More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0603 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0603  heat shock protein Hsp20  100 
 
 		 147 aa  298  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208688  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0617  heat shock protein Hsp20  96.6 
 
 		 147 aa  288  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.23773e-35 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0690  heat shock protein Hsp20  59.18 
 
 		 147 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202005  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3215  heat shock protein Hsp20  50.34 
 
 		 150 aa  151  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0580949  hitchhiker  0.000000163698 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3192  HSP20 family protein  45.52 
 
 		 149 aa  133  7.000000000000001e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  37.96 
 
 		 147 aa  92.8  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  37.96 
 
 		 147 aa  90.9  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2605  heat shock protein Hsp20  36.23 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.325564  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  39.26 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  31.29 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  34.23 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  39.81 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  39.45 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  37.68 
 
 		 176 aa  79.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  36 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  35.45 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  31.94 
 
 		 148 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  31.97 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  37.6 
 
 		 151 aa  77  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  37.74 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  34.38 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2559  hypothetical protein  34.26 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2414  hypothetical protein  34.26 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  35 
 
 		 195 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  35.96 
 
 		 185 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  39.13 
 
 		 176 aa  73.9  0.0000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  29.25 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  29.25 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1159  heat shock protein Hsp20  34.29 
 
 		 148 aa  73.6  0.0000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000413054  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  31.4 
 
 		 156 aa  73.6  0.0000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  32.65 
 
 		 143 aa  73.6  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1806  small heat shock protein  34.62 
 
 		 152 aa  73.6  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  36.45 
 
 		 153 aa  72  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  33.56 
 
 		 139 aa  72  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  37.21 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  36.43 
 
 		 173 aa  72.4  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  32.14 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4128  heat shock protein Hsp20  25.68 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  35.66 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  34.85 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  32.2 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0406  heat shock protein Hsp20  32.79 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0194442  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14610  heat shock protein Hsp20  30.3 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000610495  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  36.28 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  35.96 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2384  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 164 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3612  hypothetical protein  32.41 
 
 		 177 aa  70.5  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  30.88 
 
 		 146 aa  70.1  0.000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0188  heat shock protein Hsp20  32.19 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0160  heat shock protein Hsp20  35.96 
 
 		 147 aa  70.1  0.000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.248861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1214  molecular chaperone (small heat shock protein)  40.19 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.318766  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  34.09 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  29.29 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6104  heat shock protein Hsp20  37.38 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3336  heat shock protein Hsp20  36.79 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  34.86 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2807  heat shock protein Hsp20  33.57 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0373255  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1528  heat shock protein Hsp20  31.21 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00309172  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  28.38 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  28.38 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25770  heat shock Hsp20 protein  32.85 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0389  heat shock protein Hsp20  34.62 
 
 		 166 aa  68.6  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  33.96 
 
 		 166 aa  68.6  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  31.68 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  31.47 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  30.3 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  32.47 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0539  heat shock protein Hsp20  37.61 
 
 		 161 aa  67.4  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0793  heat shock protein Hsp20  36.04 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.515708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  33.02 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  33.81 
 
 		 163 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1738  small HspC2 heat shock protein  33.96 
 
 		 189 aa  67.4  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.267785  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2798  small HspC2 heat shock protein  33.96 
 
 		 189 aa  67.4  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.159343  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3386  heat shock protein Hsp20  33.06 
 
 		 147 aa  67  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3882  heat shock protein Hsp20  35.51 
 
 		 158 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.545217  normal  0.180827 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5491  heat shock protein Hsp20  34.21 
 
 		 211 aa  67  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710483  normal  0.352797 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  27.56 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1806  heat shock protein Hsp20  31.51 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.332989  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  28.86 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0008  Hsp  33.33 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0540  heat shock protein Hsp20  30.6 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0463  heat shock protein Hsp20  30.56 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  35.16 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  38.4 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  35.58 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4157  heat shock protein Hsp20  33.65 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4119  heat shock protein Hsp20  30.63 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303961 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3805  heat shock protein Hsp20  33.93 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2863  heat shock protein Hsp20  32.38 
 
 		 167 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.203152  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3498  heat shock protein Hsp20  33.93 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0343  heat shock protein Hsp20  31.06 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90555e-28 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  32.5 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1983  heat shock protein Hsp20  28.24 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00684856  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  35.48 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3527  putative HspC2 heat shock protein  32.04 
 
 		 173 aa  64.3  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1736  heat shock protein Hsp20  35.34 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.619884  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0672  heat shock protein Hsp20  30.51 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000109595  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  34.07 
 
 		 186 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  27.91 
 
 		 189 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>