More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2678 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  100 
 
 		 151 aa  306  6.999999999999999e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  73.47 
 
 		 195 aa  228  3e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1967  heat shock protein Hsp20  41.13 
 
 		 178 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  43.88 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2250  heat shock protein Hsp20  40.43 
 
 		 178 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  37.33 
 
 		 147 aa  100  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0982  HSP20 family protein  35.57 
 
 		 176 aa  99  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  36 
 
 		 149 aa  97.8  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  36.73 
 
 		 185 aa  96.3  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  34.67 
 
 		 148 aa  95.5  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  33.33 
 
 		 162 aa  95.1  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  34.27 
 
 		 162 aa  94.7  4e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  36.55 
 
 		 150 aa  94.7  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  38 
 
 		 147 aa  94.7  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  37.31 
 
 		 148 aa  94  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6390  heat shock protein Hsp20  44 
 
 		 187 aa  93.6  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.065602 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  39.71 
 
 		 151 aa  93.2  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  33.1 
 
 		 147 aa  92.8  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 162 aa  92.4  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6093  heat shock protein Hsp20  43 
 
 		 187 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  36.91 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3074  heat shock protein Hsp20  37.66 
 
 		 144 aa  91.7  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5491  heat shock protein Hsp20  39.52 
 
 		 211 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710483  normal  0.352797 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  32.39 
 
 		 147 aa  90.9  5e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1573  heat shock protein Hsp20  36.31 
 
 		 173 aa  90.9  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00130938  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2505  heat shock protein Hsp20  39.17 
 
 		 138 aa  90.9  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.239492  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  35.48 
 
 		 149 aa  90.5  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  37.67 
 
 		 145 aa  90.5  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  37.9 
 
 		 157 aa  90.1  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  43.24 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  34.67 
 
 		 147 aa  89.4  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  39.04 
 
 		 176 aa  89  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2863  heat shock protein Hsp20  37.72 
 
 		 167 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.203152  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  39.29 
 
 		 153 aa  89  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 		 186 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  42.86 
 
 		 231 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  40 
 
 		 144 aa  87.8  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  33.57 
 
 		 150 aa  87.8  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  36.52 
 
 		 142 aa  87.4  6e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0735  heat shock protein Hsp20  33.1 
 
 		 145 aa  87.4  6e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000037192  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  38.58 
 
 		 139 aa  87.4  6e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0599  heat shock protein Hsp20  31.16 
 
 		 176 aa  87  9e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.187967  normal  0.122676 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  32.39 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  39.39 
 
 		 230 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  34.03 
 
 		 146 aa  86.3  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  34.03 
 
 		 146 aa  86.3  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2600  putative heat shock protein Hsp20  40 
 
 		 187 aa  84.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  33.8 
 
 		 156 aa  84.7  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  39.6 
 
 		 144 aa  84.3  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  37.37 
 
 		 176 aa  84.3  6e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3882  heat shock protein Hsp20  41.67 
 
 		 158 aa  84  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.545217  normal  0.180827 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4395  heat shock protein Hsp20  41.67 
 
 		 181 aa  83.6  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4528  heat shock protein Hsp20  41.67 
 
 		 181 aa  83.6  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.550609  normal  0.0462291 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  40.74 
 
 		 158 aa  83.6  9e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  40 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14610  heat shock protein Hsp20  32.12 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000610495  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  31.97 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2086  heat shock protein, Hsp20 family  34.09 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4132  heat shock protein Hsp20  33.04 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1743  heat shock protein Hsp20  34.09 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.49982  normal  0.0110244 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0672  heat shock protein Hsp20  36.81 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000109595  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1175  heat shock protein Hsp20  39.81 
 
 		 185 aa  81.6  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  35.78 
 
 		 148 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3580  molecular chaperone (small heat shock protein)  42.11 
 
 		 141 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  35 
 
 		 142 aa  80.9  0.000000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1429  heat shock protein Hsp20  31.72 
 
 		 169 aa  80.9  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  34.97 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  34.69 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  30.2 
 
 		 189 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2049  heat shock protein Hsp20  37.41 
 
 		 164 aa  80.5  0.000000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000140473  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  34.97 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0343  heat shock protein Hsp20  30.87 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90555e-28 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  36.04 
 
 		 146 aa  80.1  0.000000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  39.22 
 
 		 143 aa  80.1  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  35.14 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  32.84 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0362  heat shock protein Hsp20  30.2 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.025472  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1159  heat shock protein Hsp20  32.39 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000413054  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1347  heat shock protein Hsp20  35.05 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.452932  normal  0.819182 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1648  heat shock protein, Hsp20 family  35.05 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715277  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  32.87 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3612  hypothetical protein  30.5 
 
 		 177 aa  79  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  33.56 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25770  heat shock Hsp20 protein  34.45 
 
 		 198 aa  78.2  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0690  heat shock protein Hsp20  35.78 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202005  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3323  heat shock protein Hsp20  43.69 
 
 		 228 aa  78.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2276  heat shock protein Hsp20  38.54 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3661  heat shock protein Hsp20  44.44 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  32.62 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3498  heat shock protein Hsp20  40 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  28 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  28 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  31.58 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3805  heat shock protein Hsp20  40 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1179  heat shock protein Hsp20  32.62 
 
 		 195 aa  77.4  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.285254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  29.53 
 
 		 189 aa  77.4  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  34.23 
 
 		 163 aa  77  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0603  heat shock protein Hsp20  37.6 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208688  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0160  heat shock protein Hsp20  36.44 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.248861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0924  heat shock protein  41.94 
 
 		 180 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>