More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3192 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3192  HSP20 family protein  100 
 
 		 149 aa  300  6.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3215  heat shock protein Hsp20  66.67 
 
 		 150 aa  207  6e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0580949  hitchhiker  0.000000163698 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0690  heat shock protein Hsp20  52.74 
 
 		 147 aa  160  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202005  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0603  heat shock protein Hsp20  45.52 
 
 		 147 aa  133  8e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208688  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0617  heat shock protein Hsp20  44.14 
 
 		 147 aa  131  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.23773e-35 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  32.06 
 
 		 147 aa  87.4  6e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  30.53 
 
 		 147 aa  84.3  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0389  heat shock protein Hsp20  34.62 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  35.29 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  35.29 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2559  hypothetical protein  32.71 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2414  hypothetical protein  31.82 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1347  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.452932  normal  0.819182 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1648  heat shock protein, Hsp20 family  36.36 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715277  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  31.78 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  31.78 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  33.09 
 
 		 185 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  32.61 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  30.43 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  31.2 
 
 		 166 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  32.03 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  33.58 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  36.75 
 
 		 195 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2807  heat shock protein Hsp20  37.96 
 
 		 148 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0373255  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2605  heat shock protein Hsp20  41.67 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.325564  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0160  heat shock protein Hsp20  37.37 
 
 		 147 aa  73.6  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.248861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  33.86 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  27.2 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2657  heat shock protein Hsp20  29.41 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.498697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  32 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  29.79 
 
 		 158 aa  72  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2401  heat shock protein Hsp20  33.9 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000662378  hitchhiker  0.00157329 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  34.43 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  40.4 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  34.78 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  42.55 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0423  heat shock protein Hsp20  39.05 
 
 		 152 aa  70.1  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.943695  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  37.89 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  31.97 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0143  heat shock protein Hsp20  31.03 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  34.4 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  33.61 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  34.04 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0184  heat shock protein Hsp20  31.78 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.29101  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  29.46 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  31.3 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  29.46 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4395  heat shock protein Hsp20  33.03 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4528  heat shock protein Hsp20  33.03 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.550609  normal  0.0462291 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  34.04 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  37 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1921  heat shock protein Hsp20  35.58 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.985705  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  34.69 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  28.57 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  28.57 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  32.52 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  32.11 
 
 		 177 aa  67.8  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  32.04 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  29.01 
 
 		 144 aa  67  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  28.47 
 
 		 163 aa  67.4  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1214  molecular chaperone (small heat shock protein)  33.33 
 
 		 260 aa  67  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.318766  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  31.78 
 
 		 153 aa  67  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  30.56 
 
 		 189 aa  67  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  35.45 
 
 		 176 aa  67  0.00000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2731  heat shock protein Hsp20  31.13 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  34.33 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  29.81 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  29.66 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  33.94 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1018  heat shock protein Hsp20  31.82 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.683731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  30.53 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  32.65 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  30.83 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  30.07 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  30.82 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  30.56 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  31.97 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  25.36 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4819  heat shock protein Hsp20  27.88 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  25.55 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  30.95 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0735  heat shock protein Hsp20  27.01 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000037192  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  31.48 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  32.11 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  29.77 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2276  heat shock protein Hsp20  30.09 
 
 		 175 aa  64.3  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2384  heat shock protein Hsp20  32.61 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  31.48 
 
 		 231 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3612  hypothetical protein  32.71 
 
 		 177 aa  64.3  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0513  heat shock protein Hsp20  33.03 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  35.19 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  25.36 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25770  heat shock Hsp20 protein  35.78 
 
 		 198 aa  63.9  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3527  putative HspC2 heat shock protein  35.51 
 
 		 173 aa  63.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  33.94 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2049  heat shock protein Hsp20  24.63 
 
 		 164 aa  63.5  0.0000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000140473  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  33.99 
 
 		 185 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0540  heat shock protein Hsp20  30.34 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>