00808314  hitchhiker  0.000432661 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  38.46 
 
 
145 aa  61.6  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  32.71 
 
 
139 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0285  heat shock protein Hsp20  34.03 
 
 
133 aa  61.2  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0622  HSP20 family protein  35.92 
 
 
132 aa  61.2  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0833  heat shock protein Hsp20  28.38 
 
 
169 aa  60.8  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3092  heat shock protein, Hsp20 family  34.34 
 
 
153 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000535786  decreased coverage  5.9903300000000006e-24 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0630  heat shock protein Hsp20  35.24 
 
 
138 aa  60.8  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140987  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  30.46 
 
 
151 aa  60.8  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  34.95 
 
 
132 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  30.71 
 
 
148 aa  60.8  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1704  heat shock protein Hsp20  34.48 
 
 
140 aa  60.5  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2360  heat shock protein, Hsp20 family  33 
 
 
154 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000177338  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  30.34 
 
 
149 aa  59.7  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1695  heat shock protein Hsp20  39.13 
 
 
151 aa  60.1  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3241  heat shock protein Hsp20  35.58 
 
 
166 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.406826  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2073  heat shock protein Hsp20  32.67 
 
 
155 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00430311  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  33.58 
 
 
152 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  32.98 
 
 
163 aa  60.1  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0231  heat shock protein Hsp20  32.77 
 
 
176 aa  59.3  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2140  heat shock protein Hsp20  32.14 
 
 
133 aa  59.7  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  32.69 
 
 
150 aa  59.3  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5194  heat shock protein Hsp20  36.56 
 
 
169 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987038  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1170  heat shock protein Hsp20  30.6 
 
 
170 aa  59.3  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1537  heat shock protein Hsp20  41.58 
 
 
142 aa  58.9  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  32.59 
 
 
147 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0675  heat shock protein Hsp20  35 
 
 
163 aa  58.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000000558694  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  32.59 
 
 
147 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0982  heat shock protein Hsp20  39.05 
 
 
133 aa  58.5  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.506219 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2802  heat shock protein Hsp20  36 
 
 
167 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.20157 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  33.7 
 
 
158 aa  58.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1159  heat shock protein Hsp20  31.73 
 
 
148 aa  58.2  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000413054  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2938  heat shock protein Hsp20  34.38 
 
 
145 aa  58.5  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000491843  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1806  small heat shock protein  32.08 
 
 
152 aa  58.5  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5491  heat shock protein Hsp20  37.63 
 
 
211 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710483  normal  0.352797 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  27.21 
 
 
147 aa  58.2  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3323  heat shock protein Hsp20  38.69 
 
 
228 aa  58.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  37.38 
 
 
134 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0588  heat shock protein, molecular chaperone  33.33 
 
 
141 aa  58.2  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.648467  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>