More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0617 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0617  heat shock protein Hsp20  100 
 
 		 147 aa  298  1e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.23773e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0603  heat shock protein Hsp20  96.6 
 
 		 147 aa  288  2e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208688  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0690  heat shock protein Hsp20  57.14 
 
 		 147 aa  175  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202005  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3215  heat shock protein Hsp20  48.3 
 
 		 150 aa  147  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0580949  hitchhiker  0.000000163698 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3192  HSP20 family protein  44.14 
 
 		 149 aa  131  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  35.56 
 
 		 147 aa  91.7  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  35.56 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2605  heat shock protein Hsp20  36.23 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.325564  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  34.9 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  31.29 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  36.67 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  39.45 
 
 		 142 aa  80.1  0.000000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  31.97 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  34.26 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2559  hypothetical protein  33.62 
 
 		 164 aa  77.4  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2414  hypothetical protein  33.62 
 
 		 164 aa  77.4  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  38.89 
 
 		 230 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  33.06 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1159  heat shock protein Hsp20  34.29 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000413054  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  36.79 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  32.86 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  37.04 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  35.04 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  31.94 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  35.51 
 
 		 176 aa  74.7  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  35.96 
 
 		 185 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14610  heat shock protein Hsp20  31.06 
 
 		 143 aa  73.6  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000610495  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  31.97 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  36.96 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  35.58 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  35.58 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  35.51 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  36 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3612  hypothetical protein  30.63 
 
 		 177 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  34.85 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  33.05 
 
 		 151 aa  72  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  34.25 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2807  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0373255  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  39.25 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  36.45 
 
 		 153 aa  72  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1806  small heat shock protein  34.11 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  38.05 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  32.47 
 
 		 156 aa  70.1  0.000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  27.94 
 
 		 163 aa  70.1  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4128  heat shock protein Hsp20  25 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1528  heat shock protein Hsp20  31.21 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00309172  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0188  heat shock protein Hsp20  32.19 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2863  heat shock protein Hsp20  34.29 
 
 		 167 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.203152  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2384  heat shock protein Hsp20  32.58 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0389  heat shock protein Hsp20  34.62 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  34.88 
 
 		 173 aa  69.3  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  32.82 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  34.11 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3336  heat shock protein Hsp20  30.13 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0406  heat shock protein Hsp20  33.64 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0194442  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0160  heat shock protein Hsp20  35.58 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.248861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3386  heat shock protein Hsp20  32.26 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  28.86 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  28.86 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1214  molecular chaperone (small heat shock protein)  36.15 
 
 		 260 aa  67.8  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.318766  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25770  heat shock Hsp20 protein  30.46 
 
 		 198 aa  67.4  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  35.58 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5491  heat shock protein Hsp20  34.45 
 
 		 211 aa  67  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710483  normal  0.352797 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  31.85 
 
 		 144 aa  67  0.00000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6104  heat shock protein Hsp20  36.45 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  30.63 
 
 		 149 aa  67  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  34.45 
 
 		 157 aa  66.6  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4157  heat shock protein Hsp20  29.23 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1806  heat shock protein Hsp20  31.51 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.332989  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  32.2 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  33.02 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0008  Hsp  33.33 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3805  heat shock protein Hsp20  32.2 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1738  small HspC2 heat shock protein  33.96 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.267785  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2798  small HspC2 heat shock protein  33.96 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.159343  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3882  heat shock protein Hsp20  34.23 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.545217  normal  0.180827 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  33.65 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1983  heat shock protein Hsp20  30.22 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00684856  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4669  heat shock protein Hsp20  31.07 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  31.88 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0539  heat shock protein Hsp20  37.61 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3498  heat shock protein Hsp20  32.2 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  32.5 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  27.52 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  29.59 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  29.55 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2657  heat shock protein Hsp20  28.87 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.498697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0793  heat shock protein Hsp20  35.14 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.515708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0179  heat shock protein Hsp20  31.01 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0343  heat shock protein Hsp20  31.06 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90555e-28 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0540  heat shock protein Hsp20  29.85 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  37.6 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0320  heat shock protein Hsp20  28.67 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1029  Hsp20/alpha crystallin family protein  34.62 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00339514  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0463  heat shock protein Hsp20  30.56 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  25.68 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  28.19 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4119  heat shock protein Hsp20  29.73 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303961 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  27.21 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>