More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1974 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1974  heat shock protein Hsp20  100 
 
 		 145 aa  296  5e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3375  heat shock protein Hsp20  66.9 
 
 		 146 aa  220  6e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1730  HSP20 family protein  53.33 
 
 		 149 aa  167  6e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.34799  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1323  heat shock protein Hsp20  47.1 
 
 		 148 aa  143  8.000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0601396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5262  heat shock protein Hsp20  52.17 
 
 		 146 aa  140  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.100267 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2042  HSP20 family protein  48 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6091  heat shock protein Hsp20  47.52 
 
 		 146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6388  heat shock protein Hsp20  47.52 
 
 		 146 aa  138  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0687951 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4650  heat shock protein Hsp20  50.7 
 
 		 145 aa  138  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.761162 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2398  putative heat shock protein  50 
 
 		 147 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0850393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2612  Hsp20 family heat-shock protein  46.81 
 
 		 146 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000112353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4541  Hsp20 family heat-shock protein  46.81 
 
 		 146 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000390119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2580  putative small heat shock protein, Hsp20-related  46.81 
 
 		 145 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6419  heat shock protein Hsp20  47.62 
 
 		 147 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6654  heat shock protein Hsp20  47.62 
 
 		 147 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3084  heat shock protein Hsp20  46.58 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3430  heat shock protein Hsp20  46.58 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5733  heat shock protein Hsp20  47.52 
 
 		 146 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.384471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5150  heat shock protein Hsp20  46.67 
 
 		 146 aa  130  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3314  HSP20 family protein  42.38 
 
 		 151 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.284188 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6252  heat shock protein Hsp20  46.26 
 
 		 147 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0400474  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3047  HSP20 family protein  45.77 
 
 		 145 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1204  HSP20 family protein  43.84 
 
 		 146 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1441  HSP20 family protein  45.77 
 
 		 145 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3428  HSP20 family protein  43.84 
 
 		 146 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000574786  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3424  HSP20 family protein  43.84 
 
 		 146 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1472  HSP20 family protein  45.77 
 
 		 145 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.287102  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3389  HSP20 family protein  43.84 
 
 		 146 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134829  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2615  HSP20 family protein  43.84 
 
 		 146 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696707  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1247  HSP20 family protein  45.77 
 
 		 145 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0624  HSP20 family protein  45.77 
 
 		 145 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0530  HSP20 family protein  45.77 
 
 		 145 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0343  HSP20 family protein  43.84 
 
 		 146 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.439722  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1572  HSP20 family protein  45.77 
 
 		 215 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.537516  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2055  heat shock protein Hsp20  46.1 
 
 		 146 aa  120  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2809  HSP20 family protein  42.55 
 
 		 146 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0002171  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0782  heat shock protein Hsp20  43.97 
 
 		 146 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1235  heat shock protein Hsp20  43.97 
 
 		 146 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346981  normal  0.252455 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1263  heat shock protein Hsp20  43.97 
 
 		 146 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.095432  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4406  heat shock protein Hsp20  42.55 
 
 		 146 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1142  heat shock protein Hsp20  42.03 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1154  heat shock protein Hsp20  42.03 
 
 		 146 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.408789 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2602  Hsp20 family heat-shock protein  48.15 
 
 		 118 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0249408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3665  heat shock protein Hsp20  33.79 
 
 		 148 aa  90.9  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0142367  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3773  heat shock protein Hsp20  32.41 
 
 		 148 aa  87.4  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  37.86 
 
 		 160 aa  85.5  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  37.86 
 
 		 160 aa  85.5  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0182  heat shock protein Hsp20  32.88 
 
 		 149 aa  83.6  8e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0138231  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2410  HSP20 family protein  33.1 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.731962  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  41.51 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  33.58 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  37.17 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  35 
 
 		 158 aa  80.9  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  33.57 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0315  heat shock protein Hsp20  31.54 
 
 		 149 aa  80.5  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  35.57 
 
 		 148 aa  80.1  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  35.57 
 
 		 148 aa  80.1  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  35.77 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  32.85 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0391  heat shock protein Hsp20  35.9 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.854862  normal  0.714918 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  32.59 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  35.97 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3256  heat shock protein Hsp20  34.75 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  32.41 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  35.78 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0357  Hsp20-like molecular chaperone  31.25 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  34.31 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2683  heat shock protein Hsp20  31.39 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338339  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4157  heat shock protein Hsp20  40.91 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  35.07 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4943  heat shock protein Hsp20  42.53 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0508199 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  34.72 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  33.09 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  33.09 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  28.76 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  33.87 
 
 		 162 aa  70.1  0.000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4467  heat shock protein Hsp20  42.53 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1805  heat shock protein Hsp20  39.77 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal  0.803886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4761  heat shock protein Hsp20  42.53 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.735655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4380  heat shock protein Hsp20  42.53 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.642417  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  31.62 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  34.58 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3074  heat shock protein Hsp20  36.62 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2384  heat shock protein Hsp20  31.43 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0403  heat shock protein Hsp20  29.93 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  28.66 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4669  heat shock protein Hsp20  31.88 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  29.29 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2078  heat shock protein Hsp20  28.38 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  32.86 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  31.62 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  30.32 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  33.09 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  31.25 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0735  heat shock protein Hsp20  30.82 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000037192  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  30.5 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  28.77 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  28.77 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>