More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3084 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_3084  heat shock protein Hsp20  100 
 
 		 147 aa  296  7e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3430  heat shock protein Hsp20  100 
 
 		 147 aa  296  7e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3389  HSP20 family protein  78.08 
 
 		 146 aa  235  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134829  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1204  HSP20 family protein  78.08 
 
 		 146 aa  235  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3428  HSP20 family protein  78.08 
 
 		 146 aa  235  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000574786  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0343  HSP20 family protein  78.08 
 
 		 146 aa  235  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.439722  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2615  HSP20 family protein  78.08 
 
 		 146 aa  235  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696707  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3424  HSP20 family protein  78.08 
 
 		 146 aa  235  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6252  heat shock protein Hsp20  77.55 
 
 		 147 aa  229  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0400474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6419  heat shock protein Hsp20  76.19 
 
 		 147 aa  227  5e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6654  heat shock protein Hsp20  76.19 
 
 		 147 aa  227  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2612  Hsp20 family heat-shock protein  71.23 
 
 		 146 aa  213  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000112353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4541  Hsp20 family heat-shock protein  71.23 
 
 		 146 aa  213  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000390119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6091  heat shock protein Hsp20  69.86 
 
 		 146 aa  213  8e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2809  HSP20 family protein  68.49 
 
 		 146 aa  211  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0002171  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6388  heat shock protein Hsp20  69.18 
 
 		 146 aa  211  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0687951 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3047  HSP20 family protein  67.81 
 
 		 145 aa  207  5e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1572  HSP20 family protein  67.81 
 
 		 215 aa  207  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.537516  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1472  HSP20 family protein  67.81 
 
 		 145 aa  207  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.287102  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1441  HSP20 family protein  67.81 
 
 		 145 aa  207  5e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0530  HSP20 family protein  67.81 
 
 		 145 aa  207  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1247  HSP20 family protein  67.81 
 
 		 145 aa  207  5e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0624  HSP20 family protein  67.81 
 
 		 145 aa  207  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5733  heat shock protein Hsp20  66.44 
 
 		 146 aa  205  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.384471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5262  heat shock protein Hsp20  65.07 
 
 		 146 aa  205  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.100267 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2398  putative heat shock protein  66.67 
 
 		 147 aa  205  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0850393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2580  putative small heat shock protein, Hsp20-related  66.22 
 
 		 145 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5150  heat shock protein Hsp20  65.07 
 
 		 146 aa  197  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4650  heat shock protein Hsp20  61.22 
 
 		 145 aa  188  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.761162 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1235  heat shock protein Hsp20  63.01 
 
 		 146 aa  189  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346981  normal  0.252455 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0782  heat shock protein Hsp20  63.01 
 
 		 146 aa  189  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1263  heat shock protein Hsp20  63.01 
 
 		 146 aa  189  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.095432  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2055  heat shock protein Hsp20  63.01 
 
 		 146 aa  186  9e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1142  heat shock protein Hsp20  61.64 
 
 		 146 aa  184  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1154  heat shock protein Hsp20  60.96 
 
 		 146 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.408789 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4406  heat shock protein Hsp20  61.64 
 
 		 146 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2602  Hsp20 family heat-shock protein  70.37 
 
 		 118 aa  157  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0249408  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1730  HSP20 family protein  51.7 
 
 		 149 aa  154  3e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.34799  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1323  heat shock protein Hsp20  49.28 
 
 		 148 aa  138  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0601396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1974  heat shock protein Hsp20  46.58 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2042  HSP20 family protein  50 
 
 		 157 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3375  heat shock protein Hsp20  45.07 
 
 		 146 aa  130  7.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3314  HSP20 family protein  42.57 
 
 		 151 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.284188 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0391  heat shock protein Hsp20  40.65 
 
 		 141 aa  97.4  5e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.854862  normal  0.714918 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0315  heat shock protein Hsp20  36.73 
 
 		 149 aa  96.7  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0182  heat shock protein Hsp20  35.86 
 
 		 149 aa  92.8  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0138231  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2410  HSP20 family protein  35.17 
 
 		 149 aa  90.9  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.731962  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 		 151 aa  90.9  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3665  heat shock protein Hsp20  36.55 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0142367  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  39.09 
 
 		 141 aa  87  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  34.72 
 
 		 151 aa  86.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3773  heat shock protein Hsp20  35.86 
 
 		 148 aa  85.5  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4157  heat shock protein Hsp20  37.14 
 
 		 150 aa  85.1  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  35.82 
 
 		 143 aa  85.1  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0609  heat shock protein Hsp20  39.13 
 
 		 156 aa  84  7e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.346897  normal  0.0142886 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4669  heat shock protein Hsp20  35.97 
 
 		 147 aa  83.6  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  36.5 
 
 		 152 aa  83.6  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4943  heat shock protein Hsp20  35.77 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0508199 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0793  heat shock protein Hsp20  34.78 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.515708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  42.06 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7806  putative small heat-shock protein molecular chaperone  34.9 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00540773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2384  heat shock protein Hsp20  36.17 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3577  heat shock protein Hsp20  34.48 
 
 		 157 aa  80.1  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.202692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  34.53 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3256  heat shock protein Hsp20  34.96 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  39.72 
 
 		 173 aa  80.1  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  38.13 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4380  heat shock protein Hsp20  38.68 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.642417  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4761  heat shock protein Hsp20  38.68 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.735655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4467  heat shock protein Hsp20  38.68 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  37.59 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  33.58 
 
 		 153 aa  77  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  37.74 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  39.45 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  33.59 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0179  heat shock protein Hsp20  31.69 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  35.25 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  35.25 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4310  heat shock protein Hsp20  38.03 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4550  heat shock protein Hsp20  38.03 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  35.82 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  38.53 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3573  heat shock protein Hsp20  34.72 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  36.17 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2958  heat shock protein Hsp20  30.22 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.206888 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  36.09 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  34.06 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6104  heat shock protein Hsp20  35.34 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0843  heat shock protein Hsp20  34.04 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.505886  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  36.43 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1805  heat shock protein Hsp20  31.65 
 
 		 149 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal  0.803886 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  36.09 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0926  heat shock protein Hsp20  36.96 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  35 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  36.11 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  34.91 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  34.33 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0183  heat shock protein Hsp20  35.85 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0939501  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 		 167 aa  71.6  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.754957 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>