More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2612 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2612  Hsp20 family heat-shock protein  100 
 
 
146 aa  295  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000112353  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4541  Hsp20 family heat-shock protein  100 
 
 
146 aa  295  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000390119  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5733  heat shock protein Hsp20  69.86 
 
 
146 aa  215  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.384471  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2398  putative heat shock protein  70.07 
 
 
147 aa  215  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0850393  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6091  heat shock protein Hsp20  69.86 
 
 
146 aa  214  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3084  heat shock protein Hsp20  71.23 
 
 
147 aa  213  5e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3430  heat shock protein Hsp20  71.23 
 
 
147 aa  213  5e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240603  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6388  heat shock protein Hsp20  69.18 
 
 
146 aa  213  8e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0687951 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6252  heat shock protein Hsp20  71.43 
 
 
147 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0400474  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1572  HSP20 family protein  69.18 
 
 
215 aa  210  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.537516  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3047  HSP20 family protein  69.18 
 
 
145 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0624  HSP20 family protein  69.18 
 
 
145 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0530  HSP20 family protein  69.18 
 
 
145 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1247  HSP20 family protein  69.18 
 
 
145 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1441  HSP20 family protein  69.18 
 
 
145 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1472  HSP20 family protein  69.18 
 
 
145 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.287102  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2809  HSP20 family protein  67.81 
 
 
146 aa  208  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0002171  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6419  heat shock protein Hsp20  69.39 
 
 
147 aa  206  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6654  heat shock protein Hsp20  69.39 
 
 
147 aa  206  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344847  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5262  heat shock protein Hsp20  66.44 
 
 
146 aa  205  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.100267 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1204  HSP20 family protein  64.38 
 
 
146 aa  202  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2615  HSP20 family protein  64.38 
 
 
146 aa  202  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696707  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3428  HSP20 family protein  64.38 
 
 
146 aa  202  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000574786  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3424  HSP20 family protein  64.38 
 
 
146 aa  202  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0343  HSP20 family protein  64.38 
 
 
146 aa  202  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.439722  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3389  HSP20 family protein  64.38 
 
 
146 aa  202  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134829  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5150  heat shock protein Hsp20  64.38 
 
 
146 aa  199  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4650  heat shock protein Hsp20  64.63 
 
 
145 aa  191  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.761162 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1235  heat shock protein Hsp20  62.33 
 
 
146 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346981  normal  0.252455 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0782  heat shock protein Hsp20  62.33 
 
 
146 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1263  heat shock protein Hsp20  62.33 
 
 
146 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.095432  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2055  heat shock protein Hsp20  63.01 
 
 
146 aa  187  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2580  putative small heat shock protein, Hsp20-related  63.01 
 
 
145 aa  186  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1142  heat shock protein Hsp20  59.59 
 
 
146 aa  179  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4406  heat shock protein Hsp20  60.27 
 
 
146 aa  178  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1154  heat shock protein Hsp20  58.9 
 
 
146 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.408789 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2602  Hsp20 family heat-shock protein  68.52 
 
 
118 aa  154  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0249408  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1730  HSP20 family protein  48.95 
 
 
149 aa  142  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.34799  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1323  heat shock protein Hsp20  50 
 
 
148 aa  137  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0601396  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1974  heat shock protein Hsp20  46.81 
 
 
145 aa  134  6.0000000000000005e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3375  heat shock protein Hsp20  42.55 
 
 
146 aa  131  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3314  HSP20 family protein  40.97 
 
 
151 aa  120  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.284188 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2042  HSP20 family protein  42.57 
 
 
157 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0391  heat shock protein Hsp20  39.34 
 
 
141 aa  87.4  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.854862  normal  0.714918 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  36.15 
 
 
141 aa  84.7  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  35.97 
 
 
147 aa  84.3  5e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  36.09 
 
 
152 aa  83.6  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0315  heat shock protein Hsp20  33.1 
 
 
149 aa  83.2  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  35.25 
 
 
147 aa  82.8  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  33.57 
 
 
151 aa  80.9  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3256  heat shock protein Hsp20  36.89 
 
 
153 aa  80.1  0.000000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0793  heat shock protein Hsp20  34.78 
 
 
136 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.515708  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2410  HSP20 family protein  33.33 
 
 
149 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.731962  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  35.61 
 
 
149 aa  79  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0182  heat shock protein Hsp20  31.29 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0138231  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  42.06 
 
 
150 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2958  heat shock protein Hsp20  35.66 
 
 
142 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.206888 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3665  heat shock protein Hsp20  30.87 
 
 
148 aa  77  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0142367  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  35.11 
 
 
150 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4157  heat shock protein Hsp20  34.78 
 
 
150 aa  76.3  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4669  heat shock protein Hsp20  32.61 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  37.3 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  34.85 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  37.16 
 
 
158 aa  75.5  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  32.61 
 
 
143 aa  74.7  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  37.93 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3773  heat shock protein Hsp20  30.61 
 
 
148 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2384  heat shock protein Hsp20  33.08 
 
 
164 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  30.94 
 
 
142 aa  74.3  0.0000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  38.32 
 
 
145 aa  73.6  0.0000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  34.56 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  37.86 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  34.81 
 
 
139 aa  72.8  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  33.08 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7806  putative small heat-shock protein molecular chaperone  29.71 
 
 
146 aa  72  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00540773  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  31.16 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6104  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
158 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  40 
 
 
160 aa  72  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  34.17 
 
 
185 aa  72  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
160 aa  72  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  32.33 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2940  heat shock protein Hsp20  35.04 
 
 
168 aa  71.2  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4943  heat shock protein Hsp20  32.61 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0508199 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4467  heat shock protein Hsp20  33.88 
 
 
149 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4761  heat shock protein Hsp20  33.88 
 
 
149 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.735655  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4380  heat shock protein Hsp20  33.88 
 
 
149 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.642417  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3577  heat shock protein Hsp20  31.29 
 
 
157 aa  70.1  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.202692  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  33.96 
 
 
151 aa  69.3  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  32.14 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  32.14 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  33.78 
 
 
148 aa  68.6  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4382  heat shock protein Hsp20  32.54 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  34.03 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2462  heat shock protein Hsp20  33.99 
 
 
168 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0466294  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4514  heat shock protein Hsp20  32.54 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.165488  normal  0.480818 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  38.4 
 
 
166 aa  68.9  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0609  heat shock protein Hsp20  32.61 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.346897  normal  0.0142886 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  29.71 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  35.48 
 
 
176 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>