More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3773 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_3773  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
148 aa  304  3e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3665  heat shock protein Hsp20  95.95 
 
 
148 aa  295  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0142367  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0182  heat shock protein Hsp20  83.89 
 
 
149 aa  266  7e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0138231  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2410  HSP20 family protein  80.54 
 
 
149 aa  258  3e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.731962  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0315  heat shock protein Hsp20  71.81 
 
 
149 aa  226  8e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0357  Hsp20-like molecular chaperone  48.98 
 
 
148 aa  137  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  34.9 
 
 
144 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  38.57 
 
 
151 aa  93.6  8e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  36 
 
 
152 aa  91.3  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2042  HSP20 family protein  31.51 
 
 
157 aa  89.4  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 
152 aa  89.4  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1730  HSP20 family protein  36.99 
 
 
149 aa  88.6  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.34799  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0343  HSP20 family protein  36.55 
 
 
146 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.439722  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3428  HSP20 family protein  36.55 
 
 
146 aa  88.2  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000574786  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3389  HSP20 family protein  36.55 
 
 
146 aa  88.2  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134829  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2615  HSP20 family protein  36.55 
 
 
146 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696707  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3424  HSP20 family protein  36.55 
 
 
146 aa  88.2  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1204  HSP20 family protein  36.55 
 
 
146 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1974  heat shock protein Hsp20  32.41 
 
 
145 aa  87.4  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4650  heat shock protein Hsp20  34.72 
 
 
145 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.761162 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3314  HSP20 family protein  34.01 
 
 
151 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.284188 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3084  heat shock protein Hsp20  35.86 
 
 
147 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3430  heat shock protein Hsp20  35.86 
 
 
147 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240603  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  44.23 
 
 
136 aa  85.1  3e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  39.42 
 
 
151 aa  85.1  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1323  heat shock protein Hsp20  31.72 
 
 
148 aa  84.3  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0601396  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  34.46 
 
 
147 aa  84.3  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3375  heat shock protein Hsp20  31.72 
 
 
146 aa  84  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0793  heat shock protein Hsp20  38.1 
 
 
136 aa  83.6  8e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.515708  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4406  heat shock protein Hsp20  33.1 
 
 
146 aa  83.6  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0936  heat shock protein Hsp20  34.42 
 
 
155 aa  83.6  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.172536  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  33.11 
 
 
146 aa  83.6  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  33.11 
 
 
146 aa  83.6  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0719  heat shock protein Hsp20  38.74 
 
 
137 aa  83.6  9e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00433386  normal  0.504335 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2580  putative small heat shock protein, Hsp20-related  32.64 
 
 
145 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  33.78 
 
 
147 aa  82.8  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  35.14 
 
 
142 aa  82  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2055  heat shock protein Hsp20  31.72 
 
 
146 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2958  heat shock protein Hsp20  39.47 
 
 
142 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.206888 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1472  HSP20 family protein  34.01 
 
 
145 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.287102  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0624  HSP20 family protein  34.01 
 
 
145 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3047  HSP20 family protein  34.01 
 
 
145 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1441  HSP20 family protein  34.01 
 
 
145 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1572  HSP20 family protein  34.01 
 
 
215 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.537516  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0530  HSP20 family protein  34.01 
 
 
145 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1247  HSP20 family protein  34.01 
 
 
145 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  33.79 
 
 
141 aa  80.9  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1154  heat shock protein Hsp20  32.19 
 
 
146 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.408789 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1142  heat shock protein Hsp20  31.51 
 
 
146 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4023  heat shock protein Hsp20  32.87 
 
 
147 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5733  heat shock protein Hsp20  31.29 
 
 
146 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.384471  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
147 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  34.9 
 
 
145 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4061  heat shock protein Hsp20  32.87 
 
 
147 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  32.21 
 
 
147 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5262  heat shock protein Hsp20  35.17 
 
 
146 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.100267 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3386  heat shock protein Hsp20  31.25 
 
 
147 aa  79.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
146 aa  78.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6419  heat shock protein Hsp20  33.56 
 
 
147 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6091  heat shock protein Hsp20  33.11 
 
 
146 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6654  heat shock protein Hsp20  33.56 
 
 
147 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344847  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  34.23 
 
 
145 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1235  heat shock protein Hsp20  36.45 
 
 
146 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346981  normal  0.252455 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0782  heat shock protein Hsp20  36.45 
 
 
146 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1263  heat shock protein Hsp20  36.45 
 
 
146 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.095432  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  34.23 
 
 
145 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6388  heat shock protein Hsp20  32.43 
 
 
146 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0687951 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  38.21 
 
 
150 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3076  heat shock protein Hsp20  30.82 
 
 
173 aa  77.8  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0143  heat shock protein Hsp20  30.26 
 
 
156 aa  77.4  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2809  HSP20 family protein  33.79 
 
 
146 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0002171  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6252  heat shock protein Hsp20  33.56 
 
 
147 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0400474  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  35.29 
 
 
158 aa  77  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0403  heat shock protein Hsp20  30.67 
 
 
138 aa  77.4  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  39.81 
 
 
148 aa  77  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  40.19 
 
 
149 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0539  heat shock protein Hsp20  35.37 
 
 
161 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7806  putative small heat-shock protein molecular chaperone  31.69 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00540773  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  38.68 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  33.56 
 
 
148 aa  75.5  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  32.89 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  32.19 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  29.87 
 
 
148 aa  75.5  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2657  heat shock protein Hsp20  31.51 
 
 
155 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.498697  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2612  Hsp20 family heat-shock protein  30.61 
 
 
146 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000112353  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4541  Hsp20 family heat-shock protein  30.61 
 
 
146 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000390119  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  32.41 
 
 
147 aa  74.3  0.0000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  39.42 
 
 
141 aa  74.3  0.0000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  32.41 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0926  heat shock protein Hsp20  35.77 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0891  heat shock protein Hsp20  30.87 
 
 
137 aa  73.9  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.805469  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1429  heat shock protein Hsp20  35.24 
 
 
169 aa  73.9  0.0000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  29.22 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  36.19 
 
 
149 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  30.82 
 
 
143 aa  73.6  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4119  heat shock protein Hsp20  38.32 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303961 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1343  HSP20 family protein  39 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2398  putative heat shock protein  30.41 
 
 
147 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0850393  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1214  molecular chaperone (small heat shock protein)  33.1 
 
 
260 aa  72.4  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.318766  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3092  HSP20 family protein  32.14 
 
 
138 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>