More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5491 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5491  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
211 aa  428  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710483  normal  0.352797 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  89.81 
 
 
157 aa  288  4e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  43.19 
 
 
185 aa  170  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6390  heat shock protein Hsp20  40.83 
 
 
187 aa  156  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.065602 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2600  putative heat shock protein Hsp20  40.95 
 
 
187 aa  155  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207676  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6093  heat shock protein Hsp20  40.37 
 
 
187 aa  154  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  47.22 
 
 
230 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  40.58 
 
 
176 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  45.28 
 
 
153 aa  99.8  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  41.26 
 
 
177 aa  99.8  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  41.12 
 
 
163 aa  96.7  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  39.22 
 
 
172 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0389  heat shock protein Hsp20  38.94 
 
 
166 aa  95.5  5e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3882  heat shock protein Hsp20  42.99 
 
 
158 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.545217  normal  0.180827 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6104  heat shock protein Hsp20  50.47 
 
 
158 aa  95.1  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  42.19 
 
 
176 aa  95.1  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3805  heat shock protein Hsp20  43.09 
 
 
158 aa  94  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3498  heat shock protein Hsp20  43.09 
 
 
158 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  41.27 
 
 
147 aa  92.4  4e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  39.52 
 
 
151 aa  92  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  37.74 
 
 
166 aa  91.7  8e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  44.76 
 
 
165 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0513  heat shock protein Hsp20  33.79 
 
 
147 aa  90.5  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  33.57 
 
 
144 aa  89.7  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  43.81 
 
 
148 aa  89.4  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  40.48 
 
 
147 aa  89.4  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  40.57 
 
 
185 aa  88.2  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  40.57 
 
 
185 aa  88.2  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  40.52 
 
 
143 aa  88.2  7e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  35.51 
 
 
150 aa  88.2  8e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5194  heat shock protein Hsp20  40.15 
 
 
169 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987038  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  37.14 
 
 
204 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  45.54 
 
 
164 aa  87.4  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0686  heat shock protein HSP20  40.57 
 
 
153 aa  87.8  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0833  heat shock protein Hsp20  46.34 
 
 
169 aa  87.4  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25770  heat shock Hsp20 protein  40.56 
 
 
198 aa  87  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  38.79 
 
 
156 aa  86.7  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2505  heat shock protein Hsp20  36.24 
 
 
138 aa  86.7  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.239492  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  38.68 
 
 
166 aa  86.3  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  38.05 
 
 
151 aa  86.3  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2210  heat shock protein Hsp20  38.64 
 
 
139 aa  85.5  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0417447  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  33.79 
 
 
195 aa  85.5  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  37.38 
 
 
184 aa  84.7  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  31.69 
 
 
189 aa  84.7  9e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1921  heat shock protein Hsp20  43.69 
 
 
167 aa  84.3  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.985705  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  44.76 
 
 
162 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0296  heat shock protein Hsp20  39.25 
 
 
156 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  39.62 
 
 
194 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  31.21 
 
 
189 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  33.87 
 
 
149 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  35.19 
 
 
173 aa  82.8  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  43.55 
 
 
149 aa  82.4  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3323  heat shock protein Hsp20  45.28 
 
 
228 aa  82  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2940  heat shock protein Hsp20  34.81 
 
 
168 aa  82.4  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2863  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
167 aa  82  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.203152  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  40.43 
 
 
153 aa  82  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0982  HSP20 family protein  31.28 
 
 
176 aa  81.6  0.000000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  40.43 
 
 
189 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2276  heat shock protein Hsp20  37.59 
 
 
175 aa  81.6  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  38.02 
 
 
171 aa  81.6  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3725  heat shock protein Hsp20  36.76 
 
 
143 aa  81.6  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.843054  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1159  heat shock protein Hsp20  38.89 
 
 
148 aa  81.6  0.000000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000413054  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  37.96 
 
 
150 aa  81.3  0.000000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3336  heat shock protein Hsp20  33.88 
 
 
191 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  32.89 
 
 
151 aa  81.3  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  32.89 
 
 
151 aa  81.3  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  35.51 
 
 
145 aa  80.1  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1732  HSP20 family protein  46.15 
 
 
167 aa  80.1  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.371108  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14610  heat shock protein Hsp20  34.07 
 
 
143 aa  80.1  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000610495  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  35.77 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  37.78 
 
 
142 aa  79.7  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  37.61 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  35.51 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  38.71 
 
 
189 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1967  heat shock protein Hsp20  32.17 
 
 
178 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  38.13 
 
 
143 aa  79.7  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  31.5 
 
 
142 aa  79.7  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  35.24 
 
 
146 aa  79.3  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  35.24 
 
 
146 aa  79.3  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  28.78 
 
 
139 aa  79  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  31.88 
 
 
139 aa  79  0.00000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3312  heat shock protein, putative  44.23 
 
 
129 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.275059 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3241  heat shock protein Hsp20  38.68 
 
 
166 aa  79  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.406826  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0859  heat shock protein Hsp20  36.43 
 
 
153 aa  79  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2250  heat shock protein Hsp20  32.86 
 
 
178 aa  79  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
169 aa  79  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  35.19 
 
 
147 aa  78.6  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  33.08 
 
 
144 aa  78.6  0.00000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  38.94 
 
 
147 aa  78.6  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  33.33 
 
 
162 aa  78.2  0.00000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  31.3 
 
 
136 aa  78.2  0.00000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  28.99 
 
 
139 aa  78.2  0.00000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4812  heat shock protein Hsp20  36.73 
 
 
155 aa  78.2  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00238667  normal  0.807841 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2049  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000140473  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  35.85 
 
 
158 aa  78.2  0.00000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0320  heat shock protein Hsp20  41.41 
 
 
150 aa  78.2  0.00000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  30.9 
 
 
186 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4128  heat shock protein Hsp20  36.11 
 
 
154 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226976  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  38.53 
 
 
141 aa  77.8  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1018  heat shock protein Hsp20  40.57 
 
 
177 aa  77.8  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.683731  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>