More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6252 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6252  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
147 aa  296  6e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0400474  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6419  heat shock protein Hsp20  96.6 
 
 
147 aa  288  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6654  heat shock protein Hsp20  96.6 
 
 
147 aa  288  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344847  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3084  heat shock protein Hsp20  77.55 
 
 
147 aa  229  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3430  heat shock protein Hsp20  77.55 
 
 
147 aa  229  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240603  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2612  Hsp20 family heat-shock protein  71.43 
 
 
146 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000112353  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4541  Hsp20 family heat-shock protein  71.43 
 
 
146 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000390119  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6091  heat shock protein Hsp20  67.79 
 
 
146 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3389  HSP20 family protein  70.07 
 
 
146 aa  209  7e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134829  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1204  HSP20 family protein  70.07 
 
 
146 aa  209  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3428  HSP20 family protein  70.07 
 
 
146 aa  209  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000574786  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3424  HSP20 family protein  70.07 
 
 
146 aa  209  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2615  HSP20 family protein  70.07 
 
 
146 aa  209  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696707  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0343  HSP20 family protein  70.07 
 
 
146 aa  209  7e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.439722  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6388  heat shock protein Hsp20  67.11 
 
 
146 aa  209  9e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0687951 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2398  putative heat shock protein  63.27 
 
 
147 aa  207  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0850393  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3047  HSP20 family protein  65.31 
 
 
145 aa  200  6e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0624  HSP20 family protein  65.31 
 
 
145 aa  200  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1247  HSP20 family protein  65.31 
 
 
145 aa  200  6e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1472  HSP20 family protein  65.31 
 
 
145 aa  200  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.287102  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1441  HSP20 family protein  65.31 
 
 
145 aa  200  6e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0530  HSP20 family protein  65.31 
 
 
145 aa  200  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1572  HSP20 family protein  65.31 
 
 
215 aa  199  8e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.537516  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5733  heat shock protein Hsp20  63.95 
 
 
146 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.384471  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5150  heat shock protein Hsp20  65.1 
 
 
146 aa  197  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2809  HSP20 family protein  64.63 
 
 
146 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0002171  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5262  heat shock protein Hsp20  63.95 
 
 
146 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.100267 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2580  putative small heat shock protein, Hsp20-related  61.49 
 
 
145 aa  192  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2055  heat shock protein Hsp20  63.95 
 
 
146 aa  189  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4650  heat shock protein Hsp20  61.33 
 
 
145 aa  186  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.761162 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1142  heat shock protein Hsp20  62.59 
 
 
146 aa  184  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1154  heat shock protein Hsp20  61.9 
 
 
146 aa  181  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.408789 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1235  heat shock protein Hsp20  61.9 
 
 
146 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346981  normal  0.252455 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0782  heat shock protein Hsp20  61.9 
 
 
146 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1263  heat shock protein Hsp20  61.9 
 
 
146 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.095432  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4406  heat shock protein Hsp20  60.54 
 
 
146 aa  177  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2602  Hsp20 family heat-shock protein  66.67 
 
 
118 aa  153  8e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0249408  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1730  HSP20 family protein  50.69 
 
 
149 aa  142  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.34799  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1974  heat shock protein Hsp20  46.26 
 
 
145 aa  128  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3314  HSP20 family protein  42.28 
 
 
151 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.284188 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3375  heat shock protein Hsp20  44.06 
 
 
146 aa  121  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1323  heat shock protein Hsp20  45.71 
 
 
148 aa  118  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0601396  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2042  HSP20 family protein  42.57 
 
 
157 aa  118  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0391  heat shock protein Hsp20  43.9 
 
 
141 aa  99  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.854862  normal  0.714918 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  37.16 
 
 
141 aa  87.8  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0609  heat shock protein Hsp20  38.81 
 
 
156 aa  86.3  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.346897  normal  0.0142886 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  35.25 
 
 
151 aa  84.3  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4943  heat shock protein Hsp20  36.96 
 
 
149 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0508199 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  38.1 
 
 
143 aa  84  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4157  heat shock protein Hsp20  38.73 
 
 
150 aa  84  7e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0315  heat shock protein Hsp20  35.14 
 
 
149 aa  84  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4380  heat shock protein Hsp20  36.96 
 
 
149 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.642417  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4761  heat shock protein Hsp20  36.96 
 
 
149 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.735655  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4467  heat shock protein Hsp20  36.96 
 
 
149 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4669  heat shock protein Hsp20  36.43 
 
 
147 aa  82.8  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  34.33 
 
 
152 aa  81.6  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  34.69 
 
 
147 aa  81.3  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2410  HSP20 family protein  36.3 
 
 
149 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.731962  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  34.69 
 
 
147 aa  80.9  0.000000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0182  heat shock protein Hsp20  34.93 
 
 
149 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0138231  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3665  heat shock protein Hsp20  34.25 
 
 
148 aa  80.1  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0142367  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2384  heat shock protein Hsp20  35.82 
 
 
164 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6104  heat shock protein Hsp20  35.04 
 
 
158 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3256  heat shock protein Hsp20  35.61 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7806  putative small heat-shock protein molecular chaperone  34.53 
 
 
146 aa  77.8  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00540773  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  37.96 
 
 
151 aa  77.4  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3773  heat shock protein Hsp20  33.56 
 
 
148 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1805  heat shock protein Hsp20  33.81 
 
 
149 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal  0.803886 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  34.72 
 
 
143 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  40.74 
 
 
150 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  34.27 
 
 
146 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3577  heat shock protein Hsp20  32.39 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.202692  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0843  heat shock protein Hsp20  38.03 
 
 
144 aa  74.7  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.505886  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  36.57 
 
 
144 aa  74.7  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  34.78 
 
 
171 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0357  Hsp20-like molecular chaperone  37.74 
 
 
148 aa  74.3  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  36.62 
 
 
148 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2063  heat shock protein Hsp20  34.29 
 
 
155 aa  73.6  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.21571  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  32.59 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  38.39 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0179  heat shock protein Hsp20  34.11 
 
 
149 aa  72.4  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  31.82 
 
 
150 aa  72  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  35.14 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3573  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
165 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16210  heat shock protein Hsp20  35 
 
 
163 aa  70.9  0.000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221164  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2462  heat shock protein Hsp20  35.62 
 
 
168 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0466294  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
143 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  33.91 
 
 
153 aa  70.1  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  32.41 
 
 
153 aa  70.1  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0793  heat shock protein Hsp20  30.94 
 
 
136 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.515708  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  34.55 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  34.51 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  36.03 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1289  Molecular chaperone (small heat shock protein)- like protein  33.57 
 
 
148 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  36.13 
 
 
166 aa  69.3  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  31.58 
 
 
173 aa  68.9  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  31.94 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  31.69 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>