More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2635 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  100 
 
 		 195 aa  387  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  73.47 
 
 		 151 aa  228  5e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2250  heat shock protein Hsp20  45.21 
 
 		 178 aa  124  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1967  heat shock protein Hsp20  44.52 
 
 		 178 aa  120  9e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  48.82 
 
 		 153 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1573  heat shock protein Hsp20  38.6 
 
 		 173 aa  103  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00130938  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0982  HSP20 family protein  37.34 
 
 		 176 aa  101  9e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  38.19 
 
 		 147 aa  100  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  38.36 
 
 		 148 aa  99.8  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  32.17 
 
 		 162 aa  96.3  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  41.35 
 
 		 147 aa  96.7  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  33.1 
 
 		 162 aa  96.3  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  33.1 
 
 		 162 aa  95.5  4e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 147 aa  94.7  7e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 		 150 aa  94.7  7e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 147 aa  94.7  8e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  39.44 
 
 		 149 aa  93.6  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 		 148 aa  93.6  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  40.74 
 
 		 145 aa  93.6  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  38.62 
 
 		 142 aa  92.8  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  40.38 
 
 		 149 aa  92.8  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  40.71 
 
 		 144 aa  92.4  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2863  heat shock protein Hsp20  39.47 
 
 		 167 aa  92  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.203152  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  45.05 
 
 		 230 aa  92  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  39.84 
 
 		 150 aa  91.3  7e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  42.74 
 
 		 143 aa  91.3  8e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  38.89 
 
 		 185 aa  91.3  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1429  heat shock protein Hsp20  30.61 
 
 		 169 aa  89.7  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  44.68 
 
 		 153 aa  89.4  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  32.86 
 
 		 146 aa  88.6  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  32.86 
 
 		 146 aa  88.6  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  38.98 
 
 		 151 aa  87.4  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 		 176 aa  87.4  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0735  heat shock protein Hsp20  40 
 
 		 145 aa  87.8  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000037192  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  31.11 
 
 		 151 aa  86.7  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  32.64 
 
 		 148 aa  86.7  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0160  heat shock protein Hsp20  36.44 
 
 		 147 aa  86.7  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.248861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  34.04 
 
 		 156 aa  86.7  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  31.11 
 
 		 151 aa  86.7  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4395  heat shock protein Hsp20  30.64 
 
 		 181 aa  85.9  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6093  heat shock protein Hsp20  36.11 
 
 		 187 aa  86.3  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 		 147 aa  86.3  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4528  heat shock protein Hsp20  30.64 
 
 		 181 aa  85.9  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.550609  normal  0.0462291 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  33.79 
 
 		 157 aa  85.5  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6390  heat shock protein Hsp20  36.11 
 
 		 187 aa  85.9  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.065602 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  38.32 
 
 		 139 aa  85.1  6e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3074  heat shock protein Hsp20  38.36 
 
 		 144 aa  85.1  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  35 
 
 		 142 aa  84.7  7e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5491  heat shock protein Hsp20  33.79 
 
 		 211 aa  84.7  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710483  normal  0.352797 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3882  heat shock protein Hsp20  34.88 
 
 		 158 aa  84.7  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.545217  normal  0.180827 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  38.32 
 
 		 144 aa  84.3  9e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1648  heat shock protein, Hsp20 family  34.75 
 
 		 148 aa  84  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715277  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  40.19 
 
 		 158 aa  84.3  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1347  heat shock protein Hsp20  34.75 
 
 		 148 aa  84  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.452932  normal  0.819182 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  33.1 
 
 		 189 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  37.04 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4132  heat shock protein Hsp20  36.45 
 
 		 144 aa  83.6  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  37.86 
 
 		 141 aa  83.2  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  37.19 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0719  heat shock protein Hsp20  32.28 
 
 		 137 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00433386  normal  0.504335 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0690  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202005  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  34.4 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2049  heat shock protein Hsp20  33.55 
 
 		 164 aa  82.4  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000140473  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1159  heat shock protein Hsp20  34.33 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000413054  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  38.04 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  40.19 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1738  small HspC2 heat shock protein  33.33 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.267785  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2798  small HspC2 heat shock protein  33.33 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.159343  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  36.11 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1175  heat shock protein Hsp20  38.83 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25770  heat shock Hsp20 protein  34.85 
 
 		 198 aa  81.3  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2505  heat shock protein Hsp20  35 
 
 		 138 aa  80.5  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.239492  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0599  heat shock protein Hsp20  30.77 
 
 		 176 aa  80.9  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.187967  normal  0.122676 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5151  heat shock protein Hsp20  33.08 
 
 		 148 aa  80.5  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184623  normal  0.32984 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  33.09 
 
 		 145 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0675  heat shock protein Hsp20  40.56 
 
 		 163 aa  80.5  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000000558694  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  32.59 
 
 		 139 aa  80.9  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  39.81 
 
 		 134 aa  80.9  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  35.24 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3612  hypothetical protein  30.82 
 
 		 177 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2600  putative heat shock protein Hsp20  36.7 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207676  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2414  hypothetical protein  30.41 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0513  heat shock protein Hsp20  36.54 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  32.41 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  31.72 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2276  heat shock protein Hsp20  31.97 
 
 		 175 aa  79  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2559  hypothetical protein  30.41 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1122  heat shock protein Hsp20  34.43 
 
 		 170 aa  79  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.421321  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14610  heat shock protein Hsp20  30.77 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000610495  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  36.54 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1018  heat shock protein Hsp20  34.88 
 
 		 177 aa  78.2  0.00000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.683731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3336  heat shock protein Hsp20  40.4 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  34.82 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6104  heat shock protein Hsp20  36.19 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  32.58 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3323  heat shock protein Hsp20  39.72 
 
 		 228 aa  77.8  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0540  heat shock protein Hsp20  30.99 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2078  heat shock protein Hsp20  33.79 
 
 		 147 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  39.78 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  31.88 
 
 		 147 aa  77.4  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>