More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3577 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3577  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
157 aa  320  3e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.202692  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0675  heat shock protein Hsp20  43.24 
 
 
163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000000558694  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  41.03 
 
 
149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  40.25 
 
 
153 aa  107  8.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3074  heat shock protein Hsp20  42.57 
 
 
144 aa  101  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0672  heat shock protein Hsp20  34.84 
 
 
159 aa  95.1  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000109595  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  32.41 
 
 
147 aa  90.5  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  34.62 
 
 
230 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  30.34 
 
 
147 aa  89.4  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  32.19 
 
 
151 aa  87  8e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  30.34 
 
 
147 aa  84.3  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  33.55 
 
 
146 aa  82.4  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  33.55 
 
 
146 aa  82.4  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  31.58 
 
 
162 aa  82  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2118  heat shock protein Hsp20  41.04 
 
 
166 aa  80.9  0.000000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  36.18 
 
 
185 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  36.18 
 
 
185 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3084  heat shock protein Hsp20  34.48 
 
 
147 aa  80.1  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3430  heat shock protein Hsp20  34.48 
 
 
147 aa  80.1  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240603  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  35.34 
 
 
153 aa  79  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  36.81 
 
 
145 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
151 aa  79  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4310  heat shock protein Hsp20  33.79 
 
 
166 aa  77.4  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4550  heat shock protein Hsp20  33.79 
 
 
166 aa  77.4  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3428  HSP20 family protein  32.14 
 
 
146 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000574786  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0343  HSP20 family protein  32.14 
 
 
146 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.439722  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1204  HSP20 family protein  32.14 
 
 
146 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2615  HSP20 family protein  32.14 
 
 
146 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696707  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3389  HSP20 family protein  32.14 
 
 
146 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134829  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0179  heat shock protein Hsp20  33.58 
 
 
149 aa  77  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6419  heat shock protein Hsp20  33.1 
 
 
147 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3424  HSP20 family protein  32.14 
 
 
146 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6654  heat shock protein Hsp20  33.1 
 
 
147 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344847  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  30.52 
 
 
151 aa  76.6  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  30.52 
 
 
151 aa  76.6  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1805  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
149 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal  0.803886 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0609  heat shock protein Hsp20  39.81 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.346897  normal  0.0142886 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5150  heat shock protein Hsp20  32.65 
 
 
146 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
146 aa  75.9  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2940  heat shock protein Hsp20  39.25 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5733  heat shock protein Hsp20  29.66 
 
 
146 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.384471  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6252  heat shock protein Hsp20  32.39 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0400474  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  31.79 
 
 
148 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  30.56 
 
 
162 aa  74.7  0.0000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  32.37 
 
 
150 aa  74.7  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  36.21 
 
 
148 aa  74.7  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  30.56 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  35.58 
 
 
150 aa  74.3  0.0000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  35.33 
 
 
162 aa  73.9  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2809  HSP20 family protein  32.86 
 
 
146 aa  73.9  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0002171  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5291  heat shock protein Hsp20  35.76 
 
 
199 aa  73.6  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.060881  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1323  heat shock protein Hsp20  32.37 
 
 
148 aa  73.6  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0601396  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  37.74 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3739  heat shock protein Hsp20  37.86 
 
 
182 aa  72.4  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0809036 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  36.79 
 
 
139 aa  72.8  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  35.78 
 
 
184 aa  72.8  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  30.46 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1235  heat shock protein Hsp20  35 
 
 
146 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346981  normal  0.252455 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  34.33 
 
 
145 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1743  heat shock protein Hsp20  34.34 
 
 
145 aa  72  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.49982  normal  0.0110244 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0782  heat shock protein Hsp20  35 
 
 
146 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1263  heat shock protein Hsp20  35 
 
 
146 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.095432  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2086  heat shock protein, Hsp20 family  34.34 
 
 
145 aa  72  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  27.59 
 
 
149 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  31.29 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  31.58 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3336  heat shock protein Hsp20  32.52 
 
 
191 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  33.08 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  36.03 
 
 
158 aa  70.9  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4669  heat shock protein Hsp20  35.29 
 
 
147 aa  70.9  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2505  heat shock protein Hsp20  39.05 
 
 
138 aa  70.9  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.239492  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  31.13 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  34.33 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  32.89 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  27.59 
 
 
148 aa  70.9  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  36.79 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  31.58 
 
 
147 aa  70.9  0.000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4650  heat shock protein Hsp20  30.77 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.761162 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0267  heat shock protein Hsp20  41.03 
 
 
148 aa  70.9  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.216974 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0257  heat shock protein Hsp20  41.03 
 
 
148 aa  70.9  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0247  heat shock protein Hsp20  41.03 
 
 
148 aa  70.9  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1214  molecular chaperone (small heat shock protein)  28.97 
 
 
260 aa  70.5  0.000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.318766  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  31.88 
 
 
169 aa  70.5  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2055  heat shock protein Hsp20  35 
 
 
146 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0540  heat shock protein Hsp20  31.06 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2612  Hsp20 family heat-shock protein  31.29 
 
 
146 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000112353  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4541  Hsp20 family heat-shock protein  31.29 
 
 
146 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000390119  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2683  heat shock protein Hsp20  37.78 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338339  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0391  heat shock protein Hsp20  35.24 
 
 
141 aa  70.1  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.854862  normal  0.714918 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
166 aa  69.7  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4230  heat shock protein Hsp20  39.78 
 
 
105 aa  70.5  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  30.34 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  30.34 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1706  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
132 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00808314  hitchhiker  0.000432661 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  33.58 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6091  heat shock protein Hsp20  31.21 
 
 
146 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0306  heat shock protein Hsp20  36.45 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0420324 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6388  heat shock protein Hsp20  31.21 
 
 
146 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0687951 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4943  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0508199 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>