More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2477 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
143 aa  293  5e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  73.79 
 
 
143 aa  222  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  62.94 
 
 
144 aa  183  6e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  59.15 
 
 
144 aa  177  2.9999999999999997e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  53.85 
 
 
139 aa  169  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  51.35 
 
 
148 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  48.03 
 
 
156 aa  150  7e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0320  heat shock protein Hsp20  48.98 
 
 
150 aa  144  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  46.94 
 
 
160 aa  142  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  46.94 
 
 
160 aa  142  1e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  46.94 
 
 
158 aa  134  4e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  47.89 
 
 
145 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  44.6 
 
 
151 aa  131  3e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  44.6 
 
 
151 aa  131  3e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  47.18 
 
 
145 aa  130  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  45.77 
 
 
145 aa  127  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  45.99 
 
 
145 aa  123  7e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  40.54 
 
 
149 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  40.29 
 
 
146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  40.29 
 
 
146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  38.19 
 
 
147 aa  118  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
147 aa  117  7e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  39.58 
 
 
147 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  38.78 
 
 
148 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  41.72 
 
 
152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  38.62 
 
 
148 aa  111  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  39.57 
 
 
147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  41.13 
 
 
145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  38.3 
 
 
147 aa  106  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2683  heat shock protein Hsp20  39.44 
 
 
145 aa  106  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338339  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  36.3 
 
 
151 aa  103  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  35.34 
 
 
150 aa  102  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0513  heat shock protein Hsp20  39.86 
 
 
147 aa  97.8  5e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  39.23 
 
 
143 aa  97.4  6e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  35.86 
 
 
162 aa  97.1  7e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  36.79 
 
 
162 aa  96.7  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  38.67 
 
 
189 aa  95.5  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  40.34 
 
 
132 aa  94.7  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  43.1 
 
 
153 aa  94.4  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  37.38 
 
 
162 aa  94.4  5e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0403  heat shock protein Hsp20  35.25 
 
 
138 aa  94.4  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4157  heat shock protein Hsp20  39.57 
 
 
150 aa  93.6  9e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  38.19 
 
 
146 aa  93.2  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1029  Hsp20/alpha crystallin family protein  37.88 
 
 
146 aa  92.8  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00339514  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  35.25 
 
 
142 aa  93.2  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  40.88 
 
 
134 aa  93.2  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  40.91 
 
 
149 aa  92.8  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  38.46 
 
 
153 aa  93.2  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4943  heat shock protein Hsp20  38.57 
 
 
149 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0508199 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  38.69 
 
 
163 aa  92.8  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0343  heat shock protein Hsp20  34.72 
 
 
144 aa  91.7  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90555e-28 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  34.53 
 
 
158 aa  92  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  37.98 
 
 
147 aa  92  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  44.44 
 
 
166 aa  91.7  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0362  heat shock protein Hsp20  34.03 
 
 
144 aa  91.3  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.025472  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  37.21 
 
 
147 aa  91.3  4e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  31.21 
 
 
136 aa  91.3  4e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  38.83 
 
 
150 aa  90.9  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  38.17 
 
 
143 aa  91.3  5e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  35.46 
 
 
141 aa  90.5  6e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1805  heat shock protein Hsp20  38.85 
 
 
149 aa  90.5  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal  0.803886 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0179  heat shock protein Hsp20  36.69 
 
 
149 aa  90.5  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4761  heat shock protein Hsp20  38.85 
 
 
149 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.735655  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4380  heat shock protein Hsp20  38.85 
 
 
149 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.642417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4467  heat shock protein Hsp20  38.85 
 
 
149 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0609  heat shock protein Hsp20  36.69 
 
 
156 aa  89.4  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.346897  normal  0.0142886 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  40.71 
 
 
176 aa  88.6  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  36 
 
 
189 aa  88.2  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  38.74 
 
 
185 aa  88.2  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  37.59 
 
 
143 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1743  heat shock protein Hsp20  36.62 
 
 
145 aa  87.8  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.49982  normal  0.0110244 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2086  heat shock protein, Hsp20 family  36.62 
 
 
145 aa  87.8  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  46.23 
 
 
153 aa  87.8  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0891  heat shock protein Hsp20  39.57 
 
 
137 aa  87.8  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.805469  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  45.1 
 
 
231 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  36.67 
 
 
189 aa  87.4  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  37.32 
 
 
143 aa  87  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  45.28 
 
 
176 aa  87  8e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  39.5 
 
 
230 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  45.1 
 
 
186 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  39.22 
 
 
139 aa  85.5  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  45.26 
 
 
139 aa  85.5  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0622  HSP20 family protein  44.66 
 
 
132 aa  85.9  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0540  heat shock protein Hsp20  33.56 
 
 
147 aa  85.9  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  40.94 
 
 
173 aa  85.5  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3336  heat shock protein Hsp20  43.52 
 
 
191 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4669  heat shock protein Hsp20  35.97 
 
 
147 aa  85.5  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  35.33 
 
 
189 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  36.49 
 
 
185 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  35.33 
 
 
189 aa  85.1  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  32.85 
 
 
148 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  36.49 
 
 
185 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  32.59 
 
 
158 aa  84.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2210  heat shock protein Hsp20  40.18 
 
 
139 aa  84.7  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0417447  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  32.85 
 
 
148 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  39.06 
 
 
177 aa  84  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  33.56 
 
 
151 aa  84  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3580  molecular chaperone (small heat shock protein)  44.21 
 
 
141 aa  84.3  6e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
164 aa  83.6  9e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  36.04 
 
 
184 aa  82.8  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>