More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0719 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0719  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
137 aa  280  5.000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00433386  normal  0.504335 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3460  heat shock protein Hsp20  52.59 
 
 
137 aa  160  5.0000000000000005e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.895888  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2958  heat shock protein Hsp20  52.94 
 
 
142 aa  156  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.206888 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1343  HSP20 family protein  54.48 
 
 
135 aa  149  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0793  heat shock protein Hsp20  48.51 
 
 
136 aa  142  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.515708  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2648  heat shock protein Hsp20  46.32 
 
 
137 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3092  HSP20 family protein  45.32 
 
 
138 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2303  heat shock protein Hsp20  47.76 
 
 
137 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  39.84 
 
 
152 aa  102  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  36.09 
 
 
151 aa  98.6  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  36.23 
 
 
147 aa  94.4  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0936  heat shock protein Hsp20  39.84 
 
 
155 aa  93.6  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.172536  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  35.42 
 
 
147 aa  93.6  9e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0454  heat shock protein Hsp20  36.84 
 
 
144 aa  92  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  43.81 
 
 
151 aa  90.5  7e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  38.89 
 
 
150 aa  89.4  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  37.14 
 
 
148 aa  89.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  36.76 
 
 
148 aa  88.6  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  36.03 
 
 
147 aa  87.8  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  36.03 
 
 
147 aa  87.8  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  40.44 
 
 
147 aa  88.2  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  37.96 
 
 
141 aa  87.8  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  39.71 
 
 
147 aa  87  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0357  Hsp20-like molecular chaperone  42.73 
 
 
148 aa  86.7  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  42.59 
 
 
162 aa  85.9  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  39.02 
 
 
134 aa  85.5  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1429  heat shock protein Hsp20  35.46 
 
 
169 aa  85.5  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0315  heat shock protein Hsp20  43.75 
 
 
149 aa  84.7  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  31.94 
 
 
147 aa  84  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  33.85 
 
 
149 aa  84  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3773  heat shock protein Hsp20  38.74 
 
 
148 aa  83.6  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  37.41 
 
 
149 aa  83.6  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  38.97 
 
 
142 aa  83.2  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  32.28 
 
 
195 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  33.06 
 
 
150 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3665  heat shock protein Hsp20  40.37 
 
 
148 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0142367  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0182  heat shock protein Hsp20  41.82 
 
 
149 aa  82  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0138231  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  39.52 
 
 
162 aa  81.6  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  35.61 
 
 
134 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0188  heat shock protein Hsp20  38.06 
 
 
150 aa  81.6  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2462  heat shock protein Hsp20  35.51 
 
 
168 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0466294  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  34.72 
 
 
144 aa  81.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  36.8 
 
 
136 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0622  HSP20 family protein  39.02 
 
 
132 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  40.74 
 
 
162 aa  80.9  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  41.13 
 
 
132 aa  80.9  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0926  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
152 aa  80.5  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  35.2 
 
 
153 aa  79.3  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0463  heat shock protein Hsp20  34.04 
 
 
166 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  35 
 
 
180 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3389  HSP20 family protein  36.57 
 
 
146 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134829  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3428  HSP20 family protein  36.57 
 
 
146 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000574786  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0343  HSP20 family protein  36.57 
 
 
146 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.439722  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2615  HSP20 family protein  36.57 
 
 
146 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696707  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1204  HSP20 family protein  36.57 
 
 
146 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  35.04 
 
 
172 aa  78.6  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3424  HSP20 family protein  36.57 
 
 
146 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2410  HSP20 family protein  40.18 
 
 
149 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.731962  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2802  heat shock protein Hsp20  33.78 
 
 
167 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.20157 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0391  heat shock protein Hsp20  37.61 
 
 
141 aa  78.2  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.854862  normal  0.714918 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
146 aa  77.8  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  33.59 
 
 
156 aa  77.4  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3063  heat shock protein Hsp20  35.1 
 
 
158 aa  77.8  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
146 aa  77.8  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  33.09 
 
 
143 aa  77.4  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  34.31 
 
 
144 aa  77.4  0.00000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4023  heat shock protein Hsp20  33.83 
 
 
147 aa  77  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4119  heat shock protein Hsp20  35.25 
 
 
149 aa  77  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303961 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4061  heat shock protein Hsp20  33.83 
 
 
147 aa  77  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3241  heat shock protein Hsp20  33.07 
 
 
166 aa  77  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.406826  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0756  heat shock protein Hsp20  41.46 
 
 
132 aa  77  0.00000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.16256 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3061  heat shock protein Hsp20  34.44 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  32.61 
 
 
158 aa  75.5  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1730  HSP20 family protein  32.35 
 
 
149 aa  75.5  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.34799  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0539  heat shock protein Hsp20  34.68 
 
 
161 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3076  heat shock protein Hsp20  31.39 
 
 
173 aa  75.9  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1230  heat shock protein Hsp20  31.09 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  36.15 
 
 
146 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  33.82 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  32.33 
 
 
194 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3498  heat shock protein Hsp20  36.15 
 
 
158 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3805  heat shock protein Hsp20  36.15 
 
 
158 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  32.62 
 
 
167 aa  73.9  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  31.69 
 
 
189 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3064  heat shock protein Hsp20  39.62 
 
 
166 aa  73.9  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  31.43 
 
 
189 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  30.88 
 
 
166 aa  73.6  0.0000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4128  heat shock protein Hsp20  31.82 
 
 
154 aa  73.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226976  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1573  heat shock protein Hsp20  32.41 
 
 
173 aa  73.6  0.0000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00130938  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  30.99 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  33.08 
 
 
204 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0296  heat shock protein Hsp20  30.88 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2505  heat shock protein Hsp20  38.68 
 
 
138 aa  73.6  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.239492  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2809  HSP20 family protein  36.5 
 
 
146 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0002171  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1704  heat shock protein Hsp20  38.1 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2250  heat shock protein Hsp20  34.68 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3047  HSP20 family protein  34.56 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1572  HSP20 family protein  34.56 
 
 
215 aa  72  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.537516  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2863  heat shock protein Hsp20  36.19 
 
 
167 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.203152  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0530  HSP20 family protein  34.56 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>